MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 24185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_016913	TA	4	8	1020237	1020244	50 %	50 %	0 %	0 %	379016918
19503	NC_016913	ATT	2	6	1020289	1020294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016918
19504	NC_016913	ATA	2	6	1020332	1020337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016918
19505	NC_016913	TTA	2	6	1020344	1020349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016918
19506	NC_016913	TTA	2	6	1020401	1020406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016918
19507	NC_016913	TAT	2	6	1020425	1020430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016918
19508	NC_016913	TAC	2	6	1020542	1020547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016918
19509	NC_016913	CTC	2	6	1020579	1020584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379016918
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19511	NC_016913	CAT	2	6	1020719	1020724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016918
19512	NC_016913	CTA	2	6	1020760	1020765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016918
19513	NC_016913	AGC	2	6	1020804	1020809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016918
19514	NC_016913	AGT	2	6	1020813	1020818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016918
19515	NC_016913	T	7	7	1020826	1020832	0 %	100 %	0 %	0 %	379016918
19516	NC_016913	ACCAT	2	10	1020834	1020843	40 %	20 %	0 %	40 %	379016918
19517	NC_016913	TA	3	6	1020888	1020893	50 %	50 %	0 %	0 %	379016918
19518	NC_016913	TTC	2	6	1020993	1020998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016918
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19522	NC_016913	TAA	2	6	1021106	1021111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016918
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19525	NC_016913	CAT	2	6	1021312	1021317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016919
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19613	NC_016913	A	6	6	1025226	1025231	100 %	0 %	0 %	0 %	379016920
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19620	NC_016913	TAC	2	6	1025678	1025683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016920
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20000	NC_016913	TA	3	6	1045417	1045422	50 %	50 %	0 %	0 %	379016940

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