MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 chromosome

Total Repeats: 23445

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016931	GCA	2	6	58	63	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713088
2	NC_016931	TAT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713088
3	NC_016931	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713088
4	NC_016931	T	6	6	293	298	0 %	100 %	0 %	0 %	379713088
5	NC_016931	ATG	2	6	392	397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713088
6	NC_016931	ATA	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713088
7	NC_016931	GTA	2	6	574	579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713088
8	NC_016931	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713088
9	NC_016931	CAG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713088
10	NC_016931	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713088
11	NC_016931	AT	3	6	787	792	50 %	50 %	0 %	0 %	379713088
12	NC_016931	TAA	2	6	795	800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713088
13	NC_016931	A	8	8	799	806	100 %	0 %	0 %	0 %	379713088
14	NC_016931	ATA	2	6	812	817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713088
15	NC_016931	ATA	2	6	1260	1265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713089
16	NC_016931	AAAGTA	2	12	1293	1304	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379713089
17	NC_016931	TGA	2	6	1319	1324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713089
18	NC_016931	GTA	2	6	1357	1362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713089
19	NC_016931	CAA	2	6	1419	1424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379713089
20	NC_016931	A	7	7	1423	1429	100 %	0 %	0 %	0 %	379713089
21	NC_016931	TAA	2	6	1448	1453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713089
22	NC_016931	ATTT	2	8	1454	1461	25 %	75 %	0 %	0 %	379713089
23	NC_016931	TCT	2	6	1568	1573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713090
24	NC_016931	A	6	6	1576	1581	100 %	0 %	0 %	0 %	379713090
25	NC_016931	TC	3	6	1586	1591	0 %	50 %	0 %	50 %	379713090
26	NC_016931	A	6	6	1646	1651	100 %	0 %	0 %	0 %	379713090
27	NC_016931	AT	3	6	1711	1716	50 %	50 %	0 %	0 %	379713090
28	NC_016931	TA	3	6	1829	1834	50 %	50 %	0 %	0 %	379713090
29	NC_016931	ATA	3	9	1832	1840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713090
30	NC_016931	A	7	7	1858	1864	100 %	0 %	0 %	0 %	379713090
31	NC_016931	GAAA	2	8	1869	1876	75 %	0 %	25 %	0 %	379713090
32	NC_016931	GTA	2	6	1898	1903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713090
33	NC_016931	TGA	2	6	1998	2003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713090
34	NC_016931	GAA	2	6	2055	2060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713090
35	NC_016931	A	7	7	2068	2074	100 %	0 %	0 %	0 %	379713090
36	NC_016931	AAT	2	6	2085	2090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713090
37	NC_016931	AAG	2	6	2102	2107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713090
38	NC_016931	TTA	2	6	2140	2145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713090
39	NC_016931	CAA	3	9	2203	2211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379713090
40	NC_016931	T	8	8	2235	2242	0 %	100 %	0 %	0 %	379713091
41	NC_016931	A	6	6	2245	2250	100 %	0 %	0 %	0 %	379713091
42	NC_016931	T	6	6	2310	2315	0 %	100 %	0 %	0 %	379713091
43	NC_016931	T	6	6	2370	2375	0 %	100 %	0 %	0 %	379713091
44	NC_016931	T	6	6	2379	2384	0 %	100 %	0 %	0 %	379713091
45	NC_016931	GA	3	6	2397	2402	50 %	0 %	50 %	0 %	379713091
46	NC_016931	CGG	2	6	2424	2429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379713091
47	NC_016931	AGC	2	6	2455	2460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713091
48	NC_016931	ATA	2	6	2500	2505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713091
49	NC_016931	A	7	7	2505	2511	100 %	0 %	0 %	0 %	379713091
50	NC_016931	T	7	7	2529	2535	0 %	100 %	0 %	0 %	379713091
51	NC_016931	TA	3	6	2561	2566	50 %	50 %	0 %	0 %	379713091
52	NC_016931	TTTTA	2	10	2601	2610	20 %	80 %	0 %	0 %	379713091
53	NC_016931	ATA	2	6	2638	2643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713091
54	NC_016931	TAA	2	6	2669	2674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713091
55	NC_016931	TG	3	6	2677	2682	0 %	50 %	50 %	0 %	379713091
56	NC_016931	TTAT	2	8	2762	2769	25 %	75 %	0 %	0 %	379713091
57	NC_016931	AT	3	6	2821	2826	50 %	50 %	0 %	0 %	379713091
58	NC_016931	ATG	2	6	2899	2904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713091
59	NC_016931	TAT	2	6	2919	2924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713091
60	NC_016931	TTA	2	6	2933	2938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713091
61	NC_016931	ATTTA	2	10	2954	2963	40 %	60 %	0 %	0 %	379713091
62	NC_016931	TTAT	2	8	2984	2991	25 %	75 %	0 %	0 %	379713091
63	NC_016931	A	6	6	3048	3053	100 %	0 %	0 %	0 %	379713092
64	NC_016931	CTC	2	6	3130	3135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379713092
65	NC_016931	TC	3	6	3134	3139	0 %	50 %	0 %	50 %	379713092
66	NC_016931	ATT	2	6	3141	3146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713092
67	NC_016931	ATT	2	6	3154	3159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713092
68	NC_016931	T	6	6	3197	3202	0 %	100 %	0 %	0 %	379713092
69	NC_016931	ATT	2	6	3267	3272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713092
70	NC_016931	A	7	7	3311	3317	100 %	0 %	0 %	0 %	379713092
71	NC_016931	A	6	6	3328	3333	100 %	0 %	0 %	0 %	379713092
72	NC_016931	CAAA	2	8	3413	3420	75 %	0 %	0 %	25 %	379713092
73	NC_016931	AGA	2	6	3440	3445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713092
74	NC_016931	AGA	2	6	3455	3460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713092
75	NC_016931	AGC	2	6	3470	3475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713092
76	NC_016931	TGC	2	6	3482	3487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713092
77	NC_016931	A	8	8	3561	3568	100 %	0 %	0 %	0 %	379713092
78	NC_016931	A	7	7	3582	3588	100 %	0 %	0 %	0 %	379713092
79	NC_016931	A	7	7	3601	3607	100 %	0 %	0 %	0 %	379713092
80	NC_016931	GA	3	6	3609	3614	50 %	0 %	50 %	0 %	379713092
81	NC_016931	T	6	6	3638	3643	0 %	100 %	0 %	0 %	379713092
82	NC_016931	ATT	2	6	3673	3678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713092
83	NC_016931	TATT	2	8	3680	3687	25 %	75 %	0 %	0 %	379713092
84	NC_016931	AGGATA	2	12	3697	3708	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379713092
85	NC_016931	GAG	2	6	3750	3755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379713092
86	NC_016931	TGA	2	6	3784	3789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713092
87	NC_016931	TCGC	2	8	3810	3817	0 %	25 %	25 %	50 %	379713092
88	NC_016931	A	6	6	3853	3858	100 %	0 %	0 %	0 %	379713092
89	NC_016931	TAT	2	6	3911	3916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713092
90	NC_016931	GCA	2	6	3939	3944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713092
91	NC_016931	AGA	2	6	4037	4042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713092
92	NC_016931	AT	3	6	4071	4076	50 %	50 %	0 %	0 %	379713092
93	NC_016931	CTA	2	6	4132	4137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713092
94	NC_016931	TAT	2	6	4188	4193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713092
95	NC_016931	TTA	2	6	4194	4199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713092
96	NC_016931	GGTCA	2	10	4201	4210	20 %	20 %	40 %	20 %	379713092
97	NC_016931	TGT	2	6	4214	4219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379713092
98	NC_016931	GGA	2	6	4329	4334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379713092
99	NC_016931	AT	3	6	4381	4386	50 %	50 %	0 %	0 %	379713092
100	NC_016931	AG	3	6	4400	4405	50 %	0 %	50 %	0 %	379713092
101	NC_016931	ATA	2	6	4408	4413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713092
102	NC_016931	TA	3	6	4488	4493	50 %	50 %	0 %	0 %	379713092
103	NC_016931	CTAATA	2	12	4618	4629	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379713092
104	NC_016931	GGT	2	6	4662	4667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379713092
105	NC_016931	GCA	2	6	4683	4688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713092
106	NC_016931	A	6	6	4710	4715	100 %	0 %	0 %	0 %	379713092
107	NC_016931	TA	3	6	4740	4745	50 %	50 %	0 %	0 %	379713092
108	NC_016931	GGA	2	6	4760	4765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379713092
109	NC_016931	GAA	2	6	4782	4787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713092
110	NC_016931	AAG	2	6	4813	4818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713092
111	NC_016931	AAT	2	6	4824	4829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713092
112	NC_016931	GAA	2	6	4830	4835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713092
113	NC_016931	TAA	2	6	4850	4855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713092
114	NC_016931	TAAAT	2	10	4910	4919	60 %	40 %	0 %	0 %	379713092
115	NC_016931	GAG	2	6	4923	4928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379713092
116	NC_016931	AT	3	6	4932	4937	50 %	50 %	0 %	0 %	379713092
117	NC_016931	CAAAAC	2	12	5072	5083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379713092
118	NC_016931	GTG	2	6	5178	5183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379713092
119	NC_016931	AAG	2	6	5203	5208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713092
120	NC_016931	ACG	2	6	5212	5217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713092
121	NC_016931	ATA	2	6	5239	5244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713092
122	NC_016931	ATT	2	6	5290	5295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713092
123	NC_016931	TAA	2	6	5312	5317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713092
124	NC_016931	AATA	2	8	5318	5325	75 %	25 %	0 %	0 %	379713092
125	NC_016931	ATTC	2	8	5355	5362	25 %	50 %	0 %	25 %	379713092
126	NC_016931	TGC	2	6	5369	5374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713092
127	NC_016931	T	6	6	5397	5402	0 %	100 %	0 %	0 %	379713092
128	NC_016931	ATT	2	6	5413	5418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713092
129	NC_016931	TGC	2	6	5426	5431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713092
130	NC_016931	CTA	2	6	5521	5526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713092
131	NC_016931	AGT	2	6	5558	5563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713092
132	NC_016931	CGC	2	6	5584	5589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379713092
133	NC_016931	A	7	7	5607	5613	100 %	0 %	0 %	0 %	379713092
134	NC_016931	TTG	2	6	5620	5625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379713092
135	NC_016931	TTA	2	6	5649	5654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713092
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137	NC_016931	AATT	2	8	5719	5726	50 %	50 %	0 %	0 %	379713092
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271	NC_016931	TAA	2	6	12308	12313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713098
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276	NC_016931	TAACA	2	10	12437	12446	60 %	20 %	0 %	20 %	379713098
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