MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP chromosome

Total Repeats: 24251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23502	NC_017042	TGC	2	6	1243350	1243355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482085
23503	NC_017042	AT	3	6	1243471	1243476	50 %	50 %	0 %	0 %	383482085
23504	NC_017042	CCTG	2	8	1243489	1243496	0 %	25 %	25 %	50 %	383482085
23505	NC_017042	AGC	2	6	1243554	1243559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482085
23506	NC_017042	TCT	2	6	1243623	1243628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482085
23507	NC_017042	TAA	2	6	1243632	1243637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482085
23508	NC_017042	CTTA	2	8	1243665	1243672	25 %	50 %	0 %	25 %	383482085
23509	NC_017042	ATC	2	6	1243674	1243679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482085
23510	NC_017042	ATAA	2	8	1243680	1243687	75 %	25 %	0 %	0 %	383482085
23511	NC_017042	GTGC	2	8	1243691	1243698	0 %	25 %	50 %	25 %	383482085
23512	NC_017042	TAC	2	6	1243727	1243732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482085
23513	NC_017042	TCT	2	6	1243819	1243824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482085
23514	NC_017042	T	7	7	1243827	1243833	0 %	100 %	0 %	0 %	383482085
23515	NC_017042	TAA	2	6	1243931	1243936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482085
23516	NC_017042	ATT	2	6	1243981	1243986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482085
23517	NC_017042	CT	3	6	1243989	1243994	0 %	50 %	0 %	50 %	383482085
23518	NC_017042	TTCT	2	8	1244066	1244073	0 %	75 %	0 %	25 %	383482085
23519	NC_017042	CAA	2	6	1244159	1244164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383482085
23520	NC_017042	CTT	2	6	1244204	1244209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482085
23521	NC_017042	ATC	2	6	1244247	1244252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482085
23522	NC_017042	CTA	2	6	1244324	1244329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482085
23523	NC_017042	TTA	2	6	1244387	1244392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482085
23524	NC_017042	CAAT	2	8	1244422	1244429	50 %	25 %	0 %	25 %	383482085
23525	NC_017042	GCA	2	6	1244651	1244656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482086
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23528	NC_017042	CTAT	2	8	1244762	1244769	25 %	50 %	0 %	25 %	383482086
23529	NC_017042	ATA	2	6	1244775	1244780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482086
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23531	NC_017042	TAT	2	6	1244904	1244909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482086
23532	NC_017042	CTA	2	6	1244916	1244921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482086
23533	NC_017042	T	6	6	1244948	1244953	0 %	100 %	0 %	0 %	383482086
23534	NC_017042	CAATAA	2	12	1244956	1244967	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383482086
23535	NC_017042	A	6	6	1244966	1244971	100 %	0 %	0 %	0 %	383482086
23536	NC_017042	T	6	6	1244999	1245004	0 %	100 %	0 %	0 %	383482086
23537	NC_017042	CT	3	6	1245064	1245069	0 %	50 %	0 %	50 %	383482086
23538	NC_017042	TTC	2	6	1245112	1245117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482086
23539	NC_017042	ATCTT	2	10	1245122	1245131	20 %	60 %	0 %	20 %	383482086
23540	NC_017042	TAT	2	6	1245135	1245140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482086
23541	NC_017042	TTA	2	6	1245152	1245157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482086
23542	NC_017042	AATTA	2	10	1245181	1245190	60 %	40 %	0 %	0 %	383482086
23543	NC_017042	TA	3	6	1245364	1245369	50 %	50 %	0 %	0 %	383482087
23544	NC_017042	CAT	2	6	1245408	1245413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482087
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23546	NC_017042	T	6	6	1245475	1245480	0 %	100 %	0 %	0 %	383482087
23547	NC_017042	TTAA	2	8	1245571	1245578	50 %	50 %	0 %	0 %	383482087
23548	NC_017042	TGC	3	9	1245663	1245671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482087
23549	NC_017042	GCG	2	6	1245698	1245703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383482087
23550	NC_017042	TTA	2	6	1245733	1245738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482087
23551	NC_017042	AAT	2	6	1245777	1245782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482087
23552	NC_017042	GCTT	2	8	1245792	1245799	0 %	50 %	25 %	25 %	383482087
23553	NC_017042	CGC	2	6	1245852	1245857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383482087
23554	NC_017042	AGT	2	6	1245876	1245881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482087
23555	NC_017042	TA	3	6	1245882	1245887	50 %	50 %	0 %	0 %	383482087
23556	NC_017042	CTAACT	2	12	1245998	1246009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482087
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23558	NC_017042	TTAA	2	8	1246042	1246049	50 %	50 %	0 %	0 %	383482087
23559	NC_017042	TAA	2	6	1246061	1246066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482087
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23586	NC_017042	CATTT	2	10	1247061	1247070	20 %	60 %	0 %	20 %	383482088
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23590	NC_017042	ATT	2	6	1247615	1247620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482089
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23599	NC_017042	AT	3	6	1248287	1248292	50 %	50 %	0 %	0 %	383482090
23600	NC_017042	A	8	8	1248377	1248384	100 %	0 %	0 %	0 %	383482091
23601	NC_017042	AT	3	6	1248399	1248404	50 %	50 %	0 %	0 %	383482091
23602	NC_017042	TGA	2	6	1248405	1248410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482091
23603	NC_017042	TGC	2	6	1248429	1248434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482091
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23607	NC_017042	TTA	2	6	1248818	1248823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482092
23608	NC_017042	CTGT	2	8	1248827	1248834	0 %	50 %	25 %	25 %	383482092
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23613	NC_017042	ATCA	2	8	1249570	1249577	50 %	25 %	0 %	25 %	383482094
23614	NC_017042	ATT	2	6	1249603	1249608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482094
23615	NC_017042	TAC	2	6	1249759	1249764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482094
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