MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 24177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_016915	ATTTTT	2	12	524764	524775	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	379019040
10002	NC_016915	TA	3	6	524815	524820	50 %	50 %	0 %	0 %	379019040
10003	NC_016915	TAA	2	6	524830	524835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019040
10004	NC_016915	AATT	2	8	524862	524869	50 %	50 %	0 %	0 %	379019040
10005	NC_016915	TTA	2	6	524940	524945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019041
10006	NC_016915	AT	4	8	524983	524990	50 %	50 %	0 %	0 %	379019041
10007	NC_016915	TGC	2	6	525075	525080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019041
10008	NC_016915	GTG	2	6	525083	525088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379019041
10009	NC_016915	AGT	2	6	525097	525102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019041
10010	NC_016915	ATAA	2	8	525160	525167	75 %	25 %	0 %	0 %	379019041
10011	NC_016915	ATAGA	2	10	525183	525192	60 %	20 %	20 %	0 %	379019041
10012	NC_016915	AGC	2	6	525198	525203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019041
10013	NC_016915	CACCAT	2	12	525267	525278	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	379019041
10014	NC_016915	TA	4	8	525308	525315	50 %	50 %	0 %	0 %	379019041
10015	NC_016915	ATC	2	6	525318	525323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019041
10016	NC_016915	A	6	6	525325	525330	100 %	0 %	0 %	0 %	379019041
10017	NC_016915	TAAA	2	8	525356	525363	75 %	25 %	0 %	0 %	379019041
10018	NC_016915	A	6	6	525373	525378	100 %	0 %	0 %	0 %	379019041
10019	NC_016915	TAC	2	6	525399	525404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019041
10020	NC_016915	GGT	2	6	525420	525425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379019041
10021	NC_016915	CTC	2	6	525436	525441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379019041
10022	NC_016915	AAC	2	6	525489	525494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019041
10023	NC_016915	CAT	2	6	525495	525500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019041
10024	NC_016915	ATC	2	6	525519	525524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019041
10025	NC_016915	ATA	2	6	525589	525594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019041
10026	NC_016915	A	7	7	525624	525630	100 %	0 %	0 %	0 %	379019041
10027	NC_016915	TAA	2	6	525631	525636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019041
10028	NC_016915	A	6	6	525726	525731	100 %	0 %	0 %	0 %	379019041
10029	NC_016915	AATAG	2	10	525749	525758	60 %	20 %	20 %	0 %	379019041
10030	NC_016915	TAC	2	6	525816	525821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019041
10031	NC_016915	TAA	2	6	525825	525830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019041
10032	NC_016915	A	8	8	525846	525853	100 %	0 %	0 %	0 %	379019041
10033	NC_016915	T	7	7	526144	526150	0 %	100 %	0 %	0 %	379019042
10034	NC_016915	CTA	2	6	526188	526193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019042
10035	NC_016915	CTA	2	6	526229	526234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019042
10036	NC_016915	CTA	2	6	526302	526307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019042
10037	NC_016915	T	7	7	526331	526337	0 %	100 %	0 %	0 %	379019042
10038	NC_016915	ACC	2	6	526342	526347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379019042
10039	NC_016915	CTA	2	6	526386	526391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019042
10040	NC_016915	AATC	2	8	526431	526438	50 %	25 %	0 %	25 %	379019042
10041	NC_016915	T	6	6	526460	526465	0 %	100 %	0 %	0 %	379019042
10042	NC_016915	TAG	2	6	526509	526514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019042
10043	NC_016915	TATTT	2	10	526543	526552	20 %	80 %	0 %	0 %	379019042
10044	NC_016915	CTATAT	2	12	526554	526565	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379019042
10045	NC_016915	A	6	6	526633	526638	100 %	0 %	0 %	0 %	379019042
10046	NC_016915	AAT	2	6	526682	526687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019042
10047	NC_016915	TTG	2	6	526713	526718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019042
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10049	NC_016915	TAA	2	6	526759	526764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019042
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10051	NC_016915	AAT	3	9	526801	526809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019042
10052	NC_016915	GTA	2	6	526841	526846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019042
10053	NC_016915	TCA	2	6	526928	526933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019042
10054	NC_016915	TTA	2	6	526952	526957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019042
10055	NC_016915	TGC	2	6	526966	526971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019042
10056	NC_016915	AGC	2	6	526975	526980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019042
10057	NC_016915	CTCC	2	8	526997	527004	0 %	25 %	0 %	75 %	379019042
10058	NC_016915	ACT	2	6	527284	527289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019043
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10060	NC_016915	TTA	2	6	527328	527333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019043
10061	NC_016915	T	6	6	527402	527407	0 %	100 %	0 %	0 %	379019043
10062	NC_016915	AGC	2	6	527490	527495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019043
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10064	NC_016915	T	6	6	527534	527539	0 %	100 %	0 %	0 %	379019043
10065	NC_016915	ACT	2	6	527547	527552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019043
10066	NC_016915	TCT	2	6	527585	527590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019043
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10069	NC_016915	ATT	2	6	527678	527683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019043
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10071	NC_016915	CTA	2	6	527719	527724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019043
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10073	NC_016915	GATG	2	8	527847	527854	25 %	25 %	50 %	0 %	379019043
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10088	NC_016915	ATT	2	6	528228	528233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019043
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10092	NC_016915	CTC	2	6	528416	528421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379019043
10093	NC_016915	T	6	6	528428	528433	0 %	100 %	0 %	0 %	379019043
10094	NC_016915	TTGC	2	8	528508	528515	0 %	50 %	25 %	25 %	379019043
10095	NC_016915	GAGT	2	8	528528	528535	25 %	25 %	50 %	0 %	379019043
10096	NC_016915	ATTT	2	8	528569	528576	25 %	75 %	0 %	0 %	379019043
10097	NC_016915	TAC	2	6	528577	528582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019043
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10100	NC_016915	T	6	6	528761	528766	0 %	100 %	0 %	0 %	379019043
10101	NC_016915	GCT	2	6	528782	528787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019043
10102	NC_016915	TATCA	2	10	528797	528806	40 %	40 %	0 %	20 %	379019043
10103	NC_016915	ATC	2	6	528821	528826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019043
10104	NC_016915	CAAT	2	8	528843	528850	50 %	25 %	0 %	25 %	379019043
10105	NC_016915	AAGATT	2	12	528878	528889	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379019043
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10107	NC_016915	ATAA	2	8	529060	529067	75 %	25 %	0 %	0 %	379019044
10108	NC_016915	TAT	2	6	529107	529112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019044
10109	NC_016915	A	7	7	529122	529128	100 %	0 %	0 %	0 %	379019044
10110	NC_016915	ATT	2	6	529136	529141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019044
10111	NC_016915	TAC	2	6	529193	529198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019044
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10114	NC_016915	TTA	2	6	529294	529299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019044
10115	NC_016915	CTT	2	6	529339	529344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019044
10116	NC_016915	AT	3	6	529372	529377	50 %	50 %	0 %	0 %	379019044
10117	NC_016915	GCT	2	6	529426	529431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019044
10118	NC_016915	TAGAA	2	10	529437	529446	60 %	20 %	20 %	0 %	379019044
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