MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 24185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21502	NC_016913	TA	3	6	1119487	1119492	50 %	50 %	0 %	0 %	379017013
21503	NC_016913	TTA	2	6	1119519	1119524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017013
21504	NC_016913	GTACT	2	10	1119565	1119574	20 %	40 %	20 %	20 %	379017013
21505	NC_016913	AT	5	10	1119581	1119590	50 %	50 %	0 %	0 %	379017013
21506	NC_016913	GAA	2	6	1119608	1119613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017013
21507	NC_016913	GA	3	6	1119679	1119684	50 %	0 %	50 %	0 %	379017014
21508	NC_016913	TAG	2	6	1119685	1119690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017014
21509	NC_016913	TAA	3	9	1119706	1119714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017014
21510	NC_016913	ATA	2	6	1119728	1119733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017014
21511	NC_016913	TAA	2	6	1119759	1119764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017014
21512	NC_016913	ATA	2	6	1119767	1119772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017014
21513	NC_016913	GCAA	2	8	1119805	1119812	50 %	0 %	25 %	25 %	379017014
21514	NC_016913	A	7	7	1119823	1119829	100 %	0 %	0 %	0 %	379017014
21515	NC_016913	ATAA	2	8	1119865	1119872	75 %	25 %	0 %	0 %	379017014
21516	NC_016913	A	8	8	1120692	1120699	100 %	0 %	0 %	0 %	379017015
21517	NC_016913	TTC	2	6	1120707	1120712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017015
21518	NC_016913	AGA	2	6	1120723	1120728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017015
21519	NC_016913	GAA	3	9	1120777	1120785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017015
21520	NC_016913	GTT	2	6	1120790	1120795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017015
21521	NC_016913	TAA	2	6	1120833	1120838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017015
21522	NC_016913	GAT	2	6	1120894	1120899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017015
21523	NC_016913	ATTT	2	8	1120907	1120914	25 %	75 %	0 %	0 %	379017015
21524	NC_016913	T	6	6	1120912	1120917	0 %	100 %	0 %	0 %	379017015
21525	NC_016913	GA	3	6	1120920	1120925	50 %	0 %	50 %	0 %	379017015
21526	NC_016913	AT	3	6	1121196	1121201	50 %	50 %	0 %	0 %	379017016
21527	NC_016913	AATT	2	8	1121272	1121279	50 %	50 %	0 %	0 %	379017016
21528	NC_016913	GATA	2	8	1121297	1121304	50 %	25 %	25 %	0 %	379017016
21529	NC_016913	GAT	2	6	1121307	1121312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017016
21530	NC_016913	TGC	2	6	1121313	1121318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017016
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21532	NC_016913	A	6	6	1121452	1121457	100 %	0 %	0 %	0 %	379017016
21533	NC_016913	A	6	6	1121480	1121485	100 %	0 %	0 %	0 %	379017016
21534	NC_016913	AAGA	2	8	1121511	1121518	75 %	0 %	25 %	0 %	379017016
21535	NC_016913	TAA	2	6	1121569	1121574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017016
21536	NC_016913	CTT	3	9	1121580	1121588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017016
21537	NC_016913	ATA	2	6	1121620	1121625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017016
21538	NC_016913	ATG	2	6	1121634	1121639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017016
21539	NC_016913	GCG	2	6	1121722	1121727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379017016
21540	NC_016913	TGC	2	6	1121780	1121785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017016
21541	NC_016913	GCA	2	6	1121787	1121792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017016
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21543	NC_016913	AGGC	2	8	1121855	1121862	25 %	0 %	50 %	25 %	379017016
21544	NC_016913	A	6	6	1121927	1121932	100 %	0 %	0 %	0 %	379017016
21545	NC_016913	ATA	2	6	1121937	1121942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017016
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21547	NC_016913	TA	4	8	1122077	1122084	50 %	50 %	0 %	0 %	379017016
21548	NC_016913	AAT	2	6	1122114	1122119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017016
21549	NC_016913	AT	3	6	1122152	1122157	50 %	50 %	0 %	0 %	379017016
21550	NC_016913	TGAT	2	8	1122166	1122173	25 %	50 %	25 %	0 %	379017016
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21552	NC_016913	GAA	2	6	1122246	1122251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017016
21553	NC_016913	CAA	2	6	1122288	1122293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379017016
21554	NC_016913	AT	3	6	1122348	1122353	50 %	50 %	0 %	0 %	379017016
21555	NC_016913	CTT	2	6	1122370	1122375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017016
21556	NC_016913	TTTCT	2	10	1122443	1122452	0 %	80 %	0 %	20 %	379017016
21557	NC_016913	TGG	2	6	1122774	1122779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379017017
21558	NC_016913	TAT	2	6	1122781	1122786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017017
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21560	NC_016913	GTAA	2	8	1122843	1122850	50 %	25 %	25 %	0 %	379017017
21561	NC_016913	TGC	2	6	1122883	1122888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017017
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21564	NC_016913	ACAT	2	8	1123081	1123088	50 %	25 %	0 %	25 %	379017017
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21568	NC_016913	TTACG	2	10	1123327	1123336	20 %	40 %	20 %	20 %	379017018
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21570	NC_016913	GTTTG	2	10	1123498	1123507	0 %	60 %	40 %	0 %	379017018
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21592	NC_016913	A	6	6	1125460	1125465	100 %	0 %	0 %	0 %	379017020
21593	NC_016913	AAC	2	6	1125475	1125480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379017020
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21595	NC_016913	T	6	6	1125533	1125538	0 %	100 %	0 %	0 %	379017020
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