MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 24304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_016914	TCTTG	2	10	1106030	1106039	0 %	60 %	20 %	20 %	379018332
21003	NC_016914	AGT	2	6	1106109	1106114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018332
21004	NC_016914	CAT	2	6	1106128	1106133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018332
21005	NC_016914	ACA	2	6	1106142	1106147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018332
21006	NC_016914	GAA	2	6	1106173	1106178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018332
21007	NC_016914	ATT	2	6	1106179	1106184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018332
21008	NC_016914	TAAT	2	8	1106231	1106238	50 %	50 %	0 %	0 %	379018332
21009	NC_016914	CGG	3	9	1106333	1106341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379018333
21010	NC_016914	CAA	2	6	1106362	1106367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018333
21011	NC_016914	ATAG	2	8	1106370	1106377	50 %	25 %	25 %	0 %	379018333
21012	NC_016914	GCT	2	6	1106382	1106387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018333
21013	NC_016914	TAG	2	6	1106416	1106421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018333
21014	NC_016914	GCT	2	6	1106473	1106478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018333
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21016	NC_016914	TTA	2	6	1106579	1106584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018334
21017	NC_016914	CAA	2	6	1106614	1106619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018334
21018	NC_016914	AT	3	6	1106687	1106692	50 %	50 %	0 %	0 %	379018334
21019	NC_016914	AAT	2	6	1106780	1106785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018335
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21024	NC_016914	A	6	6	1107169	1107174	100 %	0 %	0 %	0 %	379018336
21025	NC_016914	AT	3	6	1107186	1107191	50 %	50 %	0 %	0 %	379018336
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21030	NC_016914	TA	5	10	1107305	1107314	50 %	50 %	0 %	0 %	379018336
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21033	NC_016914	AAG	2	6	1107584	1107589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018337
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21037	NC_016914	A	7	7	1107673	1107679	100 %	0 %	0 %	0 %	379018337
21038	NC_016914	TA	3	6	1107701	1107706	50 %	50 %	0 %	0 %	379018337
21039	NC_016914	GTAAT	2	10	1108043	1108052	40 %	40 %	20 %	0 %	379018338
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21044	NC_016914	TGA	2	6	1108227	1108232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018338
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21052	NC_016914	TTAA	2	8	1108654	1108661	50 %	50 %	0 %	0 %	379018338
21053	NC_016914	AAT	2	6	1108732	1108737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018338
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21102	NC_016914	TGG	2	6	1110692	1110697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379018338
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21118	NC_016914	T	7	7	1111353	1111359	0 %	100 %	0 %	0 %	379018338
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21231	NC_016914	TA	3	6	1116851	1116856	50 %	50 %	0 %	0 %	379018341
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