MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 25017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017044	TAA	3	9	310128	310136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483641
6002	NC_017044	TAA	2	6	310140	310145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483641
6003	NC_017044	TG	3	6	310219	310224	0 %	50 %	50 %	0 %	383483642
6004	NC_017044	TAA	2	6	310316	310321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483642
6005	NC_017044	CTA	2	6	310381	310386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483643
6006	NC_017044	T	7	7	310387	310393	0 %	100 %	0 %	0 %	383483643
6007	NC_017044	TTGC	2	8	310397	310404	0 %	50 %	25 %	25 %	383483643
6008	NC_017044	CTG	2	6	310422	310427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483643
6009	NC_017044	AAG	2	6	310458	310463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483643
6010	NC_017044	TAA	2	6	310483	310488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483643
6011	NC_017044	T	6	6	310602	310607	0 %	100 %	0 %	0 %	383483643
6012	NC_017044	TAG	2	6	310641	310646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483643
6013	NC_017044	TTA	2	6	310676	310681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483643
6014	NC_017044	AAT	2	6	310702	310707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483643
6015	NC_017044	T	6	6	310750	310755	0 %	100 %	0 %	0 %	383483643
6016	NC_017044	CTT	2	6	310797	310802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483643
6017	NC_017044	TAT	3	9	310818	310826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483643
6018	NC_017044	AAT	2	6	310847	310852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483644
6019	NC_017044	T	6	6	310852	310857	0 %	100 %	0 %	0 %	383483644
6020	NC_017044	ATT	2	6	310871	310876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483644
6021	NC_017044	TTGT	2	8	310897	310904	0 %	75 %	25 %	0 %	383483644
6022	NC_017044	T	6	6	311089	311094	0 %	100 %	0 %	0 %	383483645
6023	NC_017044	TCT	2	6	311245	311250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483645
6024	NC_017044	CATT	2	8	311261	311268	25 %	50 %	0 %	25 %	383483645
6025	NC_017044	ATTA	2	8	311523	311530	50 %	50 %	0 %	0 %	383483646
6026	NC_017044	ATT	2	6	311544	311549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483646
6027	NC_017044	ACTA	2	8	311550	311557	50 %	25 %	0 %	25 %	383483646
6028	NC_017044	GCA	2	6	311566	311571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483646
6029	NC_017044	AAT	2	6	311608	311613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483646
6030	NC_017044	GAG	2	6	311614	311619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383483646
6031	NC_017044	GCT	2	6	311626	311631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483646
6032	NC_017044	ACA	2	6	311715	311720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483646
6033	NC_017044	TAA	2	6	311721	311726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483646
6034	NC_017044	ATA	2	6	311735	311740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483646
6035	NC_017044	A	6	6	311740	311745	100 %	0 %	0 %	0 %	383483646
6036	NC_017044	TGG	2	6	311826	311831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383483646
6037	NC_017044	GCT	2	6	311854	311859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483646
6038	NC_017044	A	6	6	311906	311911	100 %	0 %	0 %	0 %	383483646
6039	NC_017044	TAT	2	6	311912	311917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483646
6040	NC_017044	TAA	2	6	311924	311929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483646
6041	NC_017044	ACA	2	6	312000	312005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483646
6042	NC_017044	GCA	3	9	312082	312090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483646
6043	NC_017044	GCT	2	6	312106	312111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483646
6044	NC_017044	A	7	7	312129	312135	100 %	0 %	0 %	0 %	383483646
6045	NC_017044	TTA	2	6	312143	312148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483646
6046	NC_017044	GCT	2	6	312235	312240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483646
6047	NC_017044	ATT	2	6	312318	312323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483646
6048	NC_017044	AAGT	2	8	312329	312336	50 %	25 %	25 %	0 %	383483646
6049	NC_017044	TAC	2	6	312361	312366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483646
6050	NC_017044	ATA	2	6	312395	312400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483646
6051	NC_017044	TAC	3	9	312408	312416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483646
6052	NC_017044	GAGG	2	8	312445	312452	25 %	0 %	75 %	0 %	383483646
6053	NC_017044	GGGA	2	8	312557	312564	25 %	0 %	75 %	0 %	383483646
6054	NC_017044	AGC	2	6	312570	312575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483646
6055	NC_017044	TTG	2	6	312587	312592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483646
6056	NC_017044	TGC	2	6	312612	312617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483646
6057	NC_017044	GAA	2	6	312691	312696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483646
6058	NC_017044	GAA	2	6	312829	312834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483646
6059	NC_017044	AGA	2	6	312916	312921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483647
6060	NC_017044	TAA	2	6	312945	312950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483647
6061	NC_017044	GAAGAT	2	12	312986	312997	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383483647
6062	NC_017044	GAA	3	9	313031	313039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483647
6063	NC_017044	CTG	2	6	313059	313064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483647
6064	NC_017044	AGGT	2	8	313068	313075	25 %	25 %	50 %	0 %	383483647
6065	NC_017044	TAA	2	6	313123	313128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483647
6066	NC_017044	GAA	2	6	313151	313156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483647
6067	NC_017044	GCTTG	2	10	313190	313199	0 %	40 %	40 %	20 %	383483647
6068	NC_017044	TAG	2	6	313230	313235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483647
6069	NC_017044	GCTA	2	8	313293	313300	25 %	25 %	25 %	25 %	383483648
6070	NC_017044	T	6	6	313322	313327	0 %	100 %	0 %	0 %	383483648
6071	NC_017044	CGCGGG	2	12	313338	313349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383483648
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6079	NC_017044	TAT	2	6	313533	313538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483649
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6082	NC_017044	T	6	6	313667	313672	0 %	100 %	0 %	0 %	383483649
6083	NC_017044	A	6	6	313681	313686	100 %	0 %	0 %	0 %	383483649
6084	NC_017044	CAAG	2	8	313706	313713	50 %	0 %	25 %	25 %	383483649
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6088	NC_017044	AGT	2	6	313865	313870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483649
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6090	NC_017044	ACCA	2	8	314131	314138	50 %	0 %	0 %	50 %	383483649
6091	NC_017044	GCC	2	6	314143	314148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383483649
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6094	NC_017044	GAA	2	6	314198	314203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483649
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6096	NC_017044	CCG	2	6	314270	314275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383483649
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6099	NC_017044	TAC	2	6	314416	314421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483649
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6103	NC_017044	GTT	2	6	314540	314545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483649
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6106	NC_017044	ATA	2	6	314658	314663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483649
6107	NC_017044	AAT	2	6	314669	314674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483649
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6110	NC_017044	AAAG	2	8	314818	314825	75 %	0 %	25 %	0 %	383483649
6111	NC_017044	AGA	2	6	314849	314854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483649
6112	NC_017044	AG	3	6	314863	314868	50 %	0 %	50 %	0 %	383483649
6113	NC_017044	TTA	2	6	314871	314876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483649
6114	NC_017044	ATAA	2	8	314891	314898	75 %	25 %	0 %	0 %	383483649
6115	NC_017044	AAAG	2	8	314899	314906	75 %	0 %	25 %	0 %	383483649
6116	NC_017044	ATCT	2	8	314919	314926	25 %	50 %	0 %	25 %	383483649
6117	NC_017044	TGCG	2	8	314985	314992	0 %	25 %	50 %	25 %	383483649
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6121	NC_017044	AAAGA	2	10	315448	315457	80 %	0 %	20 %	0 %	383483650
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6123	NC_017044	CAT	2	6	315574	315579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483650
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