MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia montanensis str. OSU 85-930 chromosome

Total Repeats: 24861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017043	TTA	2	6	1251	1256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482125
2	NC_017043	A	6	6	1332	1337	100 %	0 %	0 %	0 %	383482125
3	NC_017043	ATA	2	6	1413	1418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482125
4	NC_017043	AAG	2	6	1426	1431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482125
5	NC_017043	TGC	2	6	1466	1471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482125
6	NC_017043	GAG	2	6	1545	1550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383482125
7	NC_017043	GAT	2	6	1644	1649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482125
8	NC_017043	ATA	2	6	1699	1704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482125
9	NC_017043	TTA	2	6	1713	1718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482125
10	NC_017043	TCGGAT	2	12	1806	1817	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383482125
11	NC_017043	CCA	2	6	1838	1843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383482125
12	NC_017043	T	6	6	1920	1925	0 %	100 %	0 %	0 %	383482125
13	NC_017043	AGC	2	6	2085	2090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482125
14	NC_017043	ATA	2	6	2146	2151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482125
15	NC_017043	T	6	6	2169	2174	0 %	100 %	0 %	0 %	383482125
16	NC_017043	AGG	2	6	2237	2242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383482125
17	NC_017043	GAAAT	2	10	2249	2258	60 %	20 %	20 %	0 %	383482125
18	NC_017043	GATA	2	8	2356	2363	50 %	25 %	25 %	0 %	383482126
19	NC_017043	GCG	2	6	2366	2371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383482126
20	NC_017043	AT	3	6	2395	2400	50 %	50 %	0 %	0 %	383482126
21	NC_017043	TGC	2	6	2469	2474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482126
22	NC_017043	AGT	2	6	2515	2520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482126
23	NC_017043	TTA	2	6	2577	2582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482126
24	NC_017043	A	6	6	2589	2594	100 %	0 %	0 %	0 %	383482126
25	NC_017043	GA	3	6	2682	2687	50 %	0 %	50 %	0 %	383482126
26	NC_017043	GAT	2	6	2711	2716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482126
27	NC_017043	TTA	2	6	2727	2732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482126
28	NC_017043	GTG	2	6	2748	2753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383482126
29	NC_017043	AGC	2	6	2788	2793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482126
30	NC_017043	AGGAAT	2	12	2797	2808	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383482126
31	NC_017043	ATTT	2	8	2845	2852	25 %	75 %	0 %	0 %	383482126
32	NC_017043	AAG	2	6	2880	2885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482126
33	NC_017043	AG	3	6	2906	2911	50 %	0 %	50 %	0 %	383482126
34	NC_017043	A	6	6	2923	2928	100 %	0 %	0 %	0 %	383482126
35	NC_017043	ATT	2	6	2956	2961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482126
36	NC_017043	A	6	6	2962	2967	100 %	0 %	0 %	0 %	383482126
37	NC_017043	ATGC	2	8	3038	3045	25 %	25 %	25 %	25 %	383482126
38	NC_017043	CGA	2	6	3106	3111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482126
39	NC_017043	ACA	2	6	3124	3129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383482126
40	NC_017043	GCT	2	6	3146	3151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482126
41	NC_017043	TTAC	2	8	3206	3213	25 %	50 %	0 %	25 %	383482126
42	NC_017043	TAG	2	6	3283	3288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482126
43	NC_017043	ATA	2	6	3297	3302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482126
44	NC_017043	TAATA	2	10	3307	3316	60 %	40 %	0 %	0 %	383482126
45	NC_017043	GCT	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482126
46	NC_017043	AGT	2	6	3493	3498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482126
47	NC_017043	A	8	8	3522	3529	100 %	0 %	0 %	0 %	383482126
48	NC_017043	A	6	6	3558	3563	100 %	0 %	0 %	0 %	383482126
49	NC_017043	AATTA	2	10	3571	3580	60 %	40 %	0 %	0 %	383482126
50	NC_017043	TAAA	2	8	3606	3613	75 %	25 %	0 %	0 %	383482126
51	NC_017043	TTA	2	6	3621	3626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482126
52	NC_017043	CTT	2	6	3663	3668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482126
53	NC_017043	AGA	2	6	3691	3696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482126
54	NC_017043	GAA	2	6	3704	3709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482126
55	NC_017043	AG	3	6	3739	3744	50 %	0 %	50 %	0 %	383482126
56	NC_017043	ATA	3	9	3771	3779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482126
57	NC_017043	AG	3	6	3785	3790	50 %	0 %	50 %	0 %	383482126
58	NC_017043	AGCA	2	8	3823	3830	50 %	0 %	25 %	25 %	383482126
59	NC_017043	ATG	2	6	3837	3842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482126
60	NC_017043	GTA	2	6	3845	3850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482126
61	NC_017043	AGT	2	6	3866	3871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482126
62	NC_017043	GTT	2	6	3883	3888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383482126
63	NC_017043	AGA	2	6	3901	3906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482126
64	NC_017043	CTA	2	6	3954	3959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482126
65	NC_017043	AGTA	2	8	3982	3989	50 %	25 %	25 %	0 %	383482126
66	NC_017043	T	7	7	4021	4027	0 %	100 %	0 %	0 %	383482126
67	NC_017043	ATA	3	9	4098	4106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482126
68	NC_017043	ATG	2	6	4134	4139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482126
69	NC_017043	CTAT	2	8	4187	4194	25 %	50 %	0 %	25 %	383482126
70	NC_017043	CAA	2	6	4209	4214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383482126
71	NC_017043	ATC	2	6	4239	4244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482126
72	NC_017043	TTA	2	6	4280	4285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482126
73	NC_017043	TTG	2	6	4458	4463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383482126
74	NC_017043	ATA	2	6	4487	4492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482126
75	NC_017043	AT	3	6	4495	4500	50 %	50 %	0 %	0 %	383482126
76	NC_017043	TAA	2	6	4510	4515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482126
77	NC_017043	TAT	2	6	4536	4541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482126
78	NC_017043	A	6	6	4577	4582	100 %	0 %	0 %	0 %	383482126
79	NC_017043	GAT	2	6	4613	4618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482126
80	NC_017043	TGC	2	6	4666	4671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482126
81	NC_017043	GTT	2	6	4773	4778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383482127
82	NC_017043	GTAAT	2	10	4786	4795	40 %	40 %	20 %	0 %	383482127
83	NC_017043	CTA	2	6	4852	4857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482127
84	NC_017043	A	6	6	4879	4884	100 %	0 %	0 %	0 %	383482127
85	NC_017043	A	6	6	5015	5020	100 %	0 %	0 %	0 %	383482127
86	NC_017043	ATTTA	2	10	5027	5036	40 %	60 %	0 %	0 %	383482127
87	NC_017043	AATCG	2	10	5126	5135	40 %	20 %	20 %	20 %	383482127
88	NC_017043	TTTA	2	8	5185	5192	25 %	75 %	0 %	0 %	383482127
89	NC_017043	A	6	6	5302	5307	100 %	0 %	0 %	0 %	383482127
90	NC_017043	TTA	2	6	5370	5375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482127
91	NC_017043	TAT	2	6	5414	5419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482127
92	NC_017043	AGC	3	9	5475	5483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482127
93	NC_017043	TAAT	2	8	5494	5501	50 %	50 %	0 %	0 %	383482127
94	NC_017043	ATA	2	6	5538	5543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482127
95	NC_017043	TTA	2	6	5638	5643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482127
96	NC_017043	TTC	2	6	5645	5650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482127
97	NC_017043	ATA	2	6	5677	5682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482127
98	NC_017043	TGA	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482127
99	NC_017043	TAG	2	6	5755	5760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482127
100	NC_017043	TTA	2	6	5794	5799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482127
101	NC_017043	GTC	2	6	5829	5834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482127
102	NC_017043	AT	3	6	5870	5875	50 %	50 %	0 %	0 %	383482128
103	NC_017043	TAG	2	6	5943	5948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482128
104	NC_017043	TAT	2	6	5958	5963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482128
105	NC_017043	TTA	2	6	6017	6022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482128
106	NC_017043	ATTT	2	8	6049	6056	25 %	75 %	0 %	0 %	383482128
107	NC_017043	AAAT	3	12	6062	6073	75 %	25 %	0 %	0 %	383482128
108	NC_017043	GAA	2	6	6230	6235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482129
109	NC_017043	ATT	2	6	6245	6250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482129
110	NC_017043	T	6	6	6249	6254	0 %	100 %	0 %	0 %	383482129
111	NC_017043	GAA	2	6	6354	6359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482129
112	NC_017043	CTA	2	6	6397	6402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482129
113	NC_017043	AGG	2	6	6410	6415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383482129
114	NC_017043	TAA	2	6	6422	6427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482129
115	NC_017043	AGC	2	6	6440	6445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482129
116	NC_017043	CTC	2	6	6466	6471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383482129
117	NC_017043	CGG	2	6	6491	6496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383482129
118	NC_017043	ATT	2	6	6501	6506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482129
119	NC_017043	AT	3	6	6556	6561	50 %	50 %	0 %	0 %	383482129
120	NC_017043	TTA	2	6	6562	6567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482129
121	NC_017043	TAA	2	6	6577	6582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482129
122	NC_017043	GAA	2	6	6612	6617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482129
123	NC_017043	AT	5	10	6706	6715	50 %	50 %	0 %	0 %	383482129
124	NC_017043	TAA	2	6	6729	6734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482129
125	NC_017043	GCA	2	6	6882	6887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482130
126	NC_017043	AAG	2	6	6896	6901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482130
127	NC_017043	TGC	2	6	6959	6964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482130
128	NC_017043	A	6	6	7113	7118	100 %	0 %	0 %	0 %	383482130
129	NC_017043	A	7	7	7131	7137	100 %	0 %	0 %	0 %	383482130
130	NC_017043	AGC	2	6	7169	7174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482130
131	NC_017043	AG	3	6	7207	7212	50 %	0 %	50 %	0 %	383482130
132	NC_017043	TAT	2	6	7234	7239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482130
133	NC_017043	ATA	2	6	7325	7330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482130
134	NC_017043	GAA	2	6	7438	7443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482130
135	NC_017043	TTTCA	2	10	7534	7543	20 %	60 %	0 %	20 %	383482130
136	NC_017043	ACT	2	6	7564	7569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482130
137	NC_017043	ATC	2	6	7634	7639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482130
138	NC_017043	ATA	2	6	7642	7647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482130
139	NC_017043	AAGG	2	8	7738	7745	50 %	0 %	50 %	0 %	383482130
140	NC_017043	TTA	3	9	7802	7810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482130
141	NC_017043	TAAT	2	8	7973	7980	50 %	50 %	0 %	0 %	383482130
142	NC_017043	AAG	2	6	8021	8026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482130
143	NC_017043	TCCTAT	2	12	8121	8132	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383482130
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145	NC_017043	ATC	3	9	8234	8242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482130
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147	NC_017043	ATC	2	6	8322	8327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482130
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149	NC_017043	AT	3	6	8412	8417	50 %	50 %	0 %	0 %	383482130
150	NC_017043	GGC	2	6	8419	8424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383482130
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153	NC_017043	TGC	2	6	8540	8545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482130
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157	NC_017043	AAAG	2	8	8623	8630	75 %	0 %	25 %	0 %	383482130
158	NC_017043	AAT	2	6	8632	8637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482130
159	NC_017043	AGT	2	6	8640	8645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482130
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161	NC_017043	TAA	2	6	8817	8822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482130
162	NC_017043	GAT	2	6	8860	8865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482130
163	NC_017043	TAA	2	6	8880	8885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482130
164	NC_017043	CTG	2	6	8996	9001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482130
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249	NC_017043	A	6	6	13596	13601	100 %	0 %	0 %	0 %	383482137
250	NC_017043	TTGAT	3	15	13705	13719	20 %	60 %	20 %	0 %	383482137
251	NC_017043	A	6	6	13726	13731	100 %	0 %	0 %	0 %	383482137
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255	NC_017043	ATTTT	2	10	13866	13875	20 %	80 %	0 %	0 %	383482137
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257	NC_017043	TTA	2	6	13980	13985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482137
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259	NC_017043	TC	3	6	14035	14040	0 %	50 %	0 %	50 %	383482137
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263	NC_017043	AAT	2	6	14202	14207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482137
264	NC_017043	TAA	2	6	14342	14347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482137
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