MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP chromosome

Total Repeats: 24251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017042	TATT	2	8	47	54	25 %	75 %	0 %	0 %	383480871
2	NC_017042	T	9	9	103	111	0 %	100 %	0 %	0 %	383480871
3	NC_017042	CGC	2	6	225	230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383480871
4	NC_017042	ATC	2	6	268	273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480871
5	NC_017042	ACA	2	6	356	361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383480871
6	NC_017042	TAT	2	6	372	377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480872
7	NC_017042	ATATA	2	10	434	443	60 %	40 %	0 %	0 %	383480872
8	NC_017042	TAA	2	6	448	453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480872
9	NC_017042	AAT	2	6	593	598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480872
10	NC_017042	AGA	2	6	599	604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480872
11	NC_017042	TAT	2	6	625	630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480872
12	NC_017042	TAA	2	6	646	651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480872
13	NC_017042	ATA	2	6	664	669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480872
14	NC_017042	ATA	2	6	673	678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480872
15	NC_017042	CCA	2	6	710	715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383480872
16	NC_017042	ACTAA	2	10	753	762	60 %	20 %	0 %	20 %	383480872
17	NC_017042	AAAGTA	2	12	765	776	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383480872
18	NC_017042	TAG	2	6	817	822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480872
19	NC_017042	TGC	2	6	851	856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383480872
20	NC_017042	AAG	2	6	886	891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480872
21	NC_017042	ACAT	2	8	903	910	50 %	25 %	0 %	25 %	383480872
22	NC_017042	TAAA	2	8	962	969	75 %	25 %	0 %	0 %	383480872
23	NC_017042	ATC	2	6	978	983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480872
24	NC_017042	TAT	2	6	1013	1018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480872
25	NC_017042	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480872
26	NC_017042	TCA	2	6	1108	1113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480873
27	NC_017042	A	6	6	1146	1151	100 %	0 %	0 %	0 %	383480873
28	NC_017042	TA	3	6	1193	1198	50 %	50 %	0 %	0 %	383480873
29	NC_017042	ACT	2	6	1221	1226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480873
30	NC_017042	CA	3	6	1322	1327	50 %	0 %	0 %	50 %	383480873
31	NC_017042	CAT	2	6	1355	1360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480873
32	NC_017042	AGA	2	6	1377	1382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480873
33	NC_017042	AAT	2	6	1410	1415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480873
34	NC_017042	T	6	6	1438	1443	0 %	100 %	0 %	0 %	383480873
35	NC_017042	TAT	3	9	1451	1459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480873
36	NC_017042	AAT	2	6	1470	1475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480873
37	NC_017042	A	6	6	1567	1572	100 %	0 %	0 %	0 %	383480873
38	NC_017042	TTA	2	6	1573	1578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480873
39	NC_017042	CTT	2	6	1586	1591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480873
40	NC_017042	AT	3	6	1601	1606	50 %	50 %	0 %	0 %	383480873
41	NC_017042	TTC	2	6	1624	1629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480874
42	NC_017042	TGG	2	6	1646	1651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383480874
43	NC_017042	ATT	2	6	1655	1660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480874
44	NC_017042	TTA	2	6	1826	1831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480874
45	NC_017042	T	6	6	1845	1850	0 %	100 %	0 %	0 %	383480874
46	NC_017042	CTA	2	6	1878	1883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480874
47	NC_017042	TAAA	2	8	1902	1909	75 %	25 %	0 %	0 %	383480874
48	NC_017042	AAG	2	6	1914	1919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480874
49	NC_017042	AT	4	8	1926	1933	50 %	50 %	0 %	0 %	383480874
50	NC_017042	AAT	2	6	1952	1957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480874
51	NC_017042	AC	3	6	1964	1969	50 %	0 %	0 %	50 %	383480874
52	NC_017042	AAT	2	6	1974	1979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480874
53	NC_017042	TTAG	2	8	2012	2019	25 %	50 %	25 %	0 %	383480874
54	NC_017042	AAT	2	6	2031	2036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480874
55	NC_017042	T	7	7	2070	2076	0 %	100 %	0 %	0 %	383480874
56	NC_017042	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480874
57	NC_017042	ATAC	3	12	2120	2131	50 %	25 %	0 %	25 %	383480874
58	NC_017042	AGT	2	6	2137	2142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480874
59	NC_017042	GTTTT	2	10	2163	2172	0 %	80 %	20 %	0 %	383480874
60	NC_017042	GAA	2	6	2192	2197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480874
61	NC_017042	A	7	7	2206	2212	100 %	0 %	0 %	0 %	383480874
62	NC_017042	A	6	6	2241	2246	100 %	0 %	0 %	0 %	383480874
63	NC_017042	T	6	6	2262	2267	0 %	100 %	0 %	0 %	383480874
64	NC_017042	GAT	4	12	2280	2291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480874
65	NC_017042	CGG	2	6	2293	2298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383480874
66	NC_017042	TAA	2	6	2328	2333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480874
67	NC_017042	AGG	2	6	2334	2339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383480874
68	NC_017042	AAG	2	6	2367	2372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480874
69	NC_017042	GATT	2	8	2377	2384	25 %	50 %	25 %	0 %	383480874
70	NC_017042	AAC	2	6	2395	2400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383480874
71	NC_017042	TAAT	2	8	2427	2434	50 %	50 %	0 %	0 %	383480874
72	NC_017042	GTA	2	6	2438	2443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480874
73	NC_017042	ATAA	2	8	2448	2455	75 %	25 %	0 %	0 %	383480874
74	NC_017042	TTA	2	6	2466	2471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480874
75	NC_017042	TAT	2	6	2705	2710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480875
76	NC_017042	CTT	2	6	2797	2802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480875
77	NC_017042	TTG	2	6	2858	2863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383480875
78	NC_017042	GTAGGT	2	12	2866	2877	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383480875
79	NC_017042	TGG	2	6	2898	2903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383480875
80	NC_017042	AGA	2	6	2935	2940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480875
81	NC_017042	AG	3	6	2960	2965	50 %	0 %	50 %	0 %	383480875
82	NC_017042	GTA	2	6	2987	2992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480875
83	NC_017042	TAA	2	6	3042	3047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480875
84	NC_017042	ACA	2	6	3114	3119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383480875
85	NC_017042	ATGC	2	8	3134	3141	25 %	25 %	25 %	25 %	383480875
86	NC_017042	GAT	2	6	3443	3448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480876
87	NC_017042	CAT	2	6	3491	3496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480876
88	NC_017042	AT	3	6	3503	3508	50 %	50 %	0 %	0 %	383480876
89	NC_017042	ATAG	2	8	3548	3555	50 %	25 %	25 %	0 %	383480876
90	NC_017042	ATA	2	6	3573	3578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480876
91	NC_017042	A	8	8	3588	3595	100 %	0 %	0 %	0 %	383480876
92	NC_017042	CGG	2	6	3598	3603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383480876
93	NC_017042	T	8	8	3637	3644	0 %	100 %	0 %	0 %	383480876
94	NC_017042	A	6	6	3874	3879	100 %	0 %	0 %	0 %	383480877
95	NC_017042	TAA	2	6	3885	3890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480877
96	NC_017042	ATAA	2	8	3898	3905	75 %	25 %	0 %	0 %	383480877
97	NC_017042	A	8	8	3922	3929	100 %	0 %	0 %	0 %	383480877
98	NC_017042	ACT	2	6	3937	3942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480877
99	NC_017042	GCG	2	6	4013	4018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383480877
100	NC_017042	A	7	7	4098	4104	100 %	0 %	0 %	0 %	383480877
101	NC_017042	TAA	2	6	4134	4139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480877
102	NC_017042	AGG	2	6	4209	4214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383480877
103	NC_017042	TAA	2	6	4251	4256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480877
104	NC_017042	ATT	2	6	4267	4272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480877
105	NC_017042	CAA	2	6	4309	4314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383480877
106	NC_017042	TTA	2	6	4328	4333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480877
107	NC_017042	ATTT	2	8	4382	4389	25 %	75 %	0 %	0 %	383480877
108	NC_017042	TAA	2	6	4394	4399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480877
109	NC_017042	A	6	6	4398	4403	100 %	0 %	0 %	0 %	383480877
110	NC_017042	CAC	2	6	4516	4521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383480877
111	NC_017042	AT	3	6	6002	6007	50 %	50 %	0 %	0 %	383480878
112	NC_017042	ATTT	2	8	6025	6032	25 %	75 %	0 %	0 %	383480878
113	NC_017042	A	6	6	6041	6046	100 %	0 %	0 %	0 %	383480878
114	NC_017042	TAAAT	2	10	6077	6086	60 %	40 %	0 %	0 %	383480878
115	NC_017042	T	6	6	6179	6184	0 %	100 %	0 %	0 %	383480878
116	NC_017042	ATT	2	6	6233	6238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480879
117	NC_017042	TAA	2	6	6276	6281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480879
118	NC_017042	T	7	7	6284	6290	0 %	100 %	0 %	0 %	383480879
119	NC_017042	T	6	6	6326	6331	0 %	100 %	0 %	0 %	383480879
120	NC_017042	CAT	2	6	6338	6343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480879
121	NC_017042	ATT	2	6	6363	6368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480879
122	NC_017042	TAA	2	6	6372	6377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480879
123	NC_017042	TTA	2	6	6403	6408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480879
124	NC_017042	TA	3	6	6419	6424	50 %	50 %	0 %	0 %	383480879
125	NC_017042	AAT	2	6	6442	6447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480879
126	NC_017042	T	6	6	6477	6482	0 %	100 %	0 %	0 %	383480880
127	NC_017042	TCT	2	6	6510	6515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480880
128	NC_017042	T	6	6	6544	6549	0 %	100 %	0 %	0 %	383480880
129	NC_017042	T	6	6	6575	6580	0 %	100 %	0 %	0 %	383480880
130	NC_017042	TTC	2	6	6600	6605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480880
131	NC_017042	T	6	6	6611	6616	0 %	100 %	0 %	0 %	383480880
132	NC_017042	TTC	2	6	6626	6631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480880
133	NC_017042	TAA	2	6	6638	6643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480880
134	NC_017042	T	6	6	6652	6657	0 %	100 %	0 %	0 %	383480880
135	NC_017042	AAT	2	6	6974	6979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480881
136	NC_017042	CAA	2	6	7042	7047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383480881
137	NC_017042	TTA	2	6	7071	7076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480881
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156	NC_017042	TA	3	6	7714	7719	50 %	50 %	0 %	0 %	383480881
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266	NC_017042	TCAGAT	2	12	13750	13761	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383480888
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