MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 24304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21502	NC_016914	GAA	2	6	1129216	1129221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018349
21503	NC_016914	TTAT	2	8	1129243	1129250	25 %	75 %	0 %	0 %	379018349
21504	NC_016914	GAT	2	6	1129254	1129259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018349
21505	NC_016914	TCT	2	6	1129270	1129275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018349
21506	NC_016914	TTG	2	6	1129282	1129287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018349
21507	NC_016914	ATT	2	6	1129352	1129357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018350
21508	NC_016914	ATT	2	6	1129387	1129392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018350
21509	NC_016914	A	6	6	1129399	1129404	100 %	0 %	0 %	0 %	379018350
21510	NC_016914	GTT	2	6	1129414	1129419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018350
21511	NC_016914	AAT	2	6	1129450	1129455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018350
21512	NC_016914	ATA	2	6	1129480	1129485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018350
21513	NC_016914	TGC	2	6	1129494	1129499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018350
21514	NC_016914	GGA	2	6	1129534	1129539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379018350
21515	NC_016914	GTA	2	6	1129541	1129546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018350
21516	NC_016914	AGA	2	6	1129547	1129552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018350
21517	NC_016914	AGT	2	6	1129571	1129576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018350
21518	NC_016914	TAA	2	6	1129647	1129652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018351
21519	NC_016914	ATA	2	6	1129689	1129694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018351
21520	NC_016914	A	7	7	1129708	1129714	100 %	0 %	0 %	0 %	379018351
21521	NC_016914	GAA	2	6	1129721	1129726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018351
21522	NC_016914	ATAA	2	8	1129757	1129764	75 %	25 %	0 %	0 %	379018351
21523	NC_016914	ACA	3	9	1129912	1129920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018351
21524	NC_016914	ACA	2	6	1129928	1129933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018351
21525	NC_016914	GAGT	2	8	1129938	1129945	25 %	25 %	50 %	0 %	379018351
21526	NC_016914	AGA	2	6	1129976	1129981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018351
21527	NC_016914	TACC	2	8	1129983	1129990	25 %	25 %	0 %	50 %	379018351
21528	NC_016914	CTT	2	6	1130006	1130011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018351
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21531	NC_016914	T	7	7	1130104	1130110	0 %	100 %	0 %	0 %	379018352
21532	NC_016914	ATTT	2	8	1130111	1130118	25 %	75 %	0 %	0 %	379018352
21533	NC_016914	TAA	2	6	1130126	1130131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018352
21534	NC_016914	TAT	2	6	1130180	1130185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018352
21535	NC_016914	ATG	2	6	1130251	1130256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018352
21536	NC_016914	ATT	3	9	1130286	1130294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018352
21537	NC_016914	ATG	2	6	1130308	1130313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018352
21538	NC_016914	TAA	2	6	1130328	1130333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018352
21539	NC_016914	TAA	2	6	1130405	1130410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018352
21540	NC_016914	ATA	2	6	1130471	1130476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018352
21541	NC_016914	TAT	2	6	1130549	1130554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018352
21542	NC_016914	AAG	2	6	1130590	1130595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018352
21543	NC_016914	AT	3	6	1130618	1130623	50 %	50 %	0 %	0 %	379018352
21544	NC_016914	AAC	2	6	1130627	1130632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018352
21545	NC_016914	TAAA	2	8	1130678	1130685	75 %	25 %	0 %	0 %	379018352
21546	NC_016914	ATGA	2	8	1130705	1130712	50 %	25 %	25 %	0 %	379018352
21547	NC_016914	AT	3	6	1130713	1130718	50 %	50 %	0 %	0 %	379018353
21548	NC_016914	ATT	2	6	1130730	1130735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018353
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21551	NC_016914	AT	3	6	1130805	1130810	50 %	50 %	0 %	0 %	379018353
21552	NC_016914	TGC	2	6	1130829	1130834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018353
21553	NC_016914	TTG	2	6	1130853	1130858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018353
21554	NC_016914	TA	3	6	1130868	1130873	50 %	50 %	0 %	0 %	379018353
21555	NC_016914	TAT	2	6	1130902	1130907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018353
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21557	NC_016914	AT	3	6	1130960	1130965	50 %	50 %	0 %	0 %	379018353
21558	NC_016914	TAA	2	6	1130971	1130976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018353
21559	NC_016914	ATG	2	6	1131019	1131024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018353
21560	NC_016914	ATC	2	6	1131046	1131051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018354
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21564	NC_016914	TAA	2	6	1131164	1131169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018354
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21567	NC_016914	TCTTT	2	10	1131376	1131385	0 %	80 %	0 %	20 %	379018354
21568	NC_016914	T	7	7	1131396	1131402	0 %	100 %	0 %	0 %	379018354
21569	NC_016914	TAA	2	6	1131513	1131518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018354
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21590	NC_016914	GTTTAT	2	12	1132263	1132274	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379018354
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21593	NC_016914	ATT	2	6	1132321	1132326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018354
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21597	NC_016914	CAAAC	2	10	1132476	1132485	60 %	0 %	0 %	40 %	379018354
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21599	NC_016914	TA	3	6	1132550	1132555	50 %	50 %	0 %	0 %	379018354
21600	NC_016914	CTA	2	6	1132561	1132566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018354
21601	NC_016914	TA	3	6	1132610	1132615	50 %	50 %	0 %	0 %	379018354
21602	NC_016914	TGA	2	6	1132700	1132705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018354
21603	NC_016914	AATA	2	8	1132738	1132745	75 %	25 %	0 %	0 %	379018354
21604	NC_016914	AT	3	6	1132759	1132764	50 %	50 %	0 %	0 %	379018354
21605	NC_016914	CTT	2	6	1132799	1132804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018354
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21607	NC_016914	TA	3	6	1132930	1132935	50 %	50 %	0 %	0 %	379018354
21608	NC_016914	TTG	2	6	1132946	1132951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018354
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21612	NC_016914	TA	3	6	1133201	1133206	50 %	50 %	0 %	0 %	379018355
21613	NC_016914	TTA	2	6	1133216	1133221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018355
21614	NC_016914	A	6	6	1133230	1133235	100 %	0 %	0 %	0 %	379018355
21615	NC_016914	AT	4	8	1133248	1133255	50 %	50 %	0 %	0 %	379018355
21616	NC_016914	ATGT	2	8	1133257	1133264	25 %	50 %	25 %	0 %	379018355
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