MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 24304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_016914	GCA	2	6	659908	659913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017850
13003	NC_016914	CAG	2	6	659950	659955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017850
13004	NC_016914	GCG	2	6	659980	659985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379017850
13005	NC_016914	AAT	2	6	659993	659998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017850
13006	NC_016914	ATA	2	6	660034	660039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017850
13007	NC_016914	TTA	2	6	660040	660045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017850
13008	NC_016914	TGA	3	9	660134	660142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017850
13009	NC_016914	TAAG	2	8	660160	660167	50 %	25 %	25 %	0 %	379017850
13010	NC_016914	T	6	6	660186	660191	0 %	100 %	0 %	0 %	379017850
13011	NC_016914	AAG	2	6	660256	660261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017850
13012	NC_016914	A	6	6	660278	660283	100 %	0 %	0 %	0 %	379017850
13013	NC_016914	AT	3	6	660367	660372	50 %	50 %	0 %	0 %	379017850
13014	NC_016914	AAT	2	6	660391	660396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017850
13015	NC_016914	A	6	6	660742	660747	100 %	0 %	0 %	0 %	379017851
13016	NC_016914	AT	3	6	660756	660761	50 %	50 %	0 %	0 %	379017851
13017	NC_016914	TTG	2	6	660767	660772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017851
13018	NC_016914	ATA	2	6	660896	660901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017851
13019	NC_016914	ATC	2	6	660903	660908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017851
13020	NC_016914	TTA	2	6	660920	660925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017851
13021	NC_016914	AGA	2	6	660948	660953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017851
13022	NC_016914	TTTA	2	8	660964	660971	25 %	75 %	0 %	0 %	379017851
13023	NC_016914	ACT	2	6	661167	661172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017852
13024	NC_016914	TCC	2	6	661203	661208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379017852
13025	NC_016914	TAC	2	6	661304	661309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017852
13026	NC_016914	AAG	2	6	661318	661323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017852
13027	NC_016914	A	6	6	661325	661330	100 %	0 %	0 %	0 %	379017852
13028	NC_016914	TTC	2	6	661350	661355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017852
13029	NC_016914	TGA	2	6	661380	661385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017853
13030	NC_016914	TAT	3	9	661469	661477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017853
13031	NC_016914	CTT	2	6	662709	662714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017854
13032	NC_016914	CTT	2	6	662733	662738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017854
13033	NC_016914	AT	3	6	662802	662807	50 %	50 %	0 %	0 %	379017854
13034	NC_016914	TCTT	2	8	662822	662829	0 %	75 %	0 %	25 %	379017854
13035	NC_016914	T	6	6	662942	662947	0 %	100 %	0 %	0 %	379017854
13036	NC_016914	AAG	2	6	662971	662976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017854
13037	NC_016914	ATAA	2	8	662987	662994	75 %	25 %	0 %	0 %	379017854
13038	NC_016914	TTA	2	6	662999	663004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017854
13039	NC_016914	TAACA	2	10	663066	663075	60 %	20 %	0 %	20 %	379017854
13040	NC_016914	AAATAT	2	12	663134	663145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017854
13041	NC_016914	TA	3	6	663264	663269	50 %	50 %	0 %	0 %	379017854
13042	NC_016914	CTTC	2	8	663278	663285	0 %	50 %	0 %	50 %	379017854
13043	NC_016914	TAA	2	6	663289	663294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017854
13044	NC_016914	TAA	2	6	663325	663330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017854
13045	NC_016914	AT	3	6	663362	663367	50 %	50 %	0 %	0 %	379017854
13046	NC_016914	A	7	7	663400	663406	100 %	0 %	0 %	0 %	379017854
13047	NC_016914	AGTA	2	8	663460	663467	50 %	25 %	25 %	0 %	379017854
13048	NC_016914	A	6	6	663513	663518	100 %	0 %	0 %	0 %	379017854
13049	NC_016914	AAT	2	6	663617	663622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017854
13050	NC_016914	T	6	6	663625	663630	0 %	100 %	0 %	0 %	379017854
13051	NC_016914	TA	3	6	663696	663701	50 %	50 %	0 %	0 %	379017854
13052	NC_016914	TA	3	6	663720	663725	50 %	50 %	0 %	0 %	379017854
13053	NC_016914	TAC	2	6	663727	663732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017854
13054	NC_016914	ACA	2	6	663753	663758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379017854
13055	NC_016914	TAA	2	6	663814	663819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017854
13056	NC_016914	ATA	2	6	663831	663836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017854
13057	NC_016914	AGC	2	6	663863	663868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017854
13058	NC_016914	AAT	2	6	663873	663878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017854
13059	NC_016914	CTC	2	6	663891	663896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379017854
13060	NC_016914	AGT	2	6	663913	663918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017854
13061	NC_016914	AAT	2	6	663919	663924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017854
13062	NC_016914	ATA	2	6	663963	663968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017854
13063	NC_016914	ATC	2	6	664000	664005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017854
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13065	NC_016914	T	6	6	664085	664090	0 %	100 %	0 %	0 %	379017854
13066	NC_016914	AGG	2	6	664122	664127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379017854
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13068	NC_016914	TGCG	2	8	664150	664157	0 %	25 %	50 %	25 %	379017854
13069	NC_016914	GGAGC	2	10	664253	664262	20 %	0 %	60 %	20 %	379017854
13070	NC_016914	ACA	2	6	664271	664276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379017854
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13073	NC_016914	TGT	2	6	664339	664344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017854
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13080	NC_016914	AATT	2	8	664946	664953	50 %	50 %	0 %	0 %	379017855
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13090	NC_016914	TCT	2	6	665484	665489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017855
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13103	NC_016914	GCA	2	6	666012	666017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017855
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13105	NC_016914	ATG	3	9	666116	666124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017855
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13108	NC_016914	TCT	2	6	666306	666311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017855
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13486	NC_016914	A	7	7	686009	686015	100 %	0 %	0 %	0 %	379017873
13487	NC_016914	GAT	2	6	686021	686026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017873
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13489	NC_016914	A	6	6	686088	686093	100 %	0 %	0 %	0 %	379017873
13490	NC_016914	A	6	6	686122	686127	100 %	0 %	0 %	0 %	379017873
13491	NC_016914	GCG	2	6	686163	686168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379017873
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