MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 24304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_016914	ATC	2	6	200790	200795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017364
4003	NC_016914	CTT	2	6	200810	200815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017364
4004	NC_016914	TAT	2	6	200948	200953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017364
4005	NC_016914	TAAT	3	12	200965	200976	50 %	50 %	0 %	0 %	379017364
4006	NC_016914	GAT	2	6	201006	201011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017364
4007	NC_016914	ATC	2	6	201042	201047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017364
4008	NC_016914	ATT	2	6	201051	201056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017364
4009	NC_016914	TGC	2	6	201072	201077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017364
4010	NC_016914	TC	3	6	201105	201110	0 %	50 %	0 %	50 %	379017364
4011	NC_016914	ATA	2	6	201471	201476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017365
4012	NC_016914	TATT	2	8	201504	201511	25 %	75 %	0 %	0 %	379017365
4013	NC_016914	AAG	2	6	201549	201554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017365
4014	NC_016914	TTA	2	6	201560	201565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017365
4015	NC_016914	TTA	2	6	201591	201596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017365
4016	NC_016914	TTA	2	6	201611	201616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017365
4017	NC_016914	TTA	2	6	201644	201649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017365
4018	NC_016914	T	6	6	201723	201728	0 %	100 %	0 %	0 %	379017365
4019	NC_016914	TTA	2	6	201755	201760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017365
4020	NC_016914	ATA	2	6	201768	201773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017365
4021	NC_016914	CGG	2	6	201778	201783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379017365
4022	NC_016914	TGT	2	6	201844	201849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017365
4023	NC_016914	T	6	6	201921	201926	0 %	100 %	0 %	0 %	379017365
4024	NC_016914	T	7	7	201951	201957	0 %	100 %	0 %	0 %	379017366
4025	NC_016914	ATTA	2	8	201984	201991	50 %	50 %	0 %	0 %	379017366
4026	NC_016914	TTC	2	6	202035	202040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017366
4027	NC_016914	ATT	2	6	202065	202070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017366
4028	NC_016914	T	6	6	202080	202085	0 %	100 %	0 %	0 %	379017366
4029	NC_016914	ATA	2	6	202105	202110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017366
4030	NC_016914	TTC	2	6	202134	202139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017366
4031	NC_016914	T	7	7	202207	202213	0 %	100 %	0 %	0 %	379017366
4032	NC_016914	CTA	2	6	202238	202243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017366
4033	NC_016914	TAT	2	6	202274	202279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017366
4034	NC_016914	TA	3	6	202289	202294	50 %	50 %	0 %	0 %	379017366
4035	NC_016914	AT	3	6	202336	202341	50 %	50 %	0 %	0 %	379017366
4036	NC_016914	T	6	6	202432	202437	0 %	100 %	0 %	0 %	379017366
4037	NC_016914	T	6	6	202446	202451	0 %	100 %	0 %	0 %	379017366
4038	NC_016914	ATA	2	6	202477	202482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017366
4039	NC_016914	CAA	2	6	202496	202501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379017366
4040	NC_016914	TC	3	6	202502	202507	0 %	50 %	0 %	50 %	379017366
4041	NC_016914	AGG	2	6	202527	202532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379017366
4042	NC_016914	GCA	2	6	202540	202545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017366
4043	NC_016914	T	6	6	202562	202567	0 %	100 %	0 %	0 %	379017366
4044	NC_016914	T	8	8	202575	202582	0 %	100 %	0 %	0 %	379017366
4045	NC_016914	T	7	7	202951	202957	0 %	100 %	0 %	0 %	379017367
4046	NC_016914	AAT	2	6	202983	202988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017367
4047	NC_016914	TTA	2	6	203067	203072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017367
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4050	NC_016914	CATT	2	8	203229	203236	25 %	50 %	0 %	25 %	379017367
4051	NC_016914	TTTA	2	8	203252	203259	25 %	75 %	0 %	0 %	379017367
4052	NC_016914	AAT	2	6	203268	203273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017367
4053	NC_016914	CATT	2	8	203310	203317	25 %	50 %	0 %	25 %	379017367
4054	NC_016914	TGC	2	6	203318	203323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017367
4055	NC_016914	CTA	2	6	203356	203361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017367
4056	NC_016914	CAT	2	6	203371	203376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017367
4057	NC_016914	TCA	2	6	203463	203468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017367
4058	NC_016914	TAA	2	6	203483	203488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017367
4059	NC_016914	CTT	3	9	203521	203529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017367
4060	NC_016914	CGC	2	6	203551	203556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379017367
4061	NC_016914	ATT	2	6	203586	203591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017367
4062	NC_016914	CAAG	2	8	203605	203612	50 %	0 %	25 %	25 %	379017367
4063	NC_016914	ATG	2	6	203649	203654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017367
4064	NC_016914	GAATT	2	10	203659	203668	40 %	40 %	20 %	0 %	379017367
4065	NC_016914	CGC	2	6	203704	203709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379017367
4066	NC_016914	T	6	6	203802	203807	0 %	100 %	0 %	0 %	379017367
4067	NC_016914	GCT	2	6	203817	203822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017367
4068	NC_016914	TGA	2	6	203831	203836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017367
4069	NC_016914	TGAT	2	8	203909	203916	25 %	50 %	25 %	0 %	379017367
4070	NC_016914	AAT	2	6	204073	204078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017367
4071	NC_016914	ATTT	3	12	204100	204111	25 %	75 %	0 %	0 %	379017367
4072	NC_016914	AAGCCC	2	12	204119	204130	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	379017367
4073	NC_016914	TGC	2	6	204188	204193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017367
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4077	NC_016914	AT	3	6	204330	204335	50 %	50 %	0 %	0 %	379017367
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4088	NC_016914	TAA	2	6	204881	204886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017368
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4091	NC_016914	AAT	2	6	204994	204999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017368
4092	NC_016914	CAT	2	6	205120	205125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017368
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4094	NC_016914	AGC	2	6	205303	205308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017368
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4101	NC_016914	GTTT	2	8	205806	205813	0 %	75 %	25 %	0 %	379017368
4102	NC_016914	ATT	2	6	205826	205831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017369
4103	NC_016914	CAA	2	6	205832	205837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379017369
4104	NC_016914	CTT	2	6	205862	205867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017369
4105	NC_016914	ATA	2	6	206029	206034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017369
4106	NC_016914	A	6	6	206049	206054	100 %	0 %	0 %	0 %	379017369
4107	NC_016914	TCT	2	6	206068	206073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017369
4108	NC_016914	TGC	2	6	206109	206114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017369
4109	NC_016914	AT	3	6	206436	206441	50 %	50 %	0 %	0 %	379017370
4110	NC_016914	CTT	2	6	206483	206488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017370
4111	NC_016914	TAG	2	6	206490	206495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017370
4112	NC_016914	T	6	6	206500	206505	0 %	100 %	0 %	0 %	379017370
4113	NC_016914	AAT	2	6	206506	206511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017370
4114	NC_016914	CCTG	2	8	206553	206560	0 %	25 %	25 %	50 %	379017370
4115	NC_016914	CTAA	2	8	206590	206597	50 %	25 %	0 %	25 %	379017370
4116	NC_016914	ATTTT	2	10	206605	206614	20 %	80 %	0 %	0 %	379017370
4117	NC_016914	ATT	2	6	206934	206939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017371
4118	NC_016914	TTA	2	6	206956	206961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017371
4119	NC_016914	TAC	2	6	206974	206979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017371
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4123	NC_016914	TCTT	2	8	207155	207162	0 %	75 %	0 %	25 %	379017371
4124	NC_016914	CCGT	2	8	207198	207205	0 %	25 %	25 %	50 %	379017371
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4128	NC_016914	TTA	2	6	207909	207914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017372
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4231	NC_016914	TG	3	6	213274	213279	0 %	50 %	50 %	0 %	379017378
4232	NC_016914	TAT	2	6	213314	213319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017378
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4237	NC_016914	AAGA	2	8	213703	213710	75 %	0 %	25 %	0 %	379017378
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4242	NC_016914	CTTTAG	2	12	213809	213820	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379017378
4243	NC_016914	AGCTA	2	10	213825	213834	40 %	20 %	20 %	20 %	379017378
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4494	NC_016914	AAT	2	6	224542	224547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017388
4495	NC_016914	TTC	2	6	224557	224562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017388
4496	NC_016914	ATT	2	6	224599	224604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017388
4497	NC_016914	CTG	2	6	224625	224630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017388
4498	NC_016914	T	6	6	224698	224703	0 %	100 %	0 %	0 %	379017388
4499	NC_016914	TTA	2	6	224721	224726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017388
4500	NC_016914	TA	3	6	224725	224730	50 %	50 %	0 %	0 %	379017388

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