MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia montanensis str. OSU 85-930 chromosome

Total Repeats: 24861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017043	GCA	2	6	201558	201563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482331
4002	NC_017043	T	6	6	201605	201610	0 %	100 %	0 %	0 %	383482332
4003	NC_017043	CTTT	2	8	201612	201619	0 %	75 %	0 %	25 %	383482332
4004	NC_017043	T	6	6	201617	201622	0 %	100 %	0 %	0 %	383482332
4005	NC_017043	GCT	2	6	201642	201647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482332
4006	NC_017043	AGT	2	6	201666	201671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482332
4007	NC_017043	TCT	2	6	201741	201746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482332
4008	NC_017043	TAA	2	6	201832	201837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482332
4009	NC_017043	CAT	3	9	201841	201849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482332
4010	NC_017043	T	6	6	201974	201979	0 %	100 %	0 %	0 %	383482332
4011	NC_017043	CAT	2	6	202188	202193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482333
4012	NC_017043	GTA	2	6	202273	202278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482333
4013	NC_017043	GGA	2	6	202386	202391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383482333
4014	NC_017043	TTAAAT	2	12	202448	202459	50 %	50 %	0 %	0 %	383482333
4015	NC_017043	TAAA	2	8	202491	202498	75 %	25 %	0 %	0 %	383482333
4016	NC_017043	TAT	2	6	202520	202525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482333
4017	NC_017043	CAG	2	6	202592	202597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482333
4018	NC_017043	CT	3	6	202649	202654	0 %	50 %	0 %	50 %	383482333
4019	NC_017043	T	6	6	202698	202703	0 %	100 %	0 %	0 %	383482333
4020	NC_017043	A	8	8	202830	202837	100 %	0 %	0 %	0 %	383482333
4021	NC_017043	AAC	2	6	202881	202886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383482333
4022	NC_017043	ATT	2	6	202896	202901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482333
4023	NC_017043	ACC	2	6	202903	202908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383482333
4024	NC_017043	T	6	6	202945	202950	0 %	100 %	0 %	0 %	383482333
4025	NC_017043	ATT	2	6	202966	202971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482333
4026	NC_017043	CTT	2	6	203009	203014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482333
4027	NC_017043	TAA	2	6	203066	203071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482333
4028	NC_017043	GTT	2	6	203121	203126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383482333
4029	NC_017043	AAT	2	6	203151	203156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482333
4030	NC_017043	GTA	2	6	203269	203274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482333
4031	NC_017043	GTC	2	6	203317	203322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482333
4032	NC_017043	AT	4	8	203335	203342	50 %	50 %	0 %	0 %	383482333
4033	NC_017043	CTTCCC	2	12	203585	203596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383482334
4034	NC_017043	GTA	2	6	203734	203739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482334
4035	NC_017043	TTA	2	6	203758	203763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482334
4036	NC_017043	T	7	7	203787	203793	0 %	100 %	0 %	0 %	383482334
4037	NC_017043	T	6	6	203796	203801	0 %	100 %	0 %	0 %	383482334
4038	NC_017043	TA	3	6	203832	203837	50 %	50 %	0 %	0 %	383482334
4039	NC_017043	TGTC	2	8	203852	203859	0 %	50 %	25 %	25 %	383482334
4040	NC_017043	CTC	2	6	203936	203941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383482334
4041	NC_017043	AGC	2	6	203985	203990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482334
4042	NC_017043	ACC	2	6	203991	203996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383482334
4043	NC_017043	C	6	6	204000	204005	0 %	0 %	0 %	100 %	383482334
4044	NC_017043	T	6	6	204114	204119	0 %	100 %	0 %	0 %	383482334
4045	NC_017043	ATT	2	6	204165	204170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482334
4046	NC_017043	ATT	2	6	204175	204180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482334
4047	NC_017043	T	6	6	204192	204197	0 %	100 %	0 %	0 %	383482334
4048	NC_017043	AAC	2	6	204217	204222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383482334
4049	NC_017043	TCT	2	6	204223	204228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482334
4050	NC_017043	ATT	2	6	204361	204366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482334
4051	NC_017043	ATT	2	6	204369	204374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482334
4052	NC_017043	TGA	2	6	204387	204392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482334
4053	NC_017043	GAT	2	6	204418	204423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482334
4054	NC_017043	GCC	2	6	204439	204444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383482334
4055	NC_017043	TGA	2	6	204504	204509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482334
4056	NC_017043	TTA	2	6	204536	204541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482334
4057	NC_017043	AGT	2	6	204570	204575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482334
4058	NC_017043	AT	3	6	204591	204596	50 %	50 %	0 %	0 %	383482334
4059	NC_017043	AT	3	6	204598	204603	50 %	50 %	0 %	0 %	383482334
4060	NC_017043	AAT	2	6	204646	204651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482335
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4062	NC_017043	ATA	2	6	204777	204782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482335
4063	NC_017043	TCT	2	6	204798	204803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482335
4064	NC_017043	T	6	6	204863	204868	0 %	100 %	0 %	0 %	383482335
4065	NC_017043	AT	3	6	204904	204909	50 %	50 %	0 %	0 %	383482335
4066	NC_017043	TTCA	2	8	204926	204933	25 %	50 %	0 %	25 %	383482335
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4070	NC_017043	TGTT	2	8	205493	205500	0 %	75 %	25 %	0 %	383482336
4071	NC_017043	GAA	2	6	205531	205536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482336
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4074	NC_017043	CT	3	6	205590	205595	0 %	50 %	0 %	50 %	383482336
4075	NC_017043	T	6	6	205621	205626	0 %	100 %	0 %	0 %	383482336
4076	NC_017043	T	6	6	205651	205656	0 %	100 %	0 %	0 %	383482336
4077	NC_017043	TAATA	2	10	207122	207131	60 %	40 %	0 %	0 %	383482337
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4082	NC_017043	ATA	2	6	207283	207288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482337
4083	NC_017043	AAAT	4	16	207306	207321	75 %	25 %	0 %	0 %	383482337
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4090	NC_017043	TAA	2	6	208769	208774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482339
4091	NC_017043	GAAA	2	8	208827	208834	75 %	0 %	25 %	0 %	383482339
4092	NC_017043	CTA	2	6	208992	208997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482339
4093	NC_017043	TAA	2	6	209000	209005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482339
4094	NC_017043	TAC	2	6	209010	209015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482339
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4096	NC_017043	TAAT	2	8	209050	209057	50 %	50 %	0 %	0 %	383482339
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4100	NC_017043	AC	3	6	209189	209194	50 %	0 %	0 %	50 %	383482339
4101	NC_017043	A	6	6	209224	209229	100 %	0 %	0 %	0 %	383482339
4102	NC_017043	TAC	2	6	209258	209263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482339
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4104	NC_017043	AGAT	2	8	209555	209562	50 %	25 %	25 %	0 %	383482340
4105	NC_017043	AACA	2	8	209592	209599	75 %	0 %	0 %	25 %	383482340
4106	NC_017043	TAG	2	6	209840	209845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482341
4107	NC_017043	GA	3	6	209857	209862	50 %	0 %	50 %	0 %	383482341
4108	NC_017043	AAATA	2	10	209871	209880	80 %	20 %	0 %	0 %	383482341
4109	NC_017043	ATT	2	6	209896	209901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482341
4110	NC_017043	TGGAA	2	10	209913	209922	40 %	20 %	40 %	0 %	383482341
4111	NC_017043	TAT	2	6	209952	209957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482341
4112	NC_017043	ATA	2	6	209983	209988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482341
4113	NC_017043	TC	3	6	209991	209996	0 %	50 %	0 %	50 %	383482341
4114	NC_017043	TATTT	2	10	210145	210154	20 %	80 %	0 %	0 %	383482341
4115	NC_017043	TAT	2	6	210411	210416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482342
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4118	NC_017043	TCT	2	6	210546	210551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482342
4119	NC_017043	ATT	2	6	210576	210581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482342
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4121	NC_017043	ATCTT	2	10	210678	210687	20 %	60 %	0 %	20 %	383482342
4122	NC_017043	ATT	2	6	210702	210707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482342
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4124	NC_017043	AAT	2	6	210745	210750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482342
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4241	NC_017043	CAA	3	9	215701	215709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383482345
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4243	NC_017043	TCT	2	6	215786	215791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482345
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4246	NC_017043	A	6	6	216045	216050	100 %	0 %	0 %	0 %	383482346
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4486	NC_017043	GAA	2	6	227725	227730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482353
4487	NC_017043	CTAA	2	8	227770	227777	50 %	25 %	0 %	25 %	383482353
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4491	NC_017043	TGAT	2	8	227864	227871	25 %	50 %	25 %	0 %	383482353
4492	NC_017043	ATC	2	6	227901	227906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482353
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