MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 24304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_016914	A	6	6	913424	913429	100 %	0 %	0 %	0 %	379018128
17503	NC_016914	TAA	2	6	913497	913502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018128
17504	NC_016914	GCATTG	2	12	914836	914847	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379018129
17505	NC_016914	CAA	2	6	914872	914877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018129
17506	NC_016914	TAA	2	6	914893	914898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018129
17507	NC_016914	AGC	2	6	914915	914920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018129
17508	NC_016914	ACT	2	6	914940	914945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018129
17509	NC_016914	AAT	2	6	914957	914962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018129
17510	NC_016914	ACT	2	6	915045	915050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018129
17511	NC_016914	CAA	2	6	915076	915081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018129
17512	NC_016914	TTG	2	6	915131	915136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018129
17513	NC_016914	CAA	2	6	915205	915210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018129
17514	NC_016914	AGC	2	6	915236	915241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018129
17515	NC_016914	CCG	2	6	915318	915323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379018129
17516	NC_016914	AGT	2	6	915371	915376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018129
17517	NC_016914	CAA	2	6	915442	915447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018129
17518	NC_016914	TAA	2	6	915538	915543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018129
17519	NC_016914	TTAG	2	8	915552	915559	25 %	50 %	25 %	0 %	379018129
17520	NC_016914	CAT	2	6	915575	915580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018129
17521	NC_016914	TCT	2	6	915587	915592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018129
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17523	NC_016914	AAT	2	6	915692	915697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018129
17524	NC_016914	TAC	2	6	915719	915724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018129
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17526	NC_016914	GATA	2	8	915840	915847	50 %	25 %	25 %	0 %	379018129
17527	NC_016914	CAT	2	6	915860	915865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018129
17528	NC_016914	ACT	2	6	915873	915878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018129
17529	NC_016914	CTT	2	6	915904	915909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018129
17530	NC_016914	CTT	2	6	915925	915930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018129
17531	NC_016914	TCC	2	6	915939	915944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379018129
17532	NC_016914	T	7	7	916030	916036	0 %	100 %	0 %	0 %	379018129
17533	NC_016914	T	6	6	916043	916048	0 %	100 %	0 %	0 %	379018129
17534	NC_016914	TCT	2	6	916053	916058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018129
17535	NC_016914	ACT	2	6	916059	916064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018129
17536	NC_016914	CTA	2	6	916120	916125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018129
17537	NC_016914	TTA	2	6	916128	916133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018129
17538	NC_016914	GTA	3	9	916170	916178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018129
17539	NC_016914	AGC	2	6	916208	916213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018129
17540	NC_016914	TCGA	2	8	916260	916267	25 %	25 %	25 %	25 %	379018129
17541	NC_016914	TAA	2	6	916423	916428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018129
17542	NC_016914	TTG	2	6	916432	916437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018129
17543	NC_016914	TAAT	3	12	916466	916477	50 %	50 %	0 %	0 %	379018130
17544	NC_016914	CTTT	2	8	916494	916501	0 %	75 %	0 %	25 %	379018130
17545	NC_016914	AATTTC	2	12	916526	916537	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379018130
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17548	NC_016914	AAT	3	9	916676	916684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018130
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17550	NC_016914	CTT	2	6	916702	916707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018130
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17553	NC_016914	ATC	2	6	918041	918046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018132
17554	NC_016914	AAT	2	6	920006	920011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018133
17555	NC_016914	TCT	2	6	920153	920158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018133
17556	NC_016914	AAT	2	6	920160	920165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018133
17557	NC_016914	TCACC	2	10	920178	920187	20 %	20 %	0 %	60 %	379018133
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17560	NC_016914	TCA	2	6	920256	920261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018133
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17565	NC_016914	CCTA	2	8	920404	920411	25 %	25 %	0 %	50 %	379018133
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17569	NC_016914	ACATG	2	10	920577	920586	40 %	20 %	20 %	20 %	379018133
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17616	NC_016914	ATTA	2	8	922797	922804	50 %	50 %	0 %	0 %	379018136
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