MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack chromosome

Total Repeats: 24412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017058	TGC	2	6	240370	240375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501156
4502	NC_017058	TAT	3	9	240379	240387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501156
4503	NC_017058	TAT	2	6	240400	240405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501156
4504	NC_017058	AATA	2	8	240477	240484	75 %	25 %	0 %	0 %	383501156
4505	NC_017058	TTA	2	6	240548	240553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501156
4506	NC_017058	TTTC	2	8	240558	240565	0 %	75 %	0 %	25 %	383501156
4507	NC_017058	ATT	2	6	240574	240579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501156
4508	NC_017058	AAT	2	6	240697	240702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501156
4509	NC_017058	AAG	2	6	240741	240746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501156
4510	NC_017058	TAG	2	6	240753	240758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501156
4511	NC_017058	TAAA	2	8	240850	240857	75 %	25 %	0 %	0 %	383501156
4512	NC_017058	ATA	2	6	240909	240914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501156
4513	NC_017058	TTA	2	6	240915	240920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501156
4514	NC_017058	CAT	3	9	240988	240996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501156
4515	NC_017058	GTT	2	6	240998	241003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501156
4516	NC_017058	ACT	2	6	241007	241012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501156
4517	NC_017058	GCT	2	6	241094	241099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501156
4518	NC_017058	A	8	8	241138	241145	100 %	0 %	0 %	0 %	383501156
4519	NC_017058	AAG	2	6	241153	241158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501156
4520	NC_017058	AAC	2	6	241217	241222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383501156
4521	NC_017058	CTT	2	6	241253	241258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501156
4522	NC_017058	AT	3	6	241418	241423	50 %	50 %	0 %	0 %	383501157
4523	NC_017058	GTTT	2	8	241471	241478	0 %	75 %	25 %	0 %	383501157
4524	NC_017058	T	7	7	241476	241482	0 %	100 %	0 %	0 %	383501157
4525	NC_017058	ATT	2	6	241575	241580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501157
4526	NC_017058	CCA	2	6	241735	241740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383501157
4527	NC_017058	ATA	2	6	241780	241785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501157
4528	NC_017058	TTA	2	6	241787	241792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501157
4529	NC_017058	AAT	2	6	241841	241846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501157
4530	NC_017058	TA	3	6	241899	241904	50 %	50 %	0 %	0 %	383501157
4531	NC_017058	AAC	2	6	241905	241910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383501157
4532	NC_017058	CCA	2	6	241984	241989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383501157
4533	NC_017058	AGGT	2	8	242028	242035	25 %	25 %	50 %	0 %	383501157
4534	NC_017058	CCG	2	6	242077	242082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383501157
4535	NC_017058	AAT	2	6	242418	242423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501158
4536	NC_017058	TCA	2	6	242436	242441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501158
4537	NC_017058	ATT	2	6	242519	242524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501158
4538	NC_017058	TAA	2	6	242540	242545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501158
4539	NC_017058	AT	3	6	242643	242648	50 %	50 %	0 %	0 %	383501158
4540	NC_017058	TAC	2	6	242653	242658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501158
4541	NC_017058	ACT	2	6	242709	242714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501158
4542	NC_017058	TTCG	2	8	242737	242744	0 %	50 %	25 %	25 %	383501158
4543	NC_017058	GTT	2	6	242772	242777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501158
4544	NC_017058	T	7	7	242797	242803	0 %	100 %	0 %	0 %	383501158
4545	NC_017058	TTTA	2	8	242861	242868	25 %	75 %	0 %	0 %	383501158
4546	NC_017058	AT	3	6	242999	243004	50 %	50 %	0 %	0 %	383501159
4547	NC_017058	A	6	6	243035	243040	100 %	0 %	0 %	0 %	383501159
4548	NC_017058	TGT	2	6	243071	243076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501159
4549	NC_017058	TCT	2	6	243105	243110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501159
4550	NC_017058	GCAATT	2	12	243237	243248	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383501159
4551	NC_017058	ACT	2	6	243258	243263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501159
4552	NC_017058	TTA	2	6	243321	243326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501159
4553	NC_017058	TGA	2	6	243551	243556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501159
4554	NC_017058	ATA	2	6	243586	243591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501159
4555	NC_017058	AG	3	6	243656	243661	50 %	0 %	50 %	0 %	383501159
4556	NC_017058	A	8	8	243735	243742	100 %	0 %	0 %	0 %	383501159
4557	NC_017058	TCTTT	2	10	243817	243826	0 %	80 %	0 %	20 %	383501159
4558	NC_017058	AATT	2	8	243892	243899	50 %	50 %	0 %	0 %	383501159
4559	NC_017058	GTA	2	6	243949	243954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501159
4560	NC_017058	TCT	2	6	243957	243962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501159
4561	NC_017058	TAA	2	6	244084	244089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501159
4562	NC_017058	ATA	2	6	244122	244127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501159
4563	NC_017058	AGA	2	6	244199	244204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501159
4564	NC_017058	GCTA	2	8	244205	244212	25 %	25 %	25 %	25 %	383501159
4565	NC_017058	CTGC	2	8	244237	244244	0 %	25 %	25 %	50 %	383501159
4566	NC_017058	AGT	2	6	244307	244312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501159
4567	NC_017058	CAA	2	6	244335	244340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383501159
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4569	NC_017058	TAAA	2	8	244366	244373	75 %	25 %	0 %	0 %	383501159
4570	NC_017058	ATT	2	6	244379	244384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501159
4571	NC_017058	GA	3	6	244416	244421	50 %	0 %	50 %	0 %	383501159
4572	NC_017058	TGA	2	6	244559	244564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501159
4573	NC_017058	ATA	2	6	244591	244596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501159
4574	NC_017058	GAA	2	6	244665	244670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501159
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4577	NC_017058	GAA	2	6	244755	244760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501159
4578	NC_017058	GAA	2	6	244773	244778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501159
4579	NC_017058	GTC	2	6	244804	244809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501159
4580	NC_017058	ATA	2	6	244849	244854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501159
4581	NC_017058	CAA	2	6	244883	244888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383501159
4582	NC_017058	TGA	2	6	244969	244974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501159
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4584	NC_017058	AT	3	6	245063	245068	50 %	50 %	0 %	0 %	383501159
4585	NC_017058	AATC	2	8	245088	245095	50 %	25 %	0 %	25 %	383501159
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4587	NC_017058	AAATA	2	10	245353	245362	80 %	20 %	0 %	0 %	383501159
4588	NC_017058	TGA	3	9	245389	245397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501159
4589	NC_017058	AGA	2	6	245402	245407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501159
4590	NC_017058	T	6	6	245418	245423	0 %	100 %	0 %	0 %	383501159
4591	NC_017058	CTA	2	6	245503	245508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501159
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4593	NC_017058	TA	3	6	245583	245588	50 %	50 %	0 %	0 %	383501159
4594	NC_017058	TGA	2	6	245591	245596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501159
4595	NC_017058	CGA	2	6	245618	245623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501159
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4601	NC_017058	TGC	2	6	245795	245800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501159
4602	NC_017058	GTG	3	9	245867	245875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383501160
4603	NC_017058	AAGT	2	8	245893	245900	50 %	25 %	25 %	0 %	383501160
4604	NC_017058	T	6	6	245988	245993	0 %	100 %	0 %	0 %	383501160
4605	NC_017058	TAAA	2	8	246001	246008	75 %	25 %	0 %	0 %	383501160
4606	NC_017058	TAA	2	6	246058	246063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501160
4607	NC_017058	CTG	2	6	246077	246082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501160
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4609	NC_017058	ATT	2	6	246134	246139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501160
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4611	NC_017058	T	7	7	246287	246293	0 %	100 %	0 %	0 %	383501160
4612	NC_017058	TGG	2	6	246415	246420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383501160
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4619	NC_017058	GAT	2	6	246536	246541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501160
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4621	NC_017058	AT	3	6	247005	247010	50 %	50 %	0 %	0 %	383501161
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4623	NC_017058	ATT	2	6	247108	247113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501161
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4969	NC_017058	TACCGG	2	12	263215	263226	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383501174
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4979	NC_017058	ACTTT	2	10	263493	263502	20 %	60 %	0 %	20 %	383501174
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4982	NC_017058	AGA	3	9	263554	263562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501174
4983	NC_017058	TGC	2	6	263599	263604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501174
4984	NC_017058	AGCA	2	8	263634	263641	50 %	0 %	25 %	25 %	383501174
4985	NC_017058	AATCC	2	10	263690	263699	40 %	20 %	0 %	40 %	383501174
4986	NC_017058	AGC	2	6	263701	263706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501174
4987	NC_017058	GCT	2	6	263759	263764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501174
4988	NC_017058	TAA	2	6	263767	263772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501174
4989	NC_017058	TTAA	2	8	263804	263811	50 %	50 %	0 %	0 %	383501174
4990	NC_017058	GCT	2	6	263843	263848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501174
4991	NC_017058	TGA	2	6	263860	263865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501174
4992	NC_017058	AATGC	2	10	263912	263921	40 %	20 %	20 %	20 %	383501174
4993	NC_017058	AGA	2	6	263922	263927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501174
4994	NC_017058	GGT	2	6	263966	263971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383501174
4995	NC_017058	TTAG	2	8	263990	263997	25 %	50 %	25 %	0 %	383501174
4996	NC_017058	GAT	2	6	263999	264004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501174
4997	NC_017058	ATA	2	6	264057	264062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501174
4998	NC_017058	AG	3	6	264085	264090	50 %	0 %	50 %	0 %	383501174
4999	NC_017058	TA	3	6	264114	264119	50 %	50 %	0 %	0 %	383501174
5000	NC_017058	ATA	2	6	264168	264173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501174

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