MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer ATCC 11845 = DSM 15868 chromosome

Total Repeats: 40548

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40501	NC_017045	ACA	2	6	2149443	2149448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383486597
40502	NC_017045	TGA	2	6	2149496	2149501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486597
40503	NC_017045	ATG	2	6	2149597	2149602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486597
40504	NC_017045	CTA	2	6	2149780	2149785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486597
40505	NC_017045	ATG	2	6	2149836	2149841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486597
40506	NC_017045	GTAAT	2	10	2149849	2149858	40 %	40 %	20 %	0 %	383486597
40507	NC_017045	AAT	2	6	2149899	2149904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486597
40508	NC_017045	ATT	2	6	2149923	2149928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486597
40509	NC_017045	A	6	6	2149978	2149983	100 %	0 %	0 %	0 %	383486597
40510	NC_017045	T	6	6	2150980	2150985	0 %	100 %	0 %	0 %	383486598
40511	NC_017045	A	6	6	2151001	2151006	100 %	0 %	0 %	0 %	383486598
40512	NC_017045	TCAAA	2	10	2151558	2151567	60 %	20 %	0 %	20 %	383486599
40513	NC_017045	CTTA	2	8	2151694	2151701	25 %	50 %	0 %	25 %	383486599
40514	NC_017045	CAAG	2	8	2151707	2151714	50 %	0 %	25 %	25 %	383486599
40515	NC_017045	GCATT	2	10	2151740	2151749	20 %	40 %	20 %	20 %	383486599
40516	NC_017045	TGA	2	6	2151783	2151788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486599
40517	NC_017045	A	6	6	2151832	2151837	100 %	0 %	0 %	0 %	383486599
40518	NC_017045	AATCAC	2	12	2151877	2151888	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	383486599
40519	NC_017045	AAG	2	6	2151923	2151928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383486599
40520	NC_017045	ATT	2	6	2151956	2151961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486599
40521	NC_017045	GAA	2	6	2152069	2152074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383486599
40522	NC_017045	GAA	2	6	2152129	2152134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383486599
40523	NC_017045	GAA	2	6	2152296	2152301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383486599
40524	NC_017045	ACT	2	6	2152440	2152445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486600
40525	NC_017045	GAAGTA	2	12	2152462	2152473	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383486600
40526	NC_017045	A	6	6	2152493	2152498	100 %	0 %	0 %	0 %	383486600
40527	NC_017045	GGTTTT	2	12	2152522	2152533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383486600
40528	NC_017045	TGAT	2	8	2152538	2152545	25 %	50 %	25 %	0 %	383486600
40529	NC_017045	TAA	2	6	2152583	2152588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486600
40530	NC_017045	CAA	2	6	2152603	2152608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383486600
40531	NC_017045	ATT	2	6	2152637	2152642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486600
40532	NC_017045	ATT	2	6	2152664	2152669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486600
40533	NC_017045	AGA	2	6	2152698	2152703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383486600
40534	NC_017045	TTA	2	6	2152724	2152729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486600
40535	NC_017045	A	6	6	2152733	2152738	100 %	0 %	0 %	0 %	383486600
40536	NC_017045	ATG	2	6	2152766	2152771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486600
40537	NC_017045	TGAA	2	8	2152781	2152788	50 %	25 %	25 %	0 %	383486600
40538	NC_017045	A	6	6	2152888	2152893	100 %	0 %	0 %	0 %	383486600
40539	NC_017045	TACA	2	8	2153015	2153022	50 %	25 %	0 %	25 %	383486601
40540	NC_017045	ATC	2	6	2153070	2153075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486601
40541	NC_017045	CACAAT	2	12	2153133	2153144	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	383486601
40542	NC_017045	TTG	2	6	2153269	2153274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383486601
40543	NC_017045	CAA	2	6	2153319	2153324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383486601
40544	NC_017045	ATGTA	2	10	2153426	2153435	40 %	40 %	20 %	0 %	383486601
40545	NC_017045	TGT	2	6	2153439	2153444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383486601
40546	NC_017045	T	6	6	2153508	2153513	0 %	100 %	0 %	0 %	383486601
40547	NC_017045	AGCATC	2	12	2153563	2153574	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383486601
40548	NC_017045	TAT	2	6	2153664	2153669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486601

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.