MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 chromosome

Total Repeats: 86515

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_017047	ATG	2	6	550213	550218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384256411
10002	NC_017047	CTCAGG	2	12	550253	550264	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384256411
10003	NC_017047	ATAA	2	8	550642	550649	75 %	25 %	0 %	0 %	384256412
10004	NC_017047	GAA	2	6	550657	550662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384256412
10005	NC_017047	AAT	2	6	550741	550746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384256413
10006	NC_017047	TGCCGC	2	12	550759	550770	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384256413
10007	NC_017047	CTG	2	6	550847	550852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256413
10008	NC_017047	TCCACA	2	12	550885	550896	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384256413
10009	NC_017047	AAC	2	6	550932	550937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384256413
10010	NC_017047	CCG	2	6	550945	550950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256413
10011	NC_017047	CGC	2	6	550975	550980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256413
10012	NC_017047	GAT	2	6	551030	551035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384256413
10013	NC_017047	GTCTTC	2	12	551039	551050	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384256413
10014	NC_017047	GCC	2	6	551077	551082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256413
10015	NC_017047	ATA	2	6	551177	551182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384256413
10016	NC_017047	CTT	2	6	551246	551251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384256414
10017	NC_017047	CGG	2	6	551308	551313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256414
10018	NC_017047	CA	3	6	551467	551472	50 %	0 %	0 %	50 %	384256414
10019	NC_017047	TGC	2	6	551494	551499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256414
10020	NC_017047	CCG	2	6	551530	551535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256414
10021	NC_017047	TCT	2	6	551591	551596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384256414
10022	NC_017047	TAA	2	6	551623	551628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384256414
10023	NC_017047	CCA	2	6	551648	551653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384256414
10024	NC_017047	GAC	2	6	551675	551680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256414
10025	NC_017047	GGC	2	6	551760	551765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256414
10026	NC_017047	GGCG	2	8	551771	551778	0 %	0 %	75 %	25 %	384256414
10027	NC_017047	ACTG	2	8	551804	551811	25 %	25 %	25 %	25 %	384256414
10028	NC_017047	TCG	3	9	551920	551928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256414
10029	NC_017047	TCA	2	6	552014	552019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384256414
10030	NC_017047	T	6	6	552024	552029	0 %	100 %	0 %	0 %	384256414
10031	NC_017047	TCG	2	6	552046	552051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256414
10032	NC_017047	CGC	2	6	552066	552071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256414
10033	NC_017047	TTG	2	6	552130	552135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384256414
10034	NC_017047	CAC	2	6	552225	552230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384256414
10035	NC_017047	CGG	2	6	552365	552370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256414
10036	NC_017047	CTG	2	6	552417	552422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256414
10037	NC_017047	ACG	2	6	552440	552445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256414
10038	NC_017047	ACCGAA	2	12	552453	552464	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384256414
10039	NC_017047	TCGGCA	2	12	552574	552585	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384256414
10040	NC_017047	TTC	2	6	552594	552599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384256414
10041	NC_017047	TGTT	2	8	552613	552620	0 %	75 %	25 %	0 %	384256414
10042	NC_017047	TCG	2	6	552652	552657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256414
10043	NC_017047	TGG	2	6	552668	552673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256414
10044	NC_017047	GCC	2	6	552675	552680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256414
10045	NC_017047	TGGC	2	8	552688	552695	0 %	25 %	50 %	25 %	384256414
10046	NC_017047	GAA	2	6	552831	552836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384256414
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10048	NC_017047	CAC	2	6	552888	552893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384256414
10049	NC_017047	TTG	2	6	552982	552987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384256414
10050	NC_017047	AGC	2	6	553000	553005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256414
10051	NC_017047	TTGCT	2	10	553012	553021	0 %	60 %	20 %	20 %	384256414
10052	NC_017047	GC	3	6	553220	553225	0 %	0 %	50 %	50 %	384256414
10053	NC_017047	AAT	2	6	553226	553231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384256414
10054	NC_017047	CGG	2	6	553247	553252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256414
10055	NC_017047	TGG	2	6	553343	553348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256414
10056	NC_017047	AGGCG	2	10	553738	553747	20 %	0 %	60 %	20 %	384256415
10057	NC_017047	CAG	2	6	553756	553761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256415
10058	NC_017047	CCA	2	6	553818	553823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384256415
10059	NC_017047	GCA	2	6	553881	553886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256415
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10061	NC_017047	TTC	2	6	554125	554130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384256415
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10066	NC_017047	CTG	2	6	554398	554403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256415
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10070	NC_017047	TTG	2	6	554559	554564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384256415
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10087	NC_017047	CGGTT	2	10	555614	555623	0 %	40 %	40 %	20 %	384256416
10088	NC_017047	CGA	2	6	555700	555705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256416
10089	NC_017047	CCG	2	6	555759	555764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256416
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10102	NC_017047	AGC	2	6	556284	556289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256416
10103	NC_017047	GCC	2	6	556343	556348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256416
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10105	NC_017047	TGC	2	6	556450	556455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256416
10106	NC_017047	GGCG	2	8	556477	556484	0 %	0 %	75 %	25 %	384256416
10107	NC_017047	GTA	2	6	556544	556549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384256416
10108	NC_017047	ATC	2	6	556550	556555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384256416
10109	NC_017047	ACC	2	6	556572	556577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384256416
10110	NC_017047	AGC	2	6	556600	556605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256416
10111	NC_017047	GCC	2	6	556715	556720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256416
10112	NC_017047	AAGC	2	8	556926	556933	50 %	0 %	25 %	25 %	384256417
10113	NC_017047	GTG	2	6	556961	556966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256417
10114	NC_017047	GCT	2	6	557000	557005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256417
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10116	NC_017047	GCA	2	6	557061	557066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256417
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10118	NC_017047	TGC	2	6	557108	557113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256417
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10229	NC_017047	ATCA	2	8	563839	563846	50 %	25 %	0 %	25 %	384256421
10230	NC_017047	GGC	2	6	563854	563859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256421
10231	NC_017047	GGC	2	6	563974	563979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256421
10232	NC_017047	ATT	3	9	564052	564060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384256422
10233	NC_017047	TGA	2	6	564120	564125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384256422
10234	NC_017047	TGT	2	6	564166	564171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384256422
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10475	NC_017047	GGC	3	9	578016	578024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256430
10476	NC_017047	AAT	2	6	578089	578094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384256430
10477	NC_017047	GTCA	2	8	578122	578129	25 %	25 %	25 %	25 %	384256430
10478	NC_017047	ACA	2	6	578322	578327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384256430
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10480	NC_017047	A	6	6	578421	578426	100 %	0 %	0 %	0 %	384256430
10481	NC_017047	GGT	2	6	578490	578495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256430
10482	NC_017047	ACG	2	6	578657	578662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256430
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