MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 24304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_016914	AGC	2	6	354533	354538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017527
7003	NC_016914	AGC	2	6	354686	354691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017527
7004	NC_016914	AGTAG	2	10	354693	354702	40 %	20 %	40 %	0 %	379017527
7005	NC_016914	AGT	2	6	354758	354763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017527
7006	NC_016914	GCA	2	6	354777	354782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017527
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7010	NC_016914	GTA	2	6	354928	354933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017527
7011	NC_016914	TGC	2	6	354980	354985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017527
7012	NC_016914	TGT	2	6	354989	354994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017527
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7014	NC_016914	TGAT	2	8	355021	355028	25 %	50 %	25 %	0 %	379017527
7015	NC_016914	AAT	2	6	355061	355066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017527
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7017	NC_016914	GAA	2	6	355104	355109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017527
7018	NC_016914	T	6	6	355116	355121	0 %	100 %	0 %	0 %	379017527
7019	NC_016914	AAG	2	6	355159	355164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017527
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7021	NC_016914	CCTT	2	8	355217	355224	0 %	50 %	0 %	50 %	379017527
7022	NC_016914	TTA	2	6	355295	355300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017527
7023	NC_016914	CTCG	2	8	355525	355532	0 %	25 %	25 %	50 %	379017528
7024	NC_016914	TA	3	6	355541	355546	50 %	50 %	0 %	0 %	379017528
7025	NC_016914	GTT	2	6	355630	355635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017528
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7027	NC_016914	TCT	2	6	355740	355745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017528
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7033	NC_016914	TTA	2	6	356067	356072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017528
7034	NC_016914	TCA	2	6	356079	356084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017528
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7050	NC_016914	CACGCT	2	12	357124	357135	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379017528
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7054	NC_016914	TTTA	2	8	357436	357443	25 %	75 %	0 %	0 %	379017529
7055	NC_016914	GA	3	6	357492	357497	50 %	0 %	50 %	0 %	379017529
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7491	NC_016914	CTG	2	6	382688	382693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017557
7492	NC_016914	ATT	2	6	382701	382706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017557
7493	NC_016914	AT	3	6	382719	382724	50 %	50 %	0 %	0 %	379017557
7494	NC_016914	CTCTA	2	10	382743	382752	20 %	40 %	0 %	40 %	379017557
7495	NC_016914	GTAATA	2	12	382755	382766	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379017557
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7499	NC_016914	ATC	2	6	382956	382961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017557
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