MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 24177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_016915	GAAA	2	8	1033772	1033779	75 %	0 %	25 %	0 %	379019562
19503	NC_016915	A	6	6	1033844	1033849	100 %	0 %	0 %	0 %	379019562
19504	NC_016915	CTA	2	6	1033883	1033888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019562
19505	NC_016915	GTCA	2	8	1033918	1033925	25 %	25 %	25 %	25 %	379019562
19506	NC_016915	TAT	2	6	1033935	1033940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019562
19507	NC_016915	TGC	2	6	1034024	1034029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019562
19508	NC_016915	ACTAT	2	10	1034039	1034048	40 %	40 %	0 %	20 %	379019562
19509	NC_016915	CAC	2	6	1034891	1034896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379019563
19510	NC_016915	AATATA	2	12	1034901	1034912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019563
19511	NC_016915	A	6	6	1034945	1034950	100 %	0 %	0 %	0 %	379019563
19512	NC_016915	TA	3	6	1034951	1034956	50 %	50 %	0 %	0 %	379019563
19513	NC_016915	TCT	2	6	1034961	1034966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019563
19514	NC_016915	A	6	6	1034982	1034987	100 %	0 %	0 %	0 %	379019563
19515	NC_016915	T	6	6	1034996	1035001	0 %	100 %	0 %	0 %	379019563
19516	NC_016915	T	6	6	1035007	1035012	0 %	100 %	0 %	0 %	379019563
19517	NC_016915	TAC	2	6	1036781	1036786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019564
19518	NC_016915	T	6	6	1036811	1036816	0 %	100 %	0 %	0 %	379019564
19519	NC_016915	TTA	2	6	1036899	1036904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019564
19520	NC_016915	ACG	2	6	1036932	1036937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019564
19521	NC_016915	CT	3	6	1036946	1036951	0 %	50 %	0 %	50 %	379019564
19522	NC_016915	CT	3	6	1036957	1036962	0 %	50 %	0 %	50 %	379019564
19523	NC_016915	AGA	2	6	1037041	1037046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019564
19524	NC_016915	ATT	2	6	1037057	1037062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019564
19525	NC_016915	AAAAT	2	10	1037077	1037086	80 %	20 %	0 %	0 %	379019564
19526	NC_016915	AACAAT	2	12	1037100	1037111	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	379019564
19527	NC_016915	AAT	2	6	1037119	1037124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019564
19528	NC_016915	A	7	7	1037149	1037155	100 %	0 %	0 %	0 %	379019564
19529	NC_016915	TCT	2	6	1037183	1037188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019564
19530	NC_016915	TAA	2	6	1037206	1037211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019564
19531	NC_016915	AT	3	6	1037215	1037220	50 %	50 %	0 %	0 %	379019564
19532	NC_016915	TACT	2	8	1037693	1037700	25 %	50 %	0 %	25 %	379019565
19533	NC_016915	GAA	2	6	1037708	1037713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019565
19534	NC_016915	TTAA	2	8	1037723	1037730	50 %	50 %	0 %	0 %	379019565
19535	NC_016915	AT	3	6	1037816	1037821	50 %	50 %	0 %	0 %	379019565
19536	NC_016915	ACT	2	6	1037846	1037851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019565
19537	NC_016915	CAT	3	9	1037880	1037888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019565
19538	NC_016915	AGCAA	2	10	1038083	1038092	60 %	0 %	20 %	20 %	379019565
19539	NC_016915	TAAT	2	8	1038093	1038100	50 %	50 %	0 %	0 %	379019565
19540	NC_016915	AAT	2	6	1038124	1038129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019565
19541	NC_016915	TAT	2	6	1038177	1038182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019566
19542	NC_016915	TAT	2	6	1038222	1038227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019566
19543	NC_016915	T	6	6	1038254	1038259	0 %	100 %	0 %	0 %	379019566
19544	NC_016915	ATG	2	6	1038277	1038282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019566
19545	NC_016915	CCT	2	6	1038346	1038351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379019566
19546	NC_016915	AAT	2	6	1038363	1038368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019566
19547	NC_016915	ATA	2	6	1038385	1038390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019566
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19549	NC_016915	T	6	6	1038418	1038423	0 %	100 %	0 %	0 %	379019566
19550	NC_016915	A	7	7	1038427	1038433	100 %	0 %	0 %	0 %	379019566
19551	NC_016915	TAA	2	6	1038435	1038440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019566
19552	NC_016915	TATC	2	8	1038447	1038454	25 %	50 %	0 %	25 %	379019566
19553	NC_016915	GCA	2	6	1038511	1038516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019567
19554	NC_016915	TAT	2	6	1038527	1038532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019567
19555	NC_016915	ATA	2	6	1038559	1038564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019567
19556	NC_016915	TTG	2	6	1038625	1038630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019567
19557	NC_016915	ATT	2	6	1038642	1038647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019567
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19559	NC_016915	TTG	2	6	1038681	1038686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019567
19560	NC_016915	T	7	7	1038726	1038732	0 %	100 %	0 %	0 %	379019567
19561	NC_016915	TGC	2	6	1038753	1038758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019567
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19565	NC_016915	ATA	2	6	1038907	1038912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019567
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19585	NC_016915	AT	3	6	1040557	1040562	50 %	50 %	0 %	0 %	379019569
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19589	NC_016915	TA	3	6	1040704	1040709	50 %	50 %	0 %	0 %	379019569
19590	NC_016915	TAA	2	6	1040744	1040749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019569
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19598	NC_016915	CTAG	2	8	1041189	1041196	25 %	25 %	25 %	25 %	379019570
19599	NC_016915	TTTA	2	8	1041213	1041220	25 %	75 %	0 %	0 %	379019570
19600	NC_016915	GCT	2	6	1041296	1041301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019570
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19605	NC_016915	AG	3	6	1041443	1041448	50 %	0 %	50 %	0 %	379019570
19606	NC_016915	GCG	2	6	1041481	1041486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379019570
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