MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. GvV257 chromosome

Total Repeats: 21715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4003	NC_017048	TGG	2	6	227077	227082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383486772
4004	NC_017048	T	6	6	227114	227119	0 %	100 %	0 %	0 %	383486772
4005	NC_017048	AGC	2	6	227227	227232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383486772
4006	NC_017048	TA	3	6	227271	227276	50 %	50 %	0 %	0 %	383486772
4007	NC_017048	AAG	2	6	227277	227282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383486772
4008	NC_017048	TA	3	6	227331	227336	50 %	50 %	0 %	0 %	383486772
4009	NC_017048	AAT	2	6	227344	227349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486772
4010	NC_017048	TAC	2	6	227367	227372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486772
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4012	NC_017048	CAATTA	2	12	227833	227844	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383486773
4013	NC_017048	A	6	6	227852	227857	100 %	0 %	0 %	0 %	383486773
4014	NC_017048	ATTT	2	8	227861	227868	25 %	75 %	0 %	0 %	383486773
4015	NC_017048	CTTC	2	8	227887	227894	0 %	50 %	0 %	50 %	383486773
4016	NC_017048	TA	3	6	227905	227910	50 %	50 %	0 %	0 %	383486773
4017	NC_017048	CTA	2	6	227988	227993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486773
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4019	NC_017048	TA	3	6	228037	228042	50 %	50 %	0 %	0 %	383486773
4020	NC_017048	CATT	2	8	228138	228145	25 %	50 %	0 %	25 %	383486773
4021	NC_017048	TGA	2	6	228258	228263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486773
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4025	NC_017048	TTA	2	6	229827	229832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486774
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4030	NC_017048	CTT	2	6	229957	229962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383486774
4031	NC_017048	AATA	2	8	229975	229982	75 %	25 %	0 %	0 %	383486774
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4035	NC_017048	AAAGTC	2	12	230217	230228	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383486774
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4039	NC_017048	A	6	6	230310	230315	100 %	0 %	0 %	0 %	383486775
4040	NC_017048	ACA	2	6	230333	230338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383486775
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4047	NC_017048	TAG	2	6	230535	230540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486775
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4049	NC_017048	A	6	6	230581	230586	100 %	0 %	0 %	0 %	383486775
4050	NC_017048	A	6	6	230695	230700	100 %	0 %	0 %	0 %	383486775
4051	NC_017048	GTA	2	6	230715	230720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486775
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4054	NC_017048	AAT	2	6	230761	230766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486775
4055	NC_017048	GTAA	2	8	230792	230799	50 %	25 %	25 %	0 %	383486775
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4057	NC_017048	TGA	2	6	230851	230856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486775
4058	NC_017048	A	6	6	230870	230875	100 %	0 %	0 %	0 %	383486775
4059	NC_017048	CAGC	2	8	230897	230904	25 %	0 %	25 %	50 %	383486775
4060	NC_017048	AAT	3	9	230905	230913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486775
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4093	NC_017048	TA	3	6	232644	232649	50 %	50 %	0 %	0 %	383486776
4094	NC_017048	GAT	2	6	232652	232657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486776
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4103	NC_017048	CTAAT	2	10	233009	233018	40 %	40 %	0 %	20 %	383486776
4104	NC_017048	AT	3	6	233071	233076	50 %	50 %	0 %	0 %	383486776
4105	NC_017048	CAC	2	6	233159	233164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383486776
4106	NC_017048	GAT	2	6	233192	233197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486776
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4113	NC_017048	TA	3	6	233555	233560	50 %	50 %	0 %	0 %	383486777
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4117	NC_017048	CTTTGT	2	12	233695	233706	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383486777
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4119	NC_017048	ATATA	2	10	233765	233774	60 %	40 %	0 %	0 %	383486777
4120	NC_017048	TA	4	8	233771	233778	50 %	50 %	0 %	0 %	383486777
4121	NC_017048	CT	3	6	234020	234025	0 %	50 %	0 %	50 %	383486778
4122	NC_017048	TA	3	6	234055	234060	50 %	50 %	0 %	0 %	383486778
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4124	NC_017048	T	7	7	234124	234130	0 %	100 %	0 %	0 %	383486778
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4248	NC_017048	CCTG	2	8	240278	240285	0 %	25 %	25 %	50 %	383486782
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4496	NC_017048	ATA	2	6	252854	252859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486790
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