MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 24177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_016915	TAG	3	9	1261047	1261055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019802
24003	NC_016915	TAA	2	6	1261102	1261107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019802
24004	NC_016915	AACCT	2	10	1261133	1261142	40 %	20 %	0 %	40 %	379019802
24005	NC_016915	CAA	2	6	1261170	1261175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019802
24006	NC_016915	GATT	2	8	1261182	1261189	25 %	50 %	25 %	0 %	379019802
24007	NC_016915	AAT	2	6	1261230	1261235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019802
24008	NC_016915	TAA	2	6	1261264	1261269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019802
24009	NC_016915	TAT	2	6	1261287	1261292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019802
24010	NC_016915	TAA	2	6	1261293	1261298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019802
24011	NC_016915	TAT	2	6	1261326	1261331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019802
24012	NC_016915	CTA	2	6	1261340	1261345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019802
24013	NC_016915	TA	3	6	1261384	1261389	50 %	50 %	0 %	0 %	379019802
24014	NC_016915	GCG	2	6	1261391	1261396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379019802
24015	NC_016915	T	6	6	1261397	1261402	0 %	100 %	0 %	0 %	379019802
24016	NC_016915	ATC	2	6	1261408	1261413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019802
24017	NC_016915	TAA	2	6	1261480	1261485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019802
24018	NC_016915	TGC	2	6	1261561	1261566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019802
24019	NC_016915	A	6	6	1261615	1261620	100 %	0 %	0 %	0 %	379019802
24020	NC_016915	GCC	2	6	1261684	1261689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379019802
24021	NC_016915	T	6	6	1261726	1261731	0 %	100 %	0 %	0 %	379019802
24022	NC_016915	AGC	2	6	1261756	1261761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019802
24023	NC_016915	TCA	2	6	1261820	1261825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019802
24024	NC_016915	ATACCG	2	12	1261877	1261888	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379019802
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24026	NC_016915	ATA	2	6	1261931	1261936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019802
24027	NC_016915	TAC	2	6	1261947	1261952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019802
24028	NC_016915	TAC	2	6	1261984	1261989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019802
24029	NC_016915	GCA	2	6	1262018	1262023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019802
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24031	NC_016915	CTT	2	6	1262108	1262113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019803
24032	NC_016915	T	11	11	1262112	1262122	0 %	100 %	0 %	0 %	379019803
24033	NC_016915	ATCT	2	8	1262123	1262130	25 %	50 %	0 %	25 %	379019803
24034	NC_016915	TAAA	2	8	1262132	1262139	75 %	25 %	0 %	0 %	379019803
24035	NC_016915	ATT	2	6	1262223	1262228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019803
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24037	NC_016915	A	6	6	1262880	1262885	100 %	0 %	0 %	0 %	379019804
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24040	NC_016915	CAT	2	6	1262941	1262946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019804
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24044	NC_016915	ATT	2	6	1263341	1263346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019805
24045	NC_016915	A	6	6	1263356	1263361	100 %	0 %	0 %	0 %	379019805
24046	NC_016915	GTA	2	6	1263362	1263367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019805
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24051	NC_016915	A	7	7	1263745	1263751	100 %	0 %	0 %	0 %	379019805
24052	NC_016915	ACA	2	6	1263760	1263765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019805
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24055	NC_016915	TTA	2	6	1264181	1264186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019806
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24060	NC_016915	T	6	6	1264620	1264625	0 %	100 %	0 %	0 %	379019807
24061	NC_016915	ATT	2	6	1264631	1264636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019807
24062	NC_016915	T	8	8	1264644	1264651	0 %	100 %	0 %	0 %	379019807
24063	NC_016915	TTC	2	6	1264677	1264682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019807
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24101	NC_016915	AGAA	2	8	1266493	1266500	75 %	0 %	25 %	0 %	379019808
24102	NC_016915	AATTT	2	10	1266532	1266541	40 %	60 %	0 %	0 %	379019808
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