MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 24304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016914	TCG	2	6	249920	249925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017413
5002	NC_016914	ATG	2	6	249927	249932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017413
5003	NC_016914	TA	3	6	249977	249982	50 %	50 %	0 %	0 %	379017413
5004	NC_016914	CAG	2	6	250795	250800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017414
5005	NC_016914	A	6	6	250844	250849	100 %	0 %	0 %	0 %	379017414
5006	NC_016914	CAT	2	6	250891	250896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017414
5007	NC_016914	TAT	2	6	250949	250954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017414
5008	NC_016914	CATGG	2	10	250975	250984	20 %	20 %	40 %	20 %	379017414
5009	NC_016914	AGA	2	6	250991	250996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017414
5010	NC_016914	GAT	2	6	251010	251015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017414
5011	NC_016914	AAT	2	6	251045	251050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017414
5012	NC_016914	TCT	2	6	251241	251246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017415
5013	NC_016914	TTTG	2	8	251265	251272	0 %	75 %	25 %	0 %	379017415
5014	NC_016914	ATC	3	9	251282	251290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017415
5015	NC_016914	TTC	2	6	251339	251344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017415
5016	NC_016914	T	7	7	251360	251366	0 %	100 %	0 %	0 %	379017415
5017	NC_016914	TTTTAT	2	12	251480	251491	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	379017415
5018	NC_016914	TG	3	6	251498	251503	0 %	50 %	50 %	0 %	379017415
5019	NC_016914	TAA	2	6	251537	251542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017415
5020	NC_016914	AT	3	6	251709	251714	50 %	50 %	0 %	0 %	379017416
5021	NC_016914	TAA	2	6	251729	251734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017416
5022	NC_016914	TTCT	2	8	251740	251747	0 %	75 %	0 %	25 %	379017416
5023	NC_016914	TA	3	6	251774	251779	50 %	50 %	0 %	0 %	379017416
5024	NC_016914	AAT	2	6	251797	251802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017416
5025	NC_016914	ATC	2	6	251858	251863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017416
5026	NC_016914	TAAAG	2	10	251910	251919	60 %	20 %	20 %	0 %	379017416
5027	NC_016914	CAA	2	6	251927	251932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379017416
5028	NC_016914	CTA	2	6	251942	251947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017416
5029	NC_016914	A	7	7	251951	251957	100 %	0 %	0 %	0 %	379017416
5030	NC_016914	AT	3	6	251976	251981	50 %	50 %	0 %	0 %	379017416
5031	NC_016914	TTAG	2	8	251989	251996	25 %	50 %	25 %	0 %	379017416
5032	NC_016914	AATT	2	8	252002	252009	50 %	50 %	0 %	0 %	379017416
5033	NC_016914	AGC	2	6	252135	252140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017416
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5035	NC_016914	AGTTA	2	10	252185	252194	40 %	40 %	20 %	0 %	379017416
5036	NC_016914	ATTTT	2	10	252199	252208	20 %	80 %	0 %	0 %	379017417
5037	NC_016914	TAGG	2	8	252216	252223	25 %	25 %	50 %	0 %	379017417
5038	NC_016914	TAA	2	6	252234	252239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017417
5039	NC_016914	TA	3	6	252287	252292	50 %	50 %	0 %	0 %	379017417
5040	NC_016914	A	6	6	252294	252299	100 %	0 %	0 %	0 %	379017417
5041	NC_016914	T	7	7	252400	252406	0 %	100 %	0 %	0 %	379017417
5042	NC_016914	AATT	2	8	252417	252424	50 %	50 %	0 %	0 %	379017417
5043	NC_016914	TA	3	6	252485	252490	50 %	50 %	0 %	0 %	379017417
5044	NC_016914	GAA	2	6	252512	252517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017417
5045	NC_016914	T	6	6	252545	252550	0 %	100 %	0 %	0 %	379017417
5046	NC_016914	GAA	2	6	252557	252562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017417
5047	NC_016914	AGC	2	6	252568	252573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017417
5048	NC_016914	ATG	3	9	252588	252596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017417
5049	NC_016914	ATT	2	6	252614	252619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017417
5050	NC_016914	A	7	7	252633	252639	100 %	0 %	0 %	0 %	379017417
5051	NC_016914	TAA	2	6	252640	252645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017417
5052	NC_016914	AAG	2	6	252657	252662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017417
5053	NC_016914	AAAT	3	12	252717	252728	75 %	25 %	0 %	0 %	379017417
5054	NC_016914	AT	3	6	252731	252736	50 %	50 %	0 %	0 %	379017417
5055	NC_016914	ACG	2	6	252744	252749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017417
5056	NC_016914	ACG	2	6	252768	252773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017417
5057	NC_016914	A	7	7	252835	252841	100 %	0 %	0 %	0 %	379017417
5058	NC_016914	AT	3	6	252870	252875	50 %	50 %	0 %	0 %	379017417
5059	NC_016914	A	7	7	252877	252883	100 %	0 %	0 %	0 %	379017417
5060	NC_016914	ATT	2	6	252905	252910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017417
5061	NC_016914	TAA	2	6	252918	252923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017417
5062	NC_016914	ATT	2	6	252927	252932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017417
5063	NC_016914	TA	4	8	252939	252946	50 %	50 %	0 %	0 %	379017417
5064	NC_016914	A	6	6	252961	252966	100 %	0 %	0 %	0 %	379017417
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5069	NC_016914	AT	3	6	253434	253439	50 %	50 %	0 %	0 %	379017418
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5080	NC_016914	ATT	2	6	253687	253692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017418
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5096	NC_016914	T	6	6	254719	254724	0 %	100 %	0 %	0 %	379017420
5097	NC_016914	CTT	2	6	254726	254731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017420
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5099	NC_016914	TAC	2	6	254858	254863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017420
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5101	NC_016914	A	7	7	254909	254915	100 %	0 %	0 %	0 %	379017420
5102	NC_016914	T	6	6	254965	254970	0 %	100 %	0 %	0 %	379017420
5103	NC_016914	GCG	2	6	255001	255006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379017420
5104	NC_016914	TA	3	6	255024	255029	50 %	50 %	0 %	0 %	379017420
5105	NC_016914	TTTA	2	8	255041	255048	25 %	75 %	0 %	0 %	379017420
5106	NC_016914	TAA	2	6	255095	255100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017420
5107	NC_016914	TAC	2	6	255132	255137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017420
5108	NC_016914	TGC	2	6	255168	255173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017420
5109	NC_016914	TGGTT	2	10	255197	255206	0 %	60 %	40 %	0 %	379017420
5110	NC_016914	GTTT	2	8	255219	255226	0 %	75 %	25 %	0 %	379017420
5111	NC_016914	AT	3	6	255227	255232	50 %	50 %	0 %	0 %	379017420
5112	NC_016914	GAA	2	6	255426	255431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017421
5113	NC_016914	ATT	2	6	255461	255466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017421
5114	NC_016914	TAT	3	9	255485	255493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017421
5115	NC_016914	GTA	2	6	255514	255519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017421
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5117	NC_016914	TGT	2	6	255596	255601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017421
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5121	NC_016914	AT	3	6	256189	256194	50 %	50 %	0 %	0 %	379017422
5122	NC_016914	TTTG	2	8	256214	256221	0 %	75 %	25 %	0 %	379017422
5123	NC_016914	AAT	2	6	256305	256310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017422
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5125	NC_016914	TCT	2	6	256379	256384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017422
5126	NC_016914	CTAT	2	8	256421	256428	25 %	50 %	0 %	25 %	379017422
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5147	NC_016914	TGAT	2	8	257232	257239	25 %	50 %	25 %	0 %	379017423
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5187	NC_016914	AT	3	6	262718	262723	50 %	50 %	0 %	0 %	379017428
5188	NC_016914	CTG	2	6	262733	262738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017428
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5238	NC_016914	TA	3	6	268149	268154	50 %	50 %	0 %	0 %	379017434
5239	NC_016914	CAT	2	6	268167	268172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017434
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5242	NC_016914	T	8	8	268212	268219	0 %	100 %	0 %	0 %	379017434
5243	NC_016914	TTTTA	2	10	268240	268249	20 %	80 %	0 %	0 %	379017434
5244	NC_016914	A	6	6	268273	268278	100 %	0 %	0 %	0 %	379017434
5245	NC_016914	TCA	2	6	268280	268285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017434
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5493	NC_016914	GTA	2	6	280273	280278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017445
5494	NC_016914	TGT	2	6	280291	280296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017445
5495	NC_016914	TCT	2	6	280297	280302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017445
5496	NC_016914	AGGGTA	2	12	280360	280371	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	379017445
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5498	NC_016914	AGA	2	6	280497	280502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017445
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5500	NC_016914	TGA	2	6	280559	280564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017445

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