MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 25017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017044	GCG	2	6	278980	278985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383483617
5502	NC_017044	GCA	2	6	278986	278991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483617
5503	NC_017044	GAA	2	6	279091	279096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483617
5504	NC_017044	CGGT	2	8	279158	279165	0 %	25 %	50 %	25 %	383483617
5505	NC_017044	TA	4	8	279221	279228	50 %	50 %	0 %	0 %	383483617
5506	NC_017044	ATA	2	6	279230	279235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483617
5507	NC_017044	GTT	2	6	279265	279270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483617
5508	NC_017044	ATT	3	9	279406	279414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483617
5509	NC_017044	AAGGC	2	10	279439	279448	40 %	0 %	40 %	20 %	383483617
5510	NC_017044	TGA	2	6	279510	279515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483617
5511	NC_017044	AAAG	2	8	279552	279559	75 %	0 %	25 %	0 %	383483617
5512	NC_017044	AGT	2	6	279573	279578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483617
5513	NC_017044	TTA	2	6	279626	279631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483617
5514	NC_017044	TGCT	2	8	279632	279639	0 %	50 %	25 %	25 %	383483617
5515	NC_017044	TGA	2	6	279662	279667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483617
5516	NC_017044	AAG	2	6	279674	279679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483617
5517	NC_017044	AGT	2	6	279708	279713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483617
5518	NC_017044	TA	3	6	279729	279734	50 %	50 %	0 %	0 %	383483617
5519	NC_017044	ACTA	2	8	279777	279784	50 %	25 %	0 %	25 %	383483617
5520	NC_017044	ATA	2	6	279808	279813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483617
5521	NC_017044	TAT	2	6	279816	279821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483617
5522	NC_017044	GTTG	2	8	279906	279913	0 %	50 %	50 %	0 %	383483617
5523	NC_017044	TTAAAG	2	12	280124	280135	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383483617
5524	NC_017044	CTC	2	6	280148	280153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383483617
5525	NC_017044	AGA	2	6	280194	280199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483617
5526	NC_017044	GAA	2	6	280213	280218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483617
5527	NC_017044	TGA	2	6	280323	280328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483617
5528	NC_017044	GTA	2	6	280355	280360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483617
5529	NC_017044	TGT	2	6	280373	280378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483617
5530	NC_017044	TCT	2	6	280379	280384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483617
5531	NC_017044	AGGGTA	2	12	280442	280453	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	383483617
5532	NC_017044	AT	3	6	280466	280471	50 %	50 %	0 %	0 %	383483617
5533	NC_017044	AGA	2	6	280579	280584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483617
5534	NC_017044	TTA	2	6	280591	280596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483617
5535	NC_017044	TGA	2	6	280641	280646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483617
5536	NC_017044	AGA	2	6	280680	280685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483617
5537	NC_017044	TTA	2	6	280751	280756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483617
5538	NC_017044	TAG	2	6	280839	280844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483617
5539	NC_017044	TTAT	2	8	280866	280873	25 %	75 %	0 %	0 %	383483617
5540	NC_017044	CCGTG	2	10	280874	280883	0 %	20 %	40 %	40 %	383483617
5541	NC_017044	GAG	2	6	280912	280917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383483617
5542	NC_017044	GAA	2	6	280927	280932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483617
5543	NC_017044	GAA	2	6	280981	280986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483617
5544	NC_017044	GCGGTA	2	12	281060	281071	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383483617
5545	NC_017044	GTC	2	6	281107	281112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483617
5546	NC_017044	GAT	2	6	281134	281139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483617
5547	NC_017044	GCG	2	6	281219	281224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383483617
5548	NC_017044	GAT	2	6	281242	281247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483617
5549	NC_017044	GTCT	2	8	281262	281269	0 %	50 %	25 %	25 %	383483617
5550	NC_017044	CTG	2	6	281285	281290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483617
5551	NC_017044	GAA	2	6	281296	281301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483617
5552	NC_017044	TCTA	2	8	281967	281974	25 %	50 %	0 %	25 %	383483618
5553	NC_017044	ATT	2	6	281988	281993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483618
5554	NC_017044	ATT	2	6	282004	282009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483618
5555	NC_017044	TGT	2	6	282030	282035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483618
5556	NC_017044	TTTA	2	8	282758	282765	25 %	75 %	0 %	0 %	383483619
5557	NC_017044	ATT	2	6	282766	282771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483619
5558	NC_017044	AGC	2	6	282806	282811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483619
5559	NC_017044	GGT	2	6	282819	282824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383483619
5560	NC_017044	ATT	2	6	282828	282833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483619
5561	NC_017044	ATG	2	6	282879	282884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483619
5562	NC_017044	GATA	2	8	282968	282975	50 %	25 %	25 %	0 %	383483619
5563	NC_017044	AT	4	8	282976	282983	50 %	50 %	0 %	0 %	383483619
5564	NC_017044	ATT	2	6	283103	283108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483620
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5568	NC_017044	ATT	3	9	283232	283240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483620
5569	NC_017044	T	6	6	283239	283244	0 %	100 %	0 %	0 %	383483620
5570	NC_017044	GAA	2	6	283247	283252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483620
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5579	NC_017044	T	8	8	283640	283647	0 %	100 %	0 %	0 %	383483622
5580	NC_017044	TAA	2	6	283694	283699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483622
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5587	NC_017044	TGA	2	6	284017	284022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483623
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5589	NC_017044	GCA	2	6	284129	284134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483623
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5592	NC_017044	TGAT	2	8	284439	284446	25 %	50 %	25 %	0 %	383483623
5593	NC_017044	GTA	2	6	284471	284476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483623
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5595	NC_017044	A	6	6	284560	284565	100 %	0 %	0 %	0 %	383483624
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5597	NC_017044	ACTTA	2	10	284628	284637	40 %	40 %	0 %	20 %	383483624
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5600	NC_017044	TAAT	2	8	284726	284733	50 %	50 %	0 %	0 %	383483624
5601	NC_017044	GTT	2	6	284755	284760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483624
5602	NC_017044	ATCC	3	12	284824	284835	25 %	25 %	0 %	50 %	383483624
5603	NC_017044	GAG	2	6	284852	284857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383483624
5604	NC_017044	CTC	2	6	284861	284866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383483624
5605	NC_017044	TAT	2	6	284877	284882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483624
5606	NC_017044	AGT	2	6	284899	284904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483624
5607	NC_017044	GTAT	2	8	284905	284912	25 %	50 %	25 %	0 %	383483624
5608	NC_017044	AT	3	6	284945	284950	50 %	50 %	0 %	0 %	383483624
5609	NC_017044	TGA	2	6	284951	284956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483624
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5611	NC_017044	AGA	2	6	284973	284978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483624
5612	NC_017044	AAT	2	6	284982	284987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483624
5613	NC_017044	GAA	2	6	284992	284997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483624
5614	NC_017044	CGGAG	2	10	285021	285030	20 %	0 %	60 %	20 %	383483624
5615	NC_017044	TTA	2	6	285031	285036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483624
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5617	NC_017044	AGA	2	6	285120	285125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483624
5618	NC_017044	AATT	2	8	285132	285139	50 %	50 %	0 %	0 %	383483624
5619	NC_017044	AAT	2	6	285222	285227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483624
5620	NC_017044	ATC	2	6	285260	285265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483624
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5995	NC_017044	TTCT	2	8	309989	309996	0 %	75 %	0 %	25 %	383483641
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6000	NC_017044	TGC	2	6	310098	310103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483641

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