MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP chromosome

Total Repeats: 24251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5021	NC_017042	TAG	2	6	261916	261921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481121
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5061	NC_017042	AATA	2	8	263624	263631	75 %	25 %	0 %	0 %	383481121
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5122	NC_017042	AGA	2	6	267022	267027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383481122
5123	NC_017042	TAAT	2	8	267029	267036	50 %	50 %	0 %	0 %	383481122
5124	NC_017042	AAT	2	6	267040	267045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481122
5125	NC_017042	ATA	2	6	267082	267087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481122
5126	NC_017042	A	6	6	267098	267103	100 %	0 %	0 %	0 %	383481122
5127	NC_017042	AAG	2	6	267113	267118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383481122
5128	NC_017042	GTC	2	6	267143	267148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383481122
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5131	NC_017042	A	7	7	267322	267328	100 %	0 %	0 %	0 %	383481122
5132	NC_017042	TTTA	2	8	267352	267359	25 %	75 %	0 %	0 %	383481122
5133	NC_017042	TGG	2	6	267413	267418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383481122
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5135	NC_017042	TG	3	6	267570	267575	0 %	50 %	50 %	0 %	383481122
5136	NC_017042	ATG	2	6	267664	267669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481122
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5138	NC_017042	GTC	2	6	267701	267706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383481122
5139	NC_017042	TAT	2	6	267745	267750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481122
5140	NC_017042	GAT	2	6	267786	267791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481122
5141	NC_017042	TA	3	6	267824	267829	50 %	50 %	0 %	0 %	383481122
5142	NC_017042	TAC	2	6	267915	267920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481122
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5144	NC_017042	TAA	2	6	267984	267989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481122
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5151	NC_017042	GA	3	6	268235	268240	50 %	0 %	50 %	0 %	383481122
5152	NC_017042	ATA	2	6	268244	268249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481122
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5156	NC_017042	ATG	2	6	268328	268333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481122
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5183	NC_017042	GTAGA	2	10	269672	269681	40 %	20 %	40 %	0 %	383481122
5184	NC_017042	TAT	3	9	269712	269720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481122
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5222	NC_017042	T	8	8	271640	271647	0 %	100 %	0 %	0 %	383481123
5223	NC_017042	TCT	2	6	271664	271669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383481123
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5226	NC_017042	ATG	2	6	271847	271852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481123
5227	NC_017042	TTAA	2	8	271876	271883	50 %	50 %	0 %	0 %	383481123
5228	NC_017042	AGTA	2	8	272063	272070	50 %	25 %	25 %	0 %	383481124
5229	NC_017042	TGAA	2	8	272089	272096	50 %	25 %	25 %	0 %	383481124
5230	NC_017042	ATC	2	6	272099	272104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481124
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5232	NC_017042	TGA	2	6	272132	272137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481124
5233	NC_017042	CAA	2	6	272175	272180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383481124
5234	NC_017042	CAT	2	6	272181	272186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481124
5235	NC_017042	GA	3	6	272239	272244	50 %	0 %	50 %	0 %	383481124
5236	NC_017042	TCCG	2	8	272255	272262	0 %	25 %	25 %	50 %	383481124
5237	NC_017042	ATA	2	6	272292	272297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481124
5238	NC_017042	GAA	2	6	272313	272318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383481124
5239	NC_017042	GGC	2	6	272349	272354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383481124
5240	NC_017042	CTA	2	6	272389	272394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481124
5241	NC_017042	CTT	2	6	272476	272481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383481124
5242	NC_017042	AAG	2	6	272512	272517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383481124
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5244	NC_017042	ATT	2	6	272579	272584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481124
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5492	NC_017042	AAT	2	6	285065	285070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481134
5493	NC_017042	CAT	2	6	285191	285196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481134
5494	NC_017042	GCC	2	6	285353	285358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383481134
5495	NC_017042	AGC	2	6	285374	285379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383481134
5496	NC_017042	GAA	2	6	285420	285425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383481134
5497	NC_017042	ATC	2	6	285449	285454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481134
5498	NC_017042	AAC	2	6	285487	285492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383481134
5499	NC_017042	GCT	2	6	285723	285728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383481134
5500	NC_017042	T	6	6	285843	285848	0 %	100 %	0 %	0 %	383481134

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