MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 24304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_016914	ATT	2	6	1026961	1026966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018244
19503	NC_016914	T	6	6	1026976	1026981	0 %	100 %	0 %	0 %	379018244
19504	NC_016914	AT	3	6	1026984	1026989	50 %	50 %	0 %	0 %	379018244
19505	NC_016914	TGTT	2	8	1027004	1027011	0 %	75 %	25 %	0 %	379018244
19506	NC_016914	TAC	2	6	1027023	1027028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018244
19507	NC_016914	AGT	2	6	1027074	1027079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018244
19508	NC_016914	GTA	2	6	1027090	1027095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018244
19509	NC_016914	T	6	6	1027104	1027109	0 %	100 %	0 %	0 %	379018244
19510	NC_016914	AT	3	6	1027156	1027161	50 %	50 %	0 %	0 %	379018244
19511	NC_016914	T	6	6	1027161	1027166	0 %	100 %	0 %	0 %	379018244
19512	NC_016914	ATGT	2	8	1027185	1027192	25 %	50 %	25 %	0 %	379018245
19513	NC_016914	TTAA	2	8	1027263	1027270	50 %	50 %	0 %	0 %	379018245
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19515	NC_016914	TAT	2	6	1027417	1027422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018245
19516	NC_016914	T	7	7	1027441	1027447	0 %	100 %	0 %	0 %	379018245
19517	NC_016914	T	6	6	1027476	1027481	0 %	100 %	0 %	0 %	379018245
19518	NC_016914	TAT	2	6	1027564	1027569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018245
19519	NC_016914	TAA	2	6	1027583	1027588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018245
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19521	NC_016914	AAT	2	6	1027603	1027608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018245
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19523	NC_016914	TATT	2	8	1027705	1027712	25 %	75 %	0 %	0 %	379018245
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19525	NC_016914	TTA	2	6	1027767	1027772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018245
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19528	NC_016914	T	6	6	1028678	1028683	0 %	100 %	0 %	0 %	379018246
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19532	NC_016914	CTGC	2	8	1028750	1028757	0 %	25 %	25 %	50 %	379018246
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19537	NC_016914	A	7	7	1028986	1028992	100 %	0 %	0 %	0 %	379018246
19538	NC_016914	AAT	2	6	1028995	1029000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018246
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19541	NC_016914	AT	3	6	1029169	1029174	50 %	50 %	0 %	0 %	379018246
19542	NC_016914	T	6	6	1029194	1029199	0 %	100 %	0 %	0 %	379018246
19543	NC_016914	T	6	6	1029235	1029240	0 %	100 %	0 %	0 %	379018246
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19545	NC_016914	T	7	7	1029284	1029290	0 %	100 %	0 %	0 %	379018246
19546	NC_016914	AATC	2	8	1029322	1029329	50 %	25 %	0 %	25 %	379018246
19547	NC_016914	TAA	2	6	1029456	1029461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018246
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19550	NC_016914	TTTG	2	8	1029758	1029765	0 %	75 %	25 %	0 %	379018246
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19553	NC_016914	TCT	2	6	1029932	1029937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018246
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19558	NC_016914	GCA	3	9	1030112	1030120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018246
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19560	NC_016914	TTTA	2	8	1030165	1030172	25 %	75 %	0 %	0 %	379018246
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19567	NC_016914	ATTT	2	8	1030509	1030516	25 %	75 %	0 %	0 %	379018246
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19589	NC_016914	ATA	2	6	1032054	1032059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018248
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19591	NC_016914	TGA	3	9	1032081	1032089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018248
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19593	NC_016914	A	6	6	1032845	1032850	100 %	0 %	0 %	0 %	379018249
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19601	NC_016914	A	6	6	1033946	1033951	100 %	0 %	0 %	0 %	379018250
19602	NC_016914	TA	3	6	1033952	1033957	50 %	50 %	0 %	0 %	379018250
19603	NC_016914	TCT	2	6	1033962	1033967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018250
19604	NC_016914	A	6	6	1033983	1033988	100 %	0 %	0 %	0 %	379018250
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19606	NC_016914	T	6	6	1034008	1034013	0 %	100 %	0 %	0 %	379018250
19607	NC_016914	TACT	2	8	1036694	1036701	25 %	50 %	0 %	25 %	379018251
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19609	NC_016914	TTAA	2	8	1036724	1036731	50 %	50 %	0 %	0 %	379018251
19610	NC_016914	AT	3	6	1036817	1036822	50 %	50 %	0 %	0 %	379018251
19611	NC_016914	ACT	2	6	1036847	1036852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018251
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