MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 24185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15503	NC_016913	TAA	2	6	818881	818886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016712
15504	NC_016913	CGC	2	6	818896	818901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379016712
15505	NC_016913	ATCTA	2	10	819017	819026	40 %	40 %	0 %	20 %	379016712
15506	NC_016913	GAA	2	6	819027	819032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016712
15507	NC_016913	GAT	2	6	819050	819055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016712
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15509	NC_016913	ATT	2	6	819102	819107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016713
15510	NC_016913	ATT	2	6	819150	819155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016713
15511	NC_016913	ATG	2	6	819180	819185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016713
15512	NC_016913	ATAA	2	8	819201	819208	75 %	25 %	0 %	0 %	379016713
15513	NC_016913	TAA	2	6	819260	819265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016713
15514	NC_016913	ACA	2	6	819282	819287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379016713
15515	NC_016913	ATC	2	6	819398	819403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016713
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15517	NC_016913	AT	3	6	819422	819427	50 %	50 %	0 %	0 %	379016713
15518	NC_016913	A	7	7	819462	819468	100 %	0 %	0 %	0 %	379016713
15519	NC_016913	TAC	2	6	819479	819484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016713
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15521	NC_016913	A	6	6	819577	819582	100 %	0 %	0 %	0 %	379016713
15522	NC_016913	ATAA	2	8	819590	819597	75 %	25 %	0 %	0 %	379016713
15523	NC_016913	CAA	2	6	819653	819658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379016713
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15527	NC_016913	T	6	6	819741	819746	0 %	100 %	0 %	0 %	379016713
15528	NC_016913	TAAAA	2	10	819757	819766	80 %	20 %	0 %	0 %	379016713
15529	NC_016913	AT	3	6	819767	819772	50 %	50 %	0 %	0 %	379016713
15530	NC_016913	AT	4	8	819783	819790	50 %	50 %	0 %	0 %	379016713
15531	NC_016913	ATAA	2	8	819836	819843	75 %	25 %	0 %	0 %	379016713
15532	NC_016913	GGC	2	6	819942	819947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379016713
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15540	NC_016913	ATT	2	6	820542	820547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016714
15541	NC_016913	TAT	2	6	820550	820555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016714
15542	NC_016913	T	6	6	820596	820601	0 %	100 %	0 %	0 %	379016714
15543	NC_016913	CTT	2	6	820607	820612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016714
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15550	NC_016913	TTA	2	6	820835	820840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016714
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15552	NC_016913	AAGA	2	8	820963	820970	75 %	0 %	25 %	0 %	379016714
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15555	NC_016913	CAA	2	6	821117	821122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379016714
15556	NC_016913	TTGCT	2	10	821154	821163	0 %	60 %	20 %	20 %	379016714
15557	NC_016913	CTT	2	6	821165	821170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016714
15558	NC_016913	GCT	2	6	821173	821178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016714
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15569	NC_016913	TCTT	2	8	821712	821719	0 %	75 %	0 %	25 %	379016714
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15604	NC_016913	ATCA	2	8	822966	822973	50 %	25 %	0 %	25 %	379016715
15605	NC_016913	TTAA	2	8	823020	823027	50 %	50 %	0 %	0 %	379016715
15606	NC_016913	TAAGT	2	10	823028	823037	40 %	40 %	20 %	0 %	379016715
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15990	NC_016913	TTC	2	6	840177	840182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016734
15991	NC_016913	T	7	7	840196	840202	0 %	100 %	0 %	0 %	379016734
15992	NC_016913	A	6	6	840220	840225	100 %	0 %	0 %	0 %	379016734
15993	NC_016913	ATTA	2	8	840261	840268	50 %	50 %	0 %	0 %	379016734
15994	NC_016913	TCGC	2	8	840520	840527	0 %	25 %	25 %	50 %	379016735
15995	NC_016913	ATC	2	6	840542	840547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016735
15996	NC_016913	AAC	2	6	840554	840559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379016735
15997	NC_016913	T	6	6	840562	840567	0 %	100 %	0 %	0 %	379016735
15998	NC_016913	AAG	2	6	840631	840636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016735
15999	NC_016913	TTA	2	6	840655	840660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016735
16000	NC_016913	GGA	2	6	840696	840701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379016735

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