MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 24185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_016913	TAT	2	6	619586	619591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016496
11503	NC_016913	GCA	2	6	619687	619692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016496
11504	NC_016913	AAG	2	6	619717	619722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016496
11505	NC_016913	TCG	2	6	619766	619771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016496
11506	NC_016913	TGC	2	6	619795	619800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016496
11507	NC_016913	CAC	2	6	619905	619910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379016496
11508	NC_016913	ACC	2	6	619933	619938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379016496
11509	NC_016913	A	6	6	620170	620175	100 %	0 %	0 %	0 %	379016497
11510	NC_016913	ATA	2	6	620179	620184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016497
11511	NC_016913	GCT	2	6	620230	620235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016497
11512	NC_016913	GAA	2	6	620255	620260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016497
11513	NC_016913	ATT	2	6	620275	620280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016497
11514	NC_016913	CGG	2	6	620286	620291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379016497
11515	NC_016913	TAT	2	6	620300	620305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016497
11516	NC_016913	TTG	2	6	620345	620350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379016497
11517	NC_016913	TGA	2	6	620373	620378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016497
11518	NC_016913	ACAT	2	8	620381	620388	50 %	25 %	0 %	25 %	379016497
11519	NC_016913	GAA	2	6	620437	620442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016497
11520	NC_016913	AAAG	2	8	620469	620476	75 %	0 %	25 %	0 %	379016497
11521	NC_016913	AG	4	8	620481	620488	50 %	0 %	50 %	0 %	379016497
11522	NC_016913	TTA	2	6	620524	620529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016497
11523	NC_016913	TTA	2	6	620552	620557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016497
11524	NC_016913	TAAT	2	8	620585	620592	50 %	50 %	0 %	0 %	379016497
11525	NC_016913	TAA	2	6	620670	620675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016497
11526	NC_016913	TCA	2	6	620703	620708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016497
11527	NC_016913	GCT	2	6	620713	620718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016497
11528	NC_016913	AAC	2	6	620720	620725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379016497
11529	NC_016913	CAG	2	6	620753	620758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016497
11530	NC_016913	CAA	2	6	620786	620791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379016497
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11532	NC_016913	AGTA	2	8	620884	620891	50 %	25 %	25 %	0 %	379016497
11533	NC_016913	CAT	2	6	620907	620912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016498
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11535	NC_016913	CAA	2	6	620960	620965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379016498
11536	NC_016913	TTG	2	6	621106	621111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379016498
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11538	NC_016913	CTG	2	6	621440	621445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016499
11539	NC_016913	ATT	2	6	621446	621451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016499
11540	NC_016913	T	6	6	621453	621458	0 %	100 %	0 %	0 %	379016499
11541	NC_016913	ATA	2	6	621514	621519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016499
11542	NC_016913	TAA	2	6	621525	621530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016499
11543	NC_016913	AGA	2	6	621551	621556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016499
11544	NC_016913	AAATT	2	10	621575	621584	60 %	40 %	0 %	0 %	379016499
11545	NC_016913	ATT	2	6	621592	621597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016499
11546	NC_016913	A	9	9	621618	621626	100 %	0 %	0 %	0 %	379016499
11547	NC_016913	TA	3	6	621637	621642	50 %	50 %	0 %	0 %	379016499
11548	NC_016913	AGA	2	6	621651	621656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016499
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11551	NC_016913	AAG	2	6	621863	621868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016499
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11553	NC_016913	AAG	2	6	621923	621928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016499
11554	NC_016913	ATA	2	6	621931	621936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016499
11555	NC_016913	T	7	7	621992	621998	0 %	100 %	0 %	0 %	379016499
11556	NC_016913	GAA	3	9	622009	622017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016499
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11558	NC_016913	GAA	2	6	622102	622107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016499
11559	NC_016913	TA	3	6	622123	622128	50 %	50 %	0 %	0 %	379016499
11560	NC_016913	TAA	2	6	622137	622142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016499
11561	NC_016913	AGAC	2	8	622143	622150	50 %	0 %	25 %	25 %	379016499
11562	NC_016913	ATA	3	9	622169	622177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016499
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11564	NC_016913	CTA	2	6	622222	622227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016499
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11569	NC_016913	GCA	2	6	622356	622361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016499
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11572	NC_016913	TTTA	2	8	622476	622483	25 %	75 %	0 %	0 %	379016499
11573	NC_016913	ATA	2	6	622496	622501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016499
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11602	NC_016913	CA	3	6	623803	623808	50 %	0 %	0 %	50 %	379016499
11603	NC_016913	AAAT	2	8	623886	623893	75 %	25 %	0 %	0 %	379016499
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11609	NC_016913	TGCT	2	8	624390	624397	0 %	50 %	25 %	25 %	379016500
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11991	NC_016913	ATT	2	6	640991	640996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016515
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