MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 24304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_016914	AT	3	6	309155	309160	50 %	50 %	0 %	0 %	379017478
6003	NC_016914	TGC	2	6	309171	309176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017478
6004	NC_016914	TAA	3	9	309201	309209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017478
6005	NC_016914	TAA	2	6	309213	309218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017478
6006	NC_016914	ATTAGA	2	12	309246	309257	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379017478
6007	NC_016914	TTG	3	9	309275	309283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017479
6008	NC_016914	TG	3	6	309292	309297	0 %	50 %	50 %	0 %	379017479
6009	NC_016914	TAA	2	6	309389	309394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017479
6010	NC_016914	CTA	2	6	309454	309459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017479
6011	NC_016914	T	8	8	309460	309467	0 %	100 %	0 %	0 %	379017479
6012	NC_016914	CTG	2	6	309496	309501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017479
6013	NC_016914	AAG	2	6	309532	309537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017479
6014	NC_016914	TAA	2	6	309557	309562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017479
6015	NC_016914	T	6	6	309676	309681	0 %	100 %	0 %	0 %	379017479
6016	NC_016914	TAG	2	6	309715	309720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017479
6017	NC_016914	TTA	2	6	309750	309755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017479
6018	NC_016914	AAT	2	6	309776	309781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017479
6019	NC_016914	T	6	6	309824	309829	0 %	100 %	0 %	0 %	379017479
6020	NC_016914	CTT	2	6	309871	309876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017479
6021	NC_016914	AAT	2	6	309921	309926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017480
6022	NC_016914	T	6	6	309926	309931	0 %	100 %	0 %	0 %	379017480
6023	NC_016914	ATT	2	6	309945	309950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017480
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6025	NC_016914	AGT	2	6	310207	310212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017481
6026	NC_016914	TCT	2	6	310319	310324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017481
6027	NC_016914	CATT	2	8	310335	310342	25 %	50 %	0 %	25 %	379017481
6028	NC_016914	ATTA	2	8	310654	310661	50 %	50 %	0 %	0 %	379017482
6029	NC_016914	ATT	2	6	310675	310680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017482
6030	NC_016914	ACTA	2	8	310681	310688	50 %	25 %	0 %	25 %	379017482
6031	NC_016914	GCA	2	6	310697	310702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017482
6032	NC_016914	AAT	2	6	310739	310744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017482
6033	NC_016914	GAG	2	6	310745	310750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379017482
6034	NC_016914	GCT	2	6	310757	310762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017482
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6037	NC_016914	ATA	2	6	310866	310871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017482
6038	NC_016914	A	6	6	310871	310876	100 %	0 %	0 %	0 %	379017482
6039	NC_016914	TGG	2	6	310957	310962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379017482
6040	NC_016914	GCT	2	6	310985	310990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017482
6041	NC_016914	A	6	6	311037	311042	100 %	0 %	0 %	0 %	379017482
6042	NC_016914	TAT	2	6	311043	311048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017482
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6045	NC_016914	GCA	3	9	311213	311221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017482
6046	NC_016914	GCT	2	6	311237	311242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017482
6047	NC_016914	A	7	7	311260	311266	100 %	0 %	0 %	0 %	379017482
6048	NC_016914	TTA	2	6	311274	311279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017482
6049	NC_016914	GCT	2	6	311366	311371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017482
6050	NC_016914	ATT	2	6	311449	311454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017482
6051	NC_016914	AAGT	2	8	311460	311467	50 %	25 %	25 %	0 %	379017482
6052	NC_016914	TAC	2	6	311492	311497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017482
6053	NC_016914	ATA	2	6	311526	311531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017482
6054	NC_016914	ACT	3	9	311540	311548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017482
6055	NC_016914	GAGG	2	8	311576	311583	25 %	0 %	75 %	0 %	379017482
6056	NC_016914	GGGA	2	8	311688	311695	25 %	0 %	75 %	0 %	379017482
6057	NC_016914	AGC	2	6	311701	311706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017482
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6059	NC_016914	TGC	2	6	311743	311748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017482
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6061	NC_016914	GAA	2	6	311960	311965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017482
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6064	NC_016914	GAAGAT	2	12	312117	312128	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379017483
6065	NC_016914	GAA	3	9	312162	312170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017483
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6070	NC_016914	GCTTG	2	10	312321	312330	0 %	40 %	40 %	20 %	379017483
6071	NC_016914	TAG	2	6	312361	312366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017483
6072	NC_016914	GCTA	2	8	312424	312431	25 %	25 %	25 %	25 %	379017484
6073	NC_016914	TTG	2	6	312453	312458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017484
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6082	NC_016914	TAT	2	6	312664	312669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017485
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6086	NC_016914	A	6	6	312812	312817	100 %	0 %	0 %	0 %	379017485
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6092	NC_016914	ACCA	2	8	313262	313269	50 %	0 %	0 %	50 %	379017485
6093	NC_016914	GCC	2	6	313274	313279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379017485
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6102	NC_016914	A	7	7	313637	313643	100 %	0 %	0 %	0 %	379017485
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6107	NC_016914	ATA	2	6	313789	313794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017485
6108	NC_016914	AAT	2	6	313800	313805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017485
6109	NC_016914	TGA	3	9	313865	313873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017485
6110	NC_016914	AT	3	6	313931	313936	50 %	50 %	0 %	0 %	379017485
6111	NC_016914	AAAG	2	8	313949	313956	75 %	0 %	25 %	0 %	379017485
6112	NC_016914	AGA	2	6	313980	313985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017485
6113	NC_016914	AG	3	6	313994	313999	50 %	0 %	50 %	0 %	379017485
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6117	NC_016914	AAGA	2	8	314031	314038	75 %	0 %	25 %	0 %	379017485
6118	NC_016914	ATCT	2	8	314050	314057	25 %	50 %	0 %	25 %	379017485
6119	NC_016914	TGCG	2	8	314116	314123	0 %	25 %	50 %	25 %	379017485
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