MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. BuV67-CWPP chromosome

Total Repeats: 22106

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017056	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499257
2	NC_017056	GCA	2	6	58	63	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383499257
3	NC_017056	TAT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499257
4	NC_017056	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499257
5	NC_017056	T	6	6	293	298	0 %	100 %	0 %	0 %	383499257
6	NC_017056	ATTATA	2	12	326	337	50 %	50 %	0 %	0 %	383499257
7	NC_017056	ATG	3	9	392	400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499257
8	NC_017056	ATA	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499257
9	NC_017056	TAG	3	9	572	580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499257
10	NC_017056	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499257
11	NC_017056	AG	3	6	685	690	50 %	0 %	50 %	0 %	383499257
12	NC_017056	TGAT	2	8	734	741	25 %	50 %	25 %	0 %	383499257
13	NC_017056	CAG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383499257
14	NC_017056	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499257
15	NC_017056	AT	3	6	787	792	50 %	50 %	0 %	0 %	383499257
16	NC_017056	A	6	6	801	806	100 %	0 %	0 %	0 %	383499257
17	NC_017056	ATAA	2	8	815	822	75 %	25 %	0 %	0 %	383499257
18	NC_017056	GTG	2	6	1064	1069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383499258
19	NC_017056	ATA	2	6	1095	1100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499258
20	NC_017056	AAAGTA	2	12	1128	1139	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383499258
21	NC_017056	TGA	2	6	1154	1159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499258
22	NC_017056	TGT	2	6	1210	1215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383499258
23	NC_017056	CAA	2	6	1254	1259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383499258
24	NC_017056	A	7	7	1258	1264	100 %	0 %	0 %	0 %	383499258
25	NC_017056	TAA	2	6	1283	1288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499258
26	NC_017056	A	6	6	1411	1416	100 %	0 %	0 %	0 %	383499259
27	NC_017056	TTTCTC	2	12	1421	1432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383499259
28	NC_017056	A	6	6	1481	1486	100 %	0 %	0 %	0 %	383499259
29	NC_017056	AT	3	6	1546	1551	50 %	50 %	0 %	0 %	383499259
30	NC_017056	TGC	2	6	1590	1595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383499259
31	NC_017056	ACAG	2	8	1629	1636	50 %	0 %	25 %	25 %	383499259
32	NC_017056	ATGCTA	2	12	1654	1665	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383499259
33	NC_017056	TA	3	6	1664	1669	50 %	50 %	0 %	0 %	383499259
34	NC_017056	ATA	3	9	1667	1675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499259
35	NC_017056	A	7	7	1693	1699	100 %	0 %	0 %	0 %	383499259
36	NC_017056	GTA	2	6	1733	1738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499259
37	NC_017056	TGA	2	6	1833	1838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499259
38	NC_017056	GCA	2	6	1846	1851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383499259
39	NC_017056	TTAAT	2	10	1880	1889	40 %	60 %	0 %	0 %	383499259
40	NC_017056	GAA	2	6	1890	1895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383499259
41	NC_017056	AAT	2	6	1920	1925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499259
42	NC_017056	TCA	2	6	1932	1937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383499259
43	NC_017056	AGA	2	6	1938	1943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383499259
44	NC_017056	TTA	2	6	1975	1980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499259
45	NC_017056	GAT	2	6	1999	2004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499259
46	NC_017056	ACA	2	6	2037	2042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383499259
47	NC_017056	TAA	2	6	2046	2051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499259
48	NC_017056	T	8	8	2075	2082	0 %	100 %	0 %	0 %	383499260
49	NC_017056	A	6	6	2085	2090	100 %	0 %	0 %	0 %	383499260
50	NC_017056	T	6	6	2150	2155	0 %	100 %	0 %	0 %	383499260
51	NC_017056	ATA	2	6	2193	2198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499260
52	NC_017056	T	7	7	2210	2216	0 %	100 %	0 %	0 %	383499260
53	NC_017056	TTA	2	6	2223	2228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499260
54	NC_017056	AG	3	6	2238	2243	50 %	0 %	50 %	0 %	383499260
55	NC_017056	AGTA	2	8	2291	2298	50 %	25 %	25 %	0 %	383499260
56	NC_017056	ATA	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499260
57	NC_017056	A	7	7	2345	2351	100 %	0 %	0 %	0 %	383499260
58	NC_017056	T	7	7	2369	2375	0 %	100 %	0 %	0 %	383499260
59	NC_017056	TA	3	6	2401	2406	50 %	50 %	0 %	0 %	383499260
60	NC_017056	TTTTA	2	10	2441	2450	20 %	80 %	0 %	0 %	383499260
61	NC_017056	ATA	2	6	2478	2483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499260
62	NC_017056	TG	3	6	2517	2522	0 %	50 %	50 %	0 %	383499260
63	NC_017056	TTAT	2	8	2602	2609	25 %	75 %	0 %	0 %	383499260
64	NC_017056	AT	3	6	2661	2666	50 %	50 %	0 %	0 %	383499260
65	NC_017056	TAAT	2	8	2716	2723	50 %	50 %	0 %	0 %	383499260
66	NC_017056	ATG	2	6	2739	2744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499260
67	NC_017056	TAA	2	6	2746	2751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499260
68	NC_017056	TTA	2	6	2773	2778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499260
69	NC_017056	ATTTA	2	10	2794	2803	40 %	60 %	0 %	0 %	383499260
70	NC_017056	TTAT	2	8	2824	2831	25 %	75 %	0 %	0 %	383499260
71	NC_017056	A	6	6	2888	2893	100 %	0 %	0 %	0 %	383499261
72	NC_017056	CTC	2	6	2970	2975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383499261
73	NC_017056	TC	3	6	2974	2979	0 %	50 %	0 %	50 %	383499261
74	NC_017056	ATT	2	6	2981	2986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499261
75	NC_017056	ATT	2	6	2994	2999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499261
76	NC_017056	T	6	6	3037	3042	0 %	100 %	0 %	0 %	383499261
77	NC_017056	AAG	2	6	3066	3071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383499261
78	NC_017056	ATT	2	6	3107	3112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499261
79	NC_017056	A	7	7	3151	3157	100 %	0 %	0 %	0 %	383499261
80	NC_017056	GCAAA	2	10	3251	3260	60 %	0 %	20 %	20 %	383499261
81	NC_017056	GAA	2	6	3281	3286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383499261
82	NC_017056	AGC	2	6	3310	3315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383499261
83	NC_017056	TGC	2	6	3322	3327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383499261
84	NC_017056	TTA	2	6	3343	3348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499261
85	NC_017056	TCA	2	6	3359	3364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383499261
86	NC_017056	AT	3	6	3393	3398	50 %	50 %	0 %	0 %	383499261
87	NC_017056	CAA	2	6	3410	3415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383499261
88	NC_017056	A	8	8	3425	3432	100 %	0 %	0 %	0 %	383499261
89	NC_017056	GAT	2	6	3440	3445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499261
90	NC_017056	A	7	7	3446	3452	100 %	0 %	0 %	0 %	383499261
91	NC_017056	A	7	7	3465	3471	100 %	0 %	0 %	0 %	383499261
92	NC_017056	GA	3	6	3473	3478	50 %	0 %	50 %	0 %	383499261
93	NC_017056	T	7	7	3502	3508	0 %	100 %	0 %	0 %	383499261
94	NC_017056	ATT	2	6	3537	3542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499261
95	NC_017056	TATT	2	8	3544	3551	25 %	75 %	0 %	0 %	383499261
96	NC_017056	A	6	6	3678	3683	100 %	0 %	0 %	0 %	383499261
97	NC_017056	AGC	2	6	3724	3729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383499261
98	NC_017056	TAT	2	6	3736	3741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499261
99	NC_017056	GCA	2	6	3764	3769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383499261
100	NC_017056	AGA	2	6	3862	3867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383499261
101	NC_017056	AT	4	8	3896	3903	50 %	50 %	0 %	0 %	383499261
102	NC_017056	CTT	2	6	3905	3910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383499261
103	NC_017056	TAT	2	6	4013	4018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499261
104	NC_017056	TTA	2	6	4019	4024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499261
105	NC_017056	AGAA	2	8	4132	4139	75 %	0 %	25 %	0 %	383499261
106	NC_017056	AAC	2	6	4196	4201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383499261
107	NC_017056	GA	3	6	4226	4231	50 %	0 %	50 %	0 %	383499261
108	NC_017056	AAT	3	9	4232	4240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499261
109	NC_017056	TGA	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499261
110	NC_017056	ATG	2	6	4454	4459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499261
111	NC_017056	ATA	2	6	4478	4483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499261
112	NC_017056	GGT	2	6	4487	4492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383499261
113	NC_017056	CTT	2	6	4497	4502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383499261
114	NC_017056	TA	3	6	4565	4570	50 %	50 %	0 %	0 %	383499261
115	NC_017056	AGA	3	9	4585	4593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383499261
116	NC_017056	GAA	2	6	4607	4612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383499261
117	NC_017056	AAG	2	6	4638	4643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383499261
118	NC_017056	GAA	2	6	4655	4660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383499261
119	NC_017056	A	6	6	4663	4668	100 %	0 %	0 %	0 %	383499261
120	NC_017056	TAA	2	6	4675	4680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499261
121	NC_017056	GGA	2	6	4685	4690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383499261
122	NC_017056	TAT	2	6	4700	4705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499261
123	NC_017056	TAAAT	2	10	4735	4744	60 %	40 %	0 %	0 %	383499261
124	NC_017056	TAC	2	6	4858	4863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383499261
125	NC_017056	A	6	6	4886	4891	100 %	0 %	0 %	0 %	383499261
126	NC_017056	AGT	2	6	4925	4930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499261
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128	NC_017056	GTAGT	2	10	5046	5055	20 %	40 %	40 %	0 %	383499261
129	NC_017056	AAG	2	6	5076	5081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383499261
130	NC_017056	TTA	2	6	5091	5096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499261
131	NC_017056	ATT	2	6	5163	5168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499261
132	NC_017056	TAA	2	6	5185	5190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499261
133	NC_017056	AATA	2	8	5191	5198	75 %	25 %	0 %	0 %	383499261
134	NC_017056	TCAC	2	8	5230	5237	25 %	25 %	0 %	50 %	383499261
135	NC_017056	TGC	2	6	5242	5247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383499261
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137	NC_017056	ATT	2	6	5286	5291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499261
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