MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack chromosome

Total Repeats: 24412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017058	GTA	2	6	23473	23478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500951
502	NC_017058	TTA	2	6	23483	23488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500951
503	NC_017058	TTTA	2	8	23512	23519	25 %	75 %	0 %	0 %	383500951
504	NC_017058	ATATA	2	10	23553	23562	60 %	40 %	0 %	0 %	383500951
505	NC_017058	AGC	2	6	23578	23583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383500951
506	NC_017058	AAAT	2	8	23616	23623	75 %	25 %	0 %	0 %	383500951
507	NC_017058	ATC	2	6	23627	23632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500951
508	NC_017058	GCA	2	6	23651	23656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383500951
509	NC_017058	TACT	2	8	23664	23671	25 %	50 %	0 %	25 %	383500951
510	NC_017058	ATC	2	6	23678	23683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500951
511	NC_017058	T	6	6	24620	24625	0 %	100 %	0 %	0 %	383500952
512	NC_017058	CTT	2	6	24671	24676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500952
513	NC_017058	CTA	2	6	24682	24687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500952
514	NC_017058	ACAT	2	8	24691	24698	50 %	25 %	0 %	25 %	383500952
515	NC_017058	AGT	2	6	24710	24715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500952
516	NC_017058	AAT	2	6	24789	24794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500952
517	NC_017058	CTT	2	6	24859	24864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500952
518	NC_017058	TCAA	2	8	24868	24875	50 %	25 %	0 %	25 %	383500952
519	NC_017058	ATA	2	6	24912	24917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500952
520	NC_017058	TAAT	2	8	24920	24927	50 %	50 %	0 %	0 %	383500952
521	NC_017058	TAA	2	6	24992	24997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500952
522	NC_017058	A	7	7	25014	25020	100 %	0 %	0 %	0 %	383500952
523	NC_017058	TAT	2	6	25070	25075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500952
524	NC_017058	TATT	2	8	25085	25092	25 %	75 %	0 %	0 %	383500952
525	NC_017058	GATTT	2	10	25155	25164	20 %	60 %	20 %	0 %	383500952
526	NC_017058	TGA	2	6	25195	25200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500952
527	NC_017058	T	6	6	25227	25232	0 %	100 %	0 %	0 %	383500952
528	NC_017058	ATT	2	6	25233	25238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500952
529	NC_017058	ATT	2	6	25251	25256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500952
530	NC_017058	CTT	2	6	25830	25835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500953
531	NC_017058	ACC	2	6	25840	25845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383500953
532	NC_017058	GAAA	2	8	25846	25853	75 %	0 %	25 %	0 %	383500953
533	NC_017058	TTA	2	6	25868	25873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500953
534	NC_017058	GATT	2	8	25895	25902	25 %	50 %	25 %	0 %	383500953
535	NC_017058	TAC	2	6	25903	25908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500953
536	NC_017058	ATT	2	6	26083	26088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500954
537	NC_017058	T	7	7	26087	26093	0 %	100 %	0 %	0 %	383500954
538	NC_017058	ATC	2	6	26127	26132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500954
539	NC_017058	AT	3	6	26143	26148	50 %	50 %	0 %	0 %	383500954
540	NC_017058	ACC	2	6	26157	26162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383500954
541	NC_017058	TCT	2	6	26268	26273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500954
542	NC_017058	TTG	2	6	26299	26304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383500954
543	NC_017058	GAA	2	6	26443	26448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383500955
544	NC_017058	CAAGC	2	10	26488	26497	40 %	0 %	20 %	40 %	383500955
545	NC_017058	ACT	2	6	26554	26559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500955
546	NC_017058	AAT	2	6	26565	26570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500955
547	NC_017058	TAT	2	6	26580	26585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500955
548	NC_017058	ATC	2	6	26586	26591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500955
549	NC_017058	ATT	2	6	26647	26652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500955
550	NC_017058	ATA	2	6	26657	26662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500955
551	NC_017058	TAC	2	6	26757	26762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500956
552	NC_017058	CTT	2	6	26799	26804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500956
553	NC_017058	T	6	6	26811	26816	0 %	100 %	0 %	0 %	383500956
554	NC_017058	ATCAT	2	10	26825	26834	40 %	40 %	0 %	20 %	383500956
555	NC_017058	CTT	2	6	26865	26870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500956
556	NC_017058	TAAT	2	8	26880	26887	50 %	50 %	0 %	0 %	383500956
557	NC_017058	TCA	2	6	26933	26938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500956
558	NC_017058	TAC	2	6	26958	26963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500956
559	NC_017058	T	6	6	26988	26993	0 %	100 %	0 %	0 %	383500956
560	NC_017058	TCC	2	6	26998	27003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383500956
561	NC_017058	TCTT	2	8	27086	27093	0 %	75 %	0 %	25 %	383500956
562	NC_017058	T	6	6	27100	27105	0 %	100 %	0 %	0 %	383500956
563	NC_017058	AAT	2	6	27146	27151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500956
564	NC_017058	CTA	2	6	27272	27277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500957
565	NC_017058	TTAA	2	8	27283	27290	50 %	50 %	0 %	0 %	383500957
566	NC_017058	T	6	6	27340	27345	0 %	100 %	0 %	0 %	383500957
567	NC_017058	TA	3	6	27392	27397	50 %	50 %	0 %	0 %	383500957
568	NC_017058	AATTTT	2	12	27405	27416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500957
569	NC_017058	A	6	6	27673	27678	100 %	0 %	0 %	0 %	383500958
570	NC_017058	TTA	2	6	27687	27692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500958
571	NC_017058	AAT	2	6	27693	27698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500958
572	NC_017058	TTA	2	6	27702	27707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500958
573	NC_017058	AGA	2	6	27718	27723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383500958
574	NC_017058	TAC	2	6	27727	27732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500958
575	NC_017058	AAT	2	6	27777	27782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500958
576	NC_017058	TTA	2	6	27798	27803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500958
577	NC_017058	ATA	2	6	27809	27814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500958
578	NC_017058	TA	3	6	27915	27920	50 %	50 %	0 %	0 %	383500958
579	NC_017058	CTA	2	6	27924	27929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500958
580	NC_017058	ATA	2	6	27941	27946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500958
581	NC_017058	ACAAG	2	10	27968	27977	60 %	0 %	20 %	20 %	383500958
582	NC_017058	TAA	2	6	27984	27989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500958
583	NC_017058	TA	3	6	28044	28049	50 %	50 %	0 %	0 %	383500958
584	NC_017058	GCG	2	6	28091	28096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383500958
585	NC_017058	CT	3	6	28150	28155	0 %	50 %	0 %	50 %	383500958
586	NC_017058	TAC	3	9	28168	28176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500958
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589	NC_017058	CAA	2	6	28266	28271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383500958
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591	NC_017058	TTA	2	6	28338	28343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500958
592	NC_017058	GCA	2	6	28355	28360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383500958
593	NC_017058	TAA	2	6	28435	28440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500958
594	NC_017058	CTA	2	6	28678	28683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500959
595	NC_017058	AAT	2	6	28748	28753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500959
596	NC_017058	GGT	2	6	28795	28800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383500959
597	NC_017058	CTA	2	6	28844	28849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500959
598	NC_017058	TAA	2	6	28868	28873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500959
599	NC_017058	AGC	2	6	29070	29075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383500959
600	NC_017058	GCC	2	6	29121	29126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383500959
601	NC_017058	GCTT	2	8	29139	29146	0 %	50 %	25 %	25 %	383500959
602	NC_017058	AT	3	6	29245	29250	50 %	50 %	0 %	0 %	383500959
603	NC_017058	TAA	2	6	29268	29273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500959
604	NC_017058	TCA	2	6	29302	29307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383500959
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607	NC_017058	CTCC	2	8	29525	29532	0 %	25 %	0 %	75 %	383500959
608	NC_017058	A	7	7	29547	29553	100 %	0 %	0 %	0 %	383500959
609	NC_017058	TCT	2	6	29566	29571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500959
610	NC_017058	CAG	2	6	29624	29629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383500959
611	NC_017058	TAA	2	6	29661	29666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500959
612	NC_017058	ATT	2	6	29673	29678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500959
613	NC_017058	T	6	6	29677	29682	0 %	100 %	0 %	0 %	383500959
614	NC_017058	AT	3	6	29690	29695	50 %	50 %	0 %	0 %	383500959
615	NC_017058	ATT	2	6	30876	30881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500960
616	NC_017058	AGTT	2	8	30948	30955	25 %	50 %	25 %	0 %	383500960
617	NC_017058	TGA	2	6	30969	30974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500960
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619	NC_017058	TGA	2	6	30993	30998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500960
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621	NC_017058	ATG	2	6	31019	31024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500960
622	NC_017058	TTC	2	6	31794	31799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383500961
623	NC_017058	GAT	2	6	31890	31895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500961
624	NC_017058	CATG	2	8	31950	31957	25 %	25 %	25 %	25 %	383500961
625	NC_017058	GCT	2	6	32017	32022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383500961
626	NC_017058	A	6	6	32080	32085	100 %	0 %	0 %	0 %	383500961
627	NC_017058	GTA	2	6	32086	32091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500961
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