MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Dachau chromosome

Total Repeats: 21713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_017051	TTTA	2	8	649199	649206	25 %	75 %	0 %	0 %	383489614
13003	NC_017051	ACC	2	6	649277	649282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383489614
13004	NC_017051	AAG	2	6	649294	649299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489614
13005	NC_017051	T	6	6	649308	649313	0 %	100 %	0 %	0 %	383489614
13006	NC_017051	ATG	2	6	649337	649342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489614
13007	NC_017051	TA	3	6	649361	649366	50 %	50 %	0 %	0 %	383489614
13008	NC_017051	AT	3	6	649493	649498	50 %	50 %	0 %	0 %	383489614
13009	NC_017051	ACC	3	9	649556	649564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383489614
13010	NC_017051	ATT	3	9	649583	649591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489614
13011	NC_017051	TTTTC	2	10	649596	649605	0 %	80 %	0 %	20 %	383489614
13012	NC_017051	TA	3	6	649609	649614	50 %	50 %	0 %	0 %	383489614
13013	NC_017051	A	6	6	649614	649619	100 %	0 %	0 %	0 %	383489614
13014	NC_017051	CAC	2	6	649642	649647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383489614
13015	NC_017051	GTAA	2	8	649653	649660	50 %	25 %	25 %	0 %	383489614
13016	NC_017051	AGGATA	2	12	649691	649702	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383489614
13017	NC_017051	T	6	6	649752	649757	0 %	100 %	0 %	0 %	383489614
13018	NC_017051	ATT	2	6	649851	649856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489615
13019	NC_017051	TAA	2	6	649902	649907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489615
13020	NC_017051	TTA	2	6	649960	649965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489615
13021	NC_017051	AGCA	2	8	649986	649993	50 %	0 %	25 %	25 %	383489615
13022	NC_017051	ATAA	2	8	650035	650042	75 %	25 %	0 %	0 %	383489615
13023	NC_017051	ATC	2	6	650043	650048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489615
13024	NC_017051	TCC	2	6	650104	650109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383489615
13025	NC_017051	ATTT	2	8	650177	650184	25 %	75 %	0 %	0 %	383489615
13026	NC_017051	CAT	2	6	650201	650206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489615
13027	NC_017051	A	6	6	650209	650214	100 %	0 %	0 %	0 %	383489615
13028	NC_017051	CTG	2	6	650255	650260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489615
13029	NC_017051	ACT	3	9	650386	650394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489615
13030	NC_017051	CAA	2	6	650465	650470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489615
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13032	NC_017051	ACT	2	6	650478	650483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489615
13033	NC_017051	TAA	2	6	650526	650531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489615
13034	NC_017051	ATT	2	6	650550	650555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489615
13035	NC_017051	TTTG	2	8	650580	650587	0 %	75 %	25 %	0 %	383489615
13036	NC_017051	TAG	2	6	650603	650608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489615
13037	NC_017051	TCA	2	6	650704	650709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489615
13038	NC_017051	TTG	2	6	650754	650759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383489615
13039	NC_017051	TCA	2	6	650810	650815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489615
13040	NC_017051	AAT	2	6	650888	650893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489615
13041	NC_017051	CTT	2	6	650898	650903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489615
13042	NC_017051	ATA	2	6	650912	650917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489615
13043	NC_017051	CTG	2	6	650948	650953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489615
13044	NC_017051	TCA	2	6	650977	650982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489615
13045	NC_017051	ATG	2	6	651036	651041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489615
13046	NC_017051	CAT	2	6	651089	651094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489615
13047	NC_017051	CAC	2	6	651104	651109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383489615
13048	NC_017051	TAAT	2	8	651119	651126	50 %	50 %	0 %	0 %	383489615
13049	NC_017051	T	6	6	651149	651154	0 %	100 %	0 %	0 %	383489615
13050	NC_017051	AT	3	6	651186	651191	50 %	50 %	0 %	0 %	383489615
13051	NC_017051	GCT	2	6	651253	651258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489615
13052	NC_017051	TTG	2	6	651300	651305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383489615
13053	NC_017051	TAA	2	6	651375	651380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489615
13054	NC_017051	A	6	6	651400	651405	100 %	0 %	0 %	0 %	383489615
13055	NC_017051	ATT	2	6	651423	651428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489615
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13057	NC_017051	TCA	2	6	651688	651693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489616
13058	NC_017051	ACT	2	6	651739	651744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489616
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13060	NC_017051	ACCT	2	8	651840	651847	25 %	25 %	0 %	50 %	383489616
13061	NC_017051	TCTT	2	8	651867	651874	0 %	75 %	0 %	25 %	383489616
13062	NC_017051	CGT	2	6	651886	651891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489616
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13091	NC_017051	TAT	2	6	653194	653199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489617
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13093	NC_017051	TTTCA	2	10	653222	653231	20 %	60 %	0 %	20 %	383489617
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13101	NC_017051	ATAA	2	8	653509	653516	75 %	25 %	0 %	0 %	383489617
13102	NC_017051	TGTT	2	8	653528	653535	0 %	75 %	25 %	0 %	383489617
13103	NC_017051	ATT	3	9	653573	653581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489617
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13109	NC_017051	TAT	2	6	653851	653856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489617
13110	NC_017051	TCT	2	6	653889	653894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489617
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13115	NC_017051	T	7	7	654062	654068	0 %	100 %	0 %	0 %	383489617
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13118	NC_017051	ACTA	2	8	654280	654287	50 %	25 %	0 %	25 %	383489618
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