MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 24177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19003	NC_016915	TTAA	2	8	1007797	1007804	50 %	50 %	0 %	0 %	379019543
19004	NC_016915	ATT	2	6	1007815	1007820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019543
19005	NC_016915	ATTTA	2	10	1007871	1007880	40 %	60 %	0 %	0 %	379019543
19006	NC_016915	ATT	2	6	1007914	1007919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019543
19007	NC_016915	TA	3	6	1007963	1007968	50 %	50 %	0 %	0 %	379019543
19008	NC_016915	ATT	2	6	1007982	1007987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019543
19009	NC_016915	TAT	2	6	1008230	1008235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019544
19010	NC_016915	TAT	2	6	1008311	1008316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019544
19011	NC_016915	TAA	2	6	1008329	1008334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019544
19012	NC_016915	T	6	6	1008364	1008369	0 %	100 %	0 %	0 %	379019544
19013	NC_016915	TAA	2	6	1008428	1008433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019544
19014	NC_016915	AAT	2	6	1008435	1008440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019544
19015	NC_016915	TAAT	2	8	1008469	1008476	50 %	50 %	0 %	0 %	379019544
19016	NC_016915	ACT	2	6	1008498	1008503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019544
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19018	NC_016915	T	8	8	1008589	1008596	0 %	100 %	0 %	0 %	379019544
19019	NC_016915	TAA	2	6	1008695	1008700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019544
19020	NC_016915	ATA	2	6	1008771	1008776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019544
19021	NC_016915	A	6	6	1008776	1008781	100 %	0 %	0 %	0 %	379019544
19022	NC_016915	CAA	2	6	1008841	1008846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019544
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19024	NC_016915	A	7	7	1008953	1008959	100 %	0 %	0 %	0 %	379019544
19025	NC_016915	TTA	2	6	1009033	1009038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019544
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19027	NC_016915	ATGA	2	8	1009053	1009060	50 %	25 %	25 %	0 %	379019544
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19051	NC_016915	GAT	2	6	1009734	1009739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019544
19052	NC_016915	AT	3	6	1009811	1009816	50 %	50 %	0 %	0 %	379019544
19053	NC_016915	CAA	2	6	1009863	1009868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019544
19054	NC_016915	CT	3	6	1009917	1009922	0 %	50 %	0 %	50 %	379019544
19055	NC_016915	A	6	6	1009930	1009935	100 %	0 %	0 %	0 %	379019544
19056	NC_016915	ACT	2	6	1009941	1009946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019544
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19118	NC_016915	GTA	2	6	1012050	1012055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019546
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19471	NC_016915	TTTA	2	8	1031164	1031171	25 %	75 %	0 %	0 %	379019559
19472	NC_016915	A	6	6	1031177	1031182	100 %	0 %	0 %	0 %	379019559
19473	NC_016915	CAG	2	6	1031346	1031351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019559
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19475	NC_016915	TCA	2	6	1031453	1031458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019559
19476	NC_016915	GA	3	6	1031470	1031475	50 %	0 %	50 %	0 %	379019559
19477	NC_016915	ATTT	2	8	1031508	1031515	25 %	75 %	0 %	0 %	379019559
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19479	NC_016915	TCT	2	6	1031639	1031644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019559
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19483	NC_016915	TCC	2	6	1031866	1031871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379019560
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19486	NC_016915	CTAA	2	8	1032147	1032154	50 %	25 %	0 %	25 %	379019561
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19492	NC_016915	TTC	2	6	1032527	1032532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019561
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19498	NC_016915	AT	3	6	1032943	1032948	50 %	50 %	0 %	0 %	379019561
19499	NC_016915	ATA	2	6	1033053	1033058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019561
19500	NC_016915	T	6	6	1033070	1033075	0 %	100 %	0 %	0 %	379019561

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