MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 24185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10003	NC_016913	AGT	2	6	538495	538500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016407
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10005	NC_016913	ACTATA	2	12	540574	540585	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379016408
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10008	NC_016913	ATC	2	6	540638	540643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016408
10009	NC_016913	CAT	2	6	540661	540666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016408
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10015	NC_016913	TCT	2	6	540875	540880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016409
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10017	NC_016913	AT	3	6	540954	540959	50 %	50 %	0 %	0 %	379016409
10018	NC_016913	AAC	2	6	541280	541285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379016410
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10021	NC_016913	T	6	6	541389	541394	0 %	100 %	0 %	0 %	379016410
10022	NC_016913	CAT	2	6	541423	541428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016410
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10025	NC_016913	AT	3	6	542495	542500	50 %	50 %	0 %	0 %	379016411
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10030	NC_016913	CCGGT	2	10	542717	542726	0 %	20 %	40 %	40 %	379016412
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10039	NC_016913	GAT	2	6	542962	542967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016412
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10046	NC_016913	T	6	6	543098	543103	0 %	100 %	0 %	0 %	379016412
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10050	NC_016913	CAG	2	6	543242	543247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016412
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10053	NC_016913	ATA	2	6	543380	543385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016412
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10055	NC_016913	T	7	7	543417	543423	0 %	100 %	0 %	0 %	379016412
10056	NC_016913	TAT	2	6	543502	543507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016412
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10095	NC_016913	CT	3	6	545769	545774	0 %	50 %	0 %	50 %	379016414
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10101	NC_016913	TCTT	2	8	546015	546022	0 %	75 %	0 %	25 %	379016415
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10104	NC_016913	T	6	6	546091	546096	0 %	100 %	0 %	0 %	379016415
10105	NC_016913	TTG	2	6	546114	546119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379016415
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10108	NC_016913	TGCA	2	8	546157	546164	25 %	25 %	25 %	25 %	379016415
10109	NC_016913	TAA	2	6	546165	546170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016415
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10113	NC_016913	CCG	2	6	547219	547224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379016417
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10154	NC_016913	T	6	6	550660	550665	0 %	100 %	0 %	0 %	379016422
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10227	NC_016913	T	6	6	553798	553803	0 %	100 %	0 %	0 %	379016424
10228	NC_016913	AAG	2	6	553849	553854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016424
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10239	NC_016913	CTT	2	6	554299	554304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016424
10240	NC_016913	TCT	2	6	554334	554339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016424
10241	NC_016913	TCT	2	6	554343	554348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016424
10242	NC_016913	TCA	2	6	554367	554372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016424
10243	NC_016913	TCC	2	6	554378	554383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379016424
10244	NC_016913	TGC	2	6	554414	554419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016424
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10250	NC_016913	T	8	8	554724	554731	0 %	100 %	0 %	0 %	379016424
10251	NC_016913	ATC	2	6	554738	554743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016424
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10260	NC_016913	T	6	6	555074	555079	0 %	100 %	0 %	0 %	379016425
10261	NC_016913	CTA	2	6	555107	555112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016425
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10263	NC_016913	AGA	2	6	555830	555835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016426
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10270	NC_016913	CTT	2	6	556261	556266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016426
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10331	NC_016913	TAT	2	6	559412	559417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016428
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10349	NC_016913	AT	3	6	560351	560356	50 %	50 %	0 %	0 %	379016428
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10355	NC_016913	TAAG	2	8	560606	560613	50 %	25 %	25 %	0 %	379016428
10356	NC_016913	AT	3	6	560617	560622	50 %	50 %	0 %	0 %	379016428
10357	NC_016913	ATT	2	6	560909	560914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016429
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10482	NC_016913	CTA	2	6	566384	566389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016433
10483	NC_016913	TTA	2	6	566428	566433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016433
10484	NC_016913	CTC	2	6	566496	566501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379016433
10485	NC_016913	T	6	6	566508	566513	0 %	100 %	0 %	0 %	379016433
10486	NC_016913	TTGC	2	8	566588	566595	0 %	50 %	25 %	25 %	379016433
10487	NC_016913	GAGT	2	8	566608	566615	25 %	25 %	50 %	0 %	379016433
10488	NC_016913	ATTT	2	8	566649	566656	25 %	75 %	0 %	0 %	379016433
10489	NC_016913	TAC	2	6	566657	566662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016433
10490	NC_016913	AGT	2	6	566742	566747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016433
10491	NC_016913	CTA	2	6	566831	566836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016433
10492	NC_016913	T	6	6	566841	566846	0 %	100 %	0 %	0 %	379016433
10493	NC_016913	GCT	2	6	566862	566867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016433
10494	NC_016913	TATCA	2	10	566877	566886	40 %	40 %	0 %	20 %	379016433
10495	NC_016913	ATC	2	6	566901	566906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016433
10496	NC_016913	CAAT	2	8	566923	566930	50 %	25 %	0 %	25 %	379016433
10497	NC_016913	AAGATT	2	12	566958	566969	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379016433
10498	NC_016913	ATG	2	6	567038	567043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016433
10499	NC_016913	ATAA	2	8	567140	567147	75 %	25 %	0 %	0 %	379016434
10500	NC_016913	TAT	2	6	567187	567192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016434

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