MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 24177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_016915	CAG	2	6	1110037	1110042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019653
21003	NC_016915	GCA	2	6	1110093	1110098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019653
21004	NC_016915	TTA	2	6	1110105	1110110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019653
21005	NC_016915	ATT	2	6	1110173	1110178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019653
21006	NC_016915	TTC	2	6	1110203	1110208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019653
21007	NC_016915	CTC	2	6	1110212	1110217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379019653
21008	NC_016915	T	7	7	1110224	1110230	0 %	100 %	0 %	0 %	379019653
21009	NC_016915	TCT	2	6	1110232	1110237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019653
21010	NC_016915	AT	3	6	1110320	1110325	50 %	50 %	0 %	0 %	379019653
21011	NC_016915	CAC	2	6	1110326	1110331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379019653
21012	NC_016915	TCT	2	6	1110342	1110347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019653
21013	NC_016915	AAT	2	6	1110373	1110378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019653
21014	NC_016915	TGT	2	6	1110384	1110389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019653
21015	NC_016915	TA	3	6	1110407	1110412	50 %	50 %	0 %	0 %	379019653
21016	NC_016915	CCTTTA	2	12	1110543	1110554	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	379019653
21017	NC_016915	TTA	2	6	1110573	1110578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019653
21018	NC_016915	TCA	2	6	1110579	1110584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019653
21019	NC_016915	TAA	2	6	1110646	1110651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019653
21020	NC_016915	A	6	6	1110672	1110677	100 %	0 %	0 %	0 %	379019653
21021	NC_016915	TTAA	2	8	1110684	1110691	50 %	50 %	0 %	0 %	379019653
21022	NC_016915	TA	3	6	1110754	1110759	50 %	50 %	0 %	0 %	379019653
21023	NC_016915	GCA	2	6	1110804	1110809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019653
21024	NC_016915	ATCA	2	8	1110854	1110861	50 %	25 %	0 %	25 %	379019653
21025	NC_016915	TTAA	2	8	1110867	1110874	50 %	50 %	0 %	0 %	379019653
21026	NC_016915	TAAGC	2	10	1111022	1111031	40 %	20 %	20 %	20 %	379019653
21027	NC_016915	TAT	2	6	1111099	1111104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019653
21028	NC_016915	ACGT	2	8	1111118	1111125	25 %	25 %	25 %	25 %	379019653
21029	NC_016915	AATT	2	8	1111126	1111133	50 %	50 %	0 %	0 %	379019653
21030	NC_016915	ATA	2	6	1111213	1111218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019653
21031	NC_016915	TAA	2	6	1111246	1111251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019653
21032	NC_016915	CAA	2	6	1111264	1111269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019653
21033	NC_016915	T	6	6	1111316	1111321	0 %	100 %	0 %	0 %	379019653
21034	NC_016915	TAA	2	6	1111330	1111335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019653
21035	NC_016915	A	6	6	1111350	1111355	100 %	0 %	0 %	0 %	379019653
21036	NC_016915	ATA	2	6	1111380	1111385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019653
21037	NC_016915	CTT	2	6	1111429	1111434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019653
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21039	NC_016915	GCAA	2	8	1111482	1111489	50 %	0 %	25 %	25 %	379019653
21040	NC_016915	T	6	6	1111505	1111510	0 %	100 %	0 %	0 %	379019653
21041	NC_016915	TGG	2	6	1111537	1111542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379019653
21042	NC_016915	GCA	2	6	1111552	1111557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019653
21043	NC_016915	CGG	2	6	1111559	1111564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379019653
21044	NC_016915	AAC	2	6	1111585	1111590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019653
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21046	NC_016915	A	6	6	1111636	1111641	100 %	0 %	0 %	0 %	379019653
21047	NC_016915	ATC	2	6	1111647	1111652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019653
21048	NC_016915	CAT	2	6	1111741	1111746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019653
21049	NC_016915	CAT	2	6	1111750	1111755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019653
21050	NC_016915	TAG	2	6	1111786	1111791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019653
21051	NC_016915	CAA	2	6	1111792	1111797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019653
21052	NC_016915	GCA	2	6	1111815	1111820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019653
21053	NC_016915	TTC	2	6	1111850	1111855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019653
21054	NC_016915	CTC	2	6	1111937	1111942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379019653
21055	NC_016915	AGCA	2	8	1111953	1111960	50 %	0 %	25 %	25 %	379019653
21056	NC_016915	CTT	2	6	1112005	1112010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019653
21057	NC_016915	T	7	7	1112198	1112204	0 %	100 %	0 %	0 %	379019653
21058	NC_016915	CAAA	2	8	1112255	1112262	75 %	0 %	0 %	25 %	379019653
21059	NC_016915	CTA	2	6	1112293	1112298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019653
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21062	NC_016915	CTG	2	6	1112698	1112703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019654
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21064	NC_016915	CAT	2	6	1112836	1112841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019654
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21091	NC_016915	A	7	7	1114171	1114177	100 %	0 %	0 %	0 %	379019655
21092	NC_016915	AATTG	2	10	1114179	1114188	40 %	40 %	20 %	0 %	379019655
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21105	NC_016915	A	6	6	1114813	1114818	100 %	0 %	0 %	0 %	379019655
21106	NC_016915	T	6	6	1114819	1114824	0 %	100 %	0 %	0 %	379019655
21107	NC_016915	A	8	8	1114825	1114832	100 %	0 %	0 %	0 %	379019655
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21235	NC_016915	AT	4	8	1120699	1120706	50 %	50 %	0 %	0 %	379019660
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