MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP chromosome

Total Repeats: 24251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_017042	TCA	2	6	670231	670236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481521
13003	NC_017042	CAA	2	6	670262	670267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383481521
13004	NC_017042	CGC	2	6	670289	670294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383481521
13005	NC_017042	AC	3	6	670303	670308	50 %	0 %	0 %	50 %	383481521
13006	NC_017042	CTG	2	6	670328	670333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383481521
13007	NC_017042	ATA	2	6	670417	670422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481521
13008	NC_017042	TTCC	2	8	670532	670539	0 %	50 %	0 %	50 %	383481521
13009	NC_017042	TAC	3	9	670548	670556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481521
13010	NC_017042	AT	3	6	670614	670619	50 %	50 %	0 %	0 %	383481521
13011	NC_017042	TTTTGC	2	12	670641	670652	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383481521
13012	NC_017042	TAT	2	6	670664	670669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481521
13013	NC_017042	T	7	7	670805	670811	0 %	100 %	0 %	0 %	383481521
13014	NC_017042	TTA	2	6	670814	670819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481521
13015	NC_017042	TATCG	2	10	671002	671011	20 %	40 %	20 %	20 %	383481522
13016	NC_017042	TATTT	2	10	671019	671028	20 %	80 %	0 %	0 %	383481522
13017	NC_017042	TAT	2	6	671055	671060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481522
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13020	NC_017042	CTT	2	6	671231	671236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383481522
13021	NC_017042	ATT	2	6	671248	671253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481522
13022	NC_017042	CTT	2	6	671261	671266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383481522
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13025	NC_017042	TGC	2	6	671424	671429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383481522
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13030	NC_017042	TAA	2	6	671726	671731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481522
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13032	NC_017042	T	6	6	671744	671749	0 %	100 %	0 %	0 %	383481522
13033	NC_017042	CTT	2	6	671756	671761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383481522
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13037	NC_017042	CTT	2	6	671957	671962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383481522
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13040	NC_017042	ATTTA	2	10	672045	672054	40 %	60 %	0 %	0 %	383481522
13041	NC_017042	AAC	2	6	672087	672092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383481522
13042	NC_017042	TTTACC	2	12	672628	672639	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383481523
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13054	NC_017042	AAAC	2	8	673052	673059	75 %	0 %	0 %	25 %	383481524
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13058	NC_017042	TGCTT	2	10	673821	673830	0 %	60 %	20 %	20 %	383481525
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13061	NC_017042	CAA	2	6	673921	673926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383481525
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13102	NC_017042	T	6	6	675931	675936	0 %	100 %	0 %	0 %	383481526
13103	NC_017042	TTC	2	6	675941	675946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383481526
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13105	NC_017042	T	6	6	675989	675994	0 %	100 %	0 %	0 %	383481526
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13486	NC_017042	GTATAT	2	12	698967	698978	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383481546
13487	NC_017042	CCG	2	6	698988	698993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383481546
13488	NC_017042	TAA	2	6	698994	698999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481546
13489	NC_017042	GCT	2	6	699003	699008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383481546
13490	NC_017042	TAAA	2	8	699038	699045	75 %	25 %	0 %	0 %	383481546
13491	NC_017042	AAT	2	6	699063	699068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481546
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13493	NC_017042	A	8	8	699218	699225	100 %	0 %	0 %	0 %	383481546
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