MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 25017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_017044	GGACTT	2	12	1120306	1120317	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383484489
21502	NC_017044	AGC	2	6	1120539	1120544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383484489
21503	NC_017044	CGA	2	6	1120581	1120586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383484489
21504	NC_017044	CTTT	2	8	1120700	1120707	0 %	75 %	0 %	25 %	383484489
21505	NC_017044	ATTA	2	8	1120719	1120726	50 %	50 %	0 %	0 %	383484489
21506	NC_017044	CCAAA	2	10	1120771	1120780	60 %	0 %	0 %	40 %	383484489
21507	NC_017044	TGC	2	6	1120917	1120922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383484489
21508	NC_017044	A	6	6	1120957	1120962	100 %	0 %	0 %	0 %	383484489
21509	NC_017044	AGA	2	6	1121031	1121036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484489
21510	NC_017044	GA	3	6	1121160	1121165	50 %	0 %	50 %	0 %	383484489
21511	NC_017044	TGAT	2	8	1121198	1121205	25 %	50 %	25 %	0 %	383484489
21512	NC_017044	CTA	2	6	1121228	1121233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484489
21513	NC_017044	AGC	2	6	1121256	1121261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383484489
21514	NC_017044	ATT	2	6	1121271	1121276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484489
21515	NC_017044	TCT	2	6	1121305	1121310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383484489
21516	NC_017044	ATC	2	6	1121316	1121321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484489
21517	NC_017044	AGAT	2	8	1121474	1121481	50 %	25 %	25 %	0 %	383484489
21518	NC_017044	GGT	2	6	1121509	1121514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383484489
21519	NC_017044	TTTAA	2	10	1121549	1121558	40 %	60 %	0 %	0 %	383484489
21520	NC_017044	TTA	2	6	1121846	1121851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484490
21521	NC_017044	ATT	2	6	1122014	1122019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484490
21522	NC_017044	ACA	2	6	1122101	1122106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484490
21523	NC_017044	ATT	2	6	1122257	1122262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484490
21524	NC_017044	TGA	2	6	1122266	1122271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484490
21525	NC_017044	AAT	2	6	1122296	1122301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484490
21526	NC_017044	AGA	2	6	1122311	1122316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484490
21527	NC_017044	TAT	2	6	1122341	1122346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484490
21528	NC_017044	TAA	2	6	1122386	1122391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484490
21529	NC_017044	TGG	2	6	1122396	1122401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383484490
21530	NC_017044	T	6	6	1122444	1122449	0 %	100 %	0 %	0 %	383484490
21531	NC_017044	AAG	3	9	1122478	1122486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484490
21532	NC_017044	TAAA	2	8	1122502	1122509	75 %	25 %	0 %	0 %	383484490
21533	NC_017044	A	6	6	1122507	1122512	100 %	0 %	0 %	0 %	383484490
21534	NC_017044	AATG	2	8	1122525	1122532	50 %	25 %	25 %	0 %	383484490
21535	NC_017044	CTAG	2	8	1122630	1122637	25 %	25 %	25 %	25 %	383484490
21536	NC_017044	ATT	2	6	1122693	1122698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484490
21537	NC_017044	ATA	2	6	1122706	1122711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484490
21538	NC_017044	AAT	2	6	1122744	1122749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484490
21539	NC_017044	A	6	6	1122764	1122769	100 %	0 %	0 %	0 %	383484490
21540	NC_017044	ACT	2	6	1122827	1122832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484490
21541	NC_017044	TA	3	6	1122866	1122871	50 %	50 %	0 %	0 %	383484490
21542	NC_017044	ACA	2	6	1122938	1122943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484490
21543	NC_017044	CATG	2	8	1122995	1123002	25 %	25 %	25 %	25 %	383484490
21544	NC_017044	ACT	2	6	1123040	1123045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484490
21545	NC_017044	ATT	2	6	1123088	1123093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484490
21546	NC_017044	ATT	2	6	1123198	1123203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484490
21547	NC_017044	GTTA	2	8	1123250	1123257	25 %	50 %	25 %	0 %	383484490
21548	NC_017044	AGG	2	6	1123301	1123306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383484490
21549	NC_017044	TAC	2	6	1123331	1123336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484490
21550	NC_017044	A	6	6	1123350	1123355	100 %	0 %	0 %	0 %	383484490
21551	NC_017044	ACCACT	2	12	1123364	1123375	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	383484490
21552	NC_017044	TAAA	2	8	1123396	1123403	75 %	25 %	0 %	0 %	383484490
21553	NC_017044	AATT	2	8	1123552	1123559	50 %	50 %	0 %	0 %	383484490
21554	NC_017044	TTA	2	6	1123584	1123589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484490
21555	NC_017044	A	6	6	1124790	1124795	100 %	0 %	0 %	0 %	383484491
21556	NC_017044	AGC	2	6	1124816	1124821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383484491
21557	NC_017044	GAA	2	6	1124847	1124852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484491
21558	NC_017044	AAG	2	6	1124881	1124886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484491
21559	NC_017044	AGT	2	6	1124898	1124903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484491
21560	NC_017044	CCA	2	6	1124909	1124914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383484491
21561	NC_017044	TG	3	6	1124937	1124942	0 %	50 %	50 %	0 %	383484491
21562	NC_017044	ATA	2	6	1125000	1125005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484491
21563	NC_017044	TGC	2	6	1126267	1126272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383484492
21564	NC_017044	T	7	7	1126290	1126296	0 %	100 %	0 %	0 %	383484492
21565	NC_017044	CTT	2	6	1126392	1126397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383484492
21566	NC_017044	GTT	2	6	1126425	1126430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484492
21567	NC_017044	AGG	2	6	1126447	1126452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383484492
21568	NC_017044	AAC	2	6	1126468	1126473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484492
21569	NC_017044	TAG	2	6	1126476	1126481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484492
21570	NC_017044	CAAT	2	8	1126511	1126518	50 %	25 %	0 %	25 %	383484492
21571	NC_017044	CAAA	2	8	1126521	1126528	75 %	0 %	0 %	25 %	383484492
21572	NC_017044	TAA	2	6	1126546	1126551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484492
21573	NC_017044	TAA	2	6	1126580	1126585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484492
21574	NC_017044	TTC	2	6	1126633	1126638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383484492
21575	NC_017044	ATT	2	6	1126729	1126734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484492
21576	NC_017044	AAT	2	6	1126745	1126750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484492
21577	NC_017044	TACCTG	2	12	1126770	1126781	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383484492
21578	NC_017044	GCG	2	6	1126859	1126864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383484492
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21583	NC_017044	CTTTT	2	10	1127096	1127105	0 %	80 %	0 %	20 %	383484493
21584	NC_017044	AGT	2	6	1127211	1127216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484493
21585	NC_017044	ATCT	2	8	1127253	1127260	25 %	50 %	0 %	25 %	383484493
21586	NC_017044	TCT	2	6	1127278	1127283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383484493
21587	NC_017044	TAG	2	6	1127300	1127305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484493
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21589	NC_017044	TAGA	2	8	1127702	1127709	50 %	25 %	25 %	0 %	383484494
21590	NC_017044	GCT	2	6	1127713	1127718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383484494
21591	NC_017044	CAT	2	6	1127732	1127737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484494
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21594	NC_017044	ATT	2	6	1127961	1127966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484494
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21598	NC_017044	AT	3	6	1128106	1128111	50 %	50 %	0 %	0 %	383484494
21599	NC_017044	TTC	3	9	1128117	1128125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383484494
21600	NC_017044	TGT	2	6	1128196	1128201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484494
21601	NC_017044	T	6	6	1128232	1128237	0 %	100 %	0 %	0 %	383484494
21602	NC_017044	TA	3	6	1128282	1128287	50 %	50 %	0 %	0 %	383484494
21603	NC_017044	AT	3	6	1128293	1128298	50 %	50 %	0 %	0 %	383484494
21604	NC_017044	ATACT	2	10	1128323	1128332	40 %	40 %	0 %	20 %	383484494
21605	NC_017044	T	7	7	1128362	1128368	0 %	100 %	0 %	0 %	383484494
21606	NC_017044	A	6	6	1128378	1128383	100 %	0 %	0 %	0 %	383484494
21607	NC_017044	A	7	7	1128417	1128423	100 %	0 %	0 %	0 %	383484494
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21611	NC_017044	T	6	6	1128475	1128480	0 %	100 %	0 %	0 %	383484494
21612	NC_017044	CA	3	6	1128575	1128580	50 %	0 %	0 %	50 %	383484495
21613	NC_017044	AG	3	6	1128581	1128586	50 %	0 %	50 %	0 %	383484495
21614	NC_017044	CAT	2	6	1128589	1128594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484495
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