MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. GvV257 chromosome

Total Repeats: 21715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017048	T	6	6	1432	1437	0 %	100 %	0 %	0 %	383486604
2	NC_017048	ATA	2	6	1447	1452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486604
3	NC_017048	ATA	2	6	1494	1499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486604
4	NC_017048	ACC	2	6	1555	1560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383486604
5	NC_017048	AT	3	6	1577	1582	50 %	50 %	0 %	0 %	383486604
6	NC_017048	ACC	2	6	5369	5374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383486605
7	NC_017048	ATT	2	6	5424	5429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486605
8	NC_017048	TCT	2	6	5439	5444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383486605
9	NC_017048	CTA	2	6	5479	5484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486605
10	NC_017048	TAC	2	6	5521	5526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486605
11	NC_017048	GTT	2	6	5529	5534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383486605
12	NC_017048	ATC	2	6	5612	5617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486605
13	NC_017048	T	6	6	5679	5684	0 %	100 %	0 %	0 %	383486605
14	NC_017048	ATC	2	6	5694	5699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486605
15	NC_017048	ATTT	2	8	5705	5712	25 %	75 %	0 %	0 %	383486605
16	NC_017048	CA	3	6	5722	5727	50 %	0 %	0 %	50 %	383486605
17	NC_017048	GTAT	2	8	5756	5763	25 %	50 %	25 %	0 %	383486605
18	NC_017048	AAT	2	6	5798	5803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486605
19	NC_017048	AAT	2	6	5909	5914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486605
20	NC_017048	T	7	7	6032	6038	0 %	100 %	0 %	0 %	383486605
21	NC_017048	CT	3	6	6061	6066	0 %	50 %	0 %	50 %	383486605
22	NC_017048	GCT	2	6	6085	6090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486605
23	NC_017048	GCT	2	6	6100	6105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486605
24	NC_017048	T	6	6	6221	6226	0 %	100 %	0 %	0 %	383486605
25	NC_017048	TAAA	2	8	6250	6257	75 %	25 %	0 %	0 %	383486605
26	NC_017048	TAA	2	6	6287	6292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486605
27	NC_017048	TAT	2	6	6331	6336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486605
28	NC_017048	TAT	2	6	6355	6360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486605
29	NC_017048	GCT	2	6	6369	6374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486605
30	NC_017048	TAT	2	6	6406	6411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486605
31	NC_017048	CTA	2	6	6412	6417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486605
32	NC_017048	TAA	2	6	6428	6433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486605
33	NC_017048	CAT	2	6	6439	6444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486605
34	NC_017048	TAATT	2	10	6455	6464	40 %	60 %	0 %	0 %	383486605
35	NC_017048	T	6	6	6521	6526	0 %	100 %	0 %	0 %	383486605
36	NC_017048	CTA	2	6	6583	6588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486605
37	NC_017048	ATTT	2	8	6601	6608	25 %	75 %	0 %	0 %	383486605
38	NC_017048	TCA	2	6	6621	6626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486605
39	NC_017048	TAAA	2	8	6664	6671	75 %	25 %	0 %	0 %	383486605
40	NC_017048	CTA	2	6	6775	6780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486605
41	NC_017048	TCT	2	6	6808	6813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383486605
42	NC_017048	A	7	7	6842	6848	100 %	0 %	0 %	0 %	383486605
43	NC_017048	AGC	2	6	6884	6889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383486605
44	NC_017048	ACTAA	2	10	6891	6900	60 %	20 %	0 %	20 %	383486605
45	NC_017048	TATCAT	2	12	6934	6945	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383486605
46	NC_017048	A	6	6	6956	6961	100 %	0 %	0 %	0 %	383486605
47	NC_017048	A	7	7	6990	6996	100 %	0 %	0 %	0 %	383486605
48	NC_017048	TAA	2	6	7010	7015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486605
49	NC_017048	AGT	2	6	7067	7072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486605
50	NC_017048	ATA	2	6	7083	7088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486605
51	NC_017048	GCT	2	6	7089	7094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486605
52	NC_017048	CTA	2	6	7119	7124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486605
53	NC_017048	TTTC	2	8	7414	7421	0 %	75 %	0 %	25 %	383486606
54	NC_017048	TTC	2	6	7437	7442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383486606
55	NC_017048	TGC	2	6	7444	7449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486606
56	NC_017048	ATA	2	6	7489	7494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486606
57	NC_017048	CT	3	6	7525	7530	0 %	50 %	0 %	50 %	383486606
58	NC_017048	T	9	9	7537	7545	0 %	100 %	0 %	0 %	383486606
59	NC_017048	GAA	2	6	7702	7707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383486607
60	NC_017048	A	8	8	7716	7723	100 %	0 %	0 %	0 %	383486607
61	NC_017048	ATT	2	6	7749	7754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486607
62	NC_017048	AATG	2	8	7762	7769	50 %	25 %	25 %	0 %	383486607
63	NC_017048	AAT	3	9	7771	7779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486607
64	NC_017048	GAA	2	6	7786	7791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383486607
65	NC_017048	AGA	2	6	7794	7799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383486607
66	NC_017048	TAA	2	6	7829	7834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486607
67	NC_017048	CGGA	2	8	7841	7848	25 %	0 %	50 %	25 %	383486607
68	NC_017048	ATA	2	6	7858	7863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486607
69	NC_017048	AAT	2	6	7890	7895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486607
70	NC_017048	AGA	2	6	7917	7922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383486607
71	NC_017048	A	7	7	7927	7933	100 %	0 %	0 %	0 %	383486607
72	NC_017048	A	6	6	7940	7945	100 %	0 %	0 %	0 %	383486607
73	NC_017048	TAT	2	6	7986	7991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486607
74	NC_017048	CTT	2	6	8006	8011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383486607
75	NC_017048	ATT	2	6	8105	8110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486607
76	NC_017048	T	6	6	8156	8161	0 %	100 %	0 %	0 %	383486607
77	NC_017048	A	6	6	8220	8225	100 %	0 %	0 %	0 %	383486607
78	NC_017048	A	8	8	8250	8257	100 %	0 %	0 %	0 %	383486607
79	NC_017048	AAT	2	6	8280	8285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486607
80	NC_017048	AAT	2	6	8898	8903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486608
81	NC_017048	GCT	2	6	8950	8955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486608
82	NC_017048	ATA	3	9	8987	8995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486608
83	NC_017048	ATTT	2	8	9036	9043	25 %	75 %	0 %	0 %	383486608
84	NC_017048	T	6	6	9041	9046	0 %	100 %	0 %	0 %	383486608
85	NC_017048	ACC	2	6	9054	9059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383486608
86	NC_017048	TTA	2	6	9104	9109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486608
87	NC_017048	CGT	2	6	9157	9162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486608
88	NC_017048	CTG	2	6	9188	9193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486608
89	NC_017048	AGAA	2	8	9206	9213	75 %	0 %	25 %	0 %	383486608
90	NC_017048	AAT	2	6	9265	9270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486608
91	NC_017048	AGTG	2	8	9301	9308	25 %	25 %	50 %	0 %	383486608
92	NC_017048	CAAG	2	8	9328	9335	50 %	0 %	25 %	25 %	383486608
93	NC_017048	TA	3	6	9413	9418	50 %	50 %	0 %	0 %	383486608
94	NC_017048	TTA	2	6	9427	9432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486608
95	NC_017048	AAG	2	6	9608	9613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383486608
96	NC_017048	CTTG	2	8	9640	9647	0 %	50 %	25 %	25 %	383486608
97	NC_017048	GAC	3	9	9648	9656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383486608
98	NC_017048	TCG	2	6	9716	9721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486608
99	NC_017048	TTATA	2	10	9738	9747	40 %	60 %	0 %	0 %	383486608
100	NC_017048	TCA	2	6	9754	9759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486608
101	NC_017048	ATC	2	6	9872	9877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486608
102	NC_017048	TGT	2	6	9909	9914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383486608
103	NC_017048	ATA	2	6	10016	10021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486608
104	NC_017048	ATA	3	9	10087	10095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486608
105	NC_017048	TA	4	8	10179	10186	50 %	50 %	0 %	0 %	383486608
106	NC_017048	CAT	2	6	10196	10201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486608
107	NC_017048	AAAT	2	8	10253	10260	75 %	25 %	0 %	0 %	383486608
108	NC_017048	ATTT	2	8	10286	10293	25 %	75 %	0 %	0 %	383486608
109	NC_017048	GAT	2	6	10375	10380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486608
110	NC_017048	AGA	2	6	10416	10421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383486608
111	NC_017048	GAT	2	6	10498	10503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486608
112	NC_017048	GAT	2	6	10534	10539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486608
113	NC_017048	A	6	6	10606	10611	100 %	0 %	0 %	0 %	383486608
114	NC_017048	CTG	2	6	10631	10636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486608
115	NC_017048	TGGT	2	8	10668	10675	0 %	50 %	50 %	0 %	383486608
116	NC_017048	CCA	2	6	10717	10722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383486608
117	NC_017048	TGT	2	6	10866	10871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383486608
118	NC_017048	AT	3	6	10972	10977	50 %	50 %	0 %	0 %	383486608
119	NC_017048	TA	3	6	11038	11043	50 %	50 %	0 %	0 %	383486608
120	NC_017048	TAAA	2	8	11066	11073	75 %	25 %	0 %	0 %	383486608
121	NC_017048	GAA	2	6	11077	11082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383486608
122	NC_017048	T	6	6	11131	11136	0 %	100 %	0 %	0 %	383486608
123	NC_017048	TA	3	6	11155	11160	50 %	50 %	0 %	0 %	383486608
124	NC_017048	TA	3	6	11292	11297	50 %	50 %	0 %	0 %	383486608
125	NC_017048	ATA	2	6	11309	11314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486608
126	NC_017048	CA	3	6	11322	11327	50 %	0 %	0 %	50 %	383486608
127	NC_017048	TTGC	2	8	11334	11341	0 %	50 %	25 %	25 %	383486608
128	NC_017048	ACA	2	6	11393	11398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383486608
129	NC_017048	AAAT	2	8	11441	11448	75 %	25 %	0 %	0 %	383486608
130	NC_017048	TATT	2	8	11501	11508	25 %	75 %	0 %	0 %	383486608
131	NC_017048	CTTG	2	8	11542	11549	0 %	50 %	25 %	25 %	383486608
132	NC_017048	TAT	2	6	11556	11561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486608
133	NC_017048	ATA	3	9	11570	11578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486608
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135	NC_017048	TGA	2	6	11640	11645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486608
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266	NC_017048	TTA	2	6	18378	18383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486612
267	NC_017048	GTC	2	6	18398	18403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486612
268	NC_017048	TA	4	8	18406	18413	50 %	50 %	0 %	0 %	383486612
269	NC_017048	ATT	2	6	18440	18445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486612
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279	NC_017048	ACC	2	6	18952	18957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383486612
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