MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Katsinyian chromosome

Total Repeats: 22095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_017050	GTA	2	6	248915	248920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488473
5003	NC_017050	TTA	2	6	248921	248926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488473
5004	NC_017050	AT	3	6	249019	249024	50 %	50 %	0 %	0 %	383488473
5005	NC_017050	TAA	2	6	249042	249047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488473
5006	NC_017050	A	6	6	249081	249086	100 %	0 %	0 %	0 %	383488473
5007	NC_017050	TTA	2	6	249104	249109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488473
5008	NC_017050	TAC	2	6	249113	249118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383488473
5009	NC_017050	AGGT	2	8	249137	249144	25 %	25 %	50 %	0 %	383488473
5010	NC_017050	GGT	2	6	249166	249171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383488473
5011	NC_017050	ATTGCA	2	12	249184	249195	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383488473
5012	NC_017050	A	6	6	249207	249212	100 %	0 %	0 %	0 %	383488473
5013	NC_017050	AT	3	6	249220	249225	50 %	50 %	0 %	0 %	383488473
5014	NC_017050	TGA	2	6	249231	249236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488473
5015	NC_017050	CAAG	2	8	249277	249284	50 %	0 %	25 %	25 %	383488473
5016	NC_017050	TAC	2	6	249309	249314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383488473
5017	NC_017050	ATC	2	6	249319	249324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383488473
5018	NC_017050	TTG	2	6	249344	249349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383488473
5019	NC_017050	TA	3	6	249382	249387	50 %	50 %	0 %	0 %	383488473
5020	NC_017050	A	6	6	249417	249422	100 %	0 %	0 %	0 %	383488473
5021	NC_017050	CAG	2	6	249454	249459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383488473
5022	NC_017050	ATA	2	6	249496	249501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488473
5023	NC_017050	TGAT	2	8	250674	250681	25 %	50 %	25 %	0 %	383488474
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5025	NC_017050	AGATG	2	10	250717	250726	40 %	20 %	40 %	0 %	383488474
5026	NC_017050	TATCT	2	10	250731	250740	20 %	60 %	0 %	20 %	383488474
5027	NC_017050	ATC	2	6	250905	250910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383488474
5028	NC_017050	ATGG	2	8	251009	251016	25 %	25 %	50 %	0 %	383488474
5029	NC_017050	AGA	2	6	251080	251085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383488474
5030	NC_017050	ATTA	2	8	251114	251121	50 %	50 %	0 %	0 %	383488474
5031	NC_017050	GAA	2	6	251132	251137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383488474
5032	NC_017050	CTGC	2	8	251150	251157	0 %	25 %	25 %	50 %	383488474
5033	NC_017050	ATT	2	6	251243	251248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488474
5034	NC_017050	TA	4	8	251262	251269	50 %	50 %	0 %	0 %	383488474
5035	NC_017050	GTA	2	6	251388	251393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488474
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5037	NC_017050	ATT	3	9	251447	251455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488474
5038	NC_017050	TAAA	2	8	251475	251482	75 %	25 %	0 %	0 %	383488474
5039	NC_017050	TTG	2	6	251490	251495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383488474
5040	NC_017050	A	6	6	251496	251501	100 %	0 %	0 %	0 %	383488474
5041	NC_017050	AAAG	2	8	251593	251600	75 %	0 %	25 %	0 %	383488474
5042	NC_017050	AGT	2	6	251614	251619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488474
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5044	NC_017050	TGA	2	6	251703	251708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488474
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5046	NC_017050	TA	3	6	251770	251775	50 %	50 %	0 %	0 %	383488474
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5048	NC_017050	ATA	2	6	251849	251854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488474
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5050	NC_017050	TTA	2	6	251859	251864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488474
5051	NC_017050	AGTT	2	8	251946	251953	25 %	50 %	25 %	0 %	383488474
5052	NC_017050	GAT	2	6	251954	251959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488474
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5054	NC_017050	AGA	2	6	252154	252159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383488474
5055	NC_017050	TTAAAG	2	12	252165	252176	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383488474
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5058	NC_017050	CGTAAC	2	12	252265	252276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383488474
5059	NC_017050	TGG	2	6	252280	252285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383488474
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5105	NC_017050	AT	3	6	256656	256661	50 %	50 %	0 %	0 %	383488477
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5110	NC_017050	ATTG	2	8	256871	256878	25 %	50 %	25 %	0 %	383488477
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5121	NC_017050	TTCAT	2	10	261235	261244	20 %	60 %	0 %	20 %	383488478
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5123	NC_017050	CTA	2	6	261314	261319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383488478
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5243	NC_017050	A	6	6	267897	267902	100 %	0 %	0 %	0 %	383488482
5244	NC_017050	AGT	2	6	267966	267971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488482
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5494	NC_017050	AGG	2	6	281700	281705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383488490
5495	NC_017050	GTT	2	6	281797	281802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383488490
5496	NC_017050	GT	3	6	281804	281809	0 %	50 %	50 %	0 %	383488490
5497	NC_017050	TTG	2	6	281840	281845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383488490
5498	NC_017050	GAA	2	6	282082	282087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383488490
5499	NC_017050	AGA	2	6	282169	282174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383488491
5500	NC_017050	AAT	2	6	282196	282201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488491

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