MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 24295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22502	NC_016911	GTA	2	6	1182994	1182999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724615
22503	NC_016911	TAA	2	6	1183004	1183009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724615
22504	NC_016911	ATTTAA	2	12	1183104	1183115	50 %	50 %	0 %	0 %	378724615
22505	NC_016911	TGCATT	2	12	1183167	1183178	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378724615
22506	NC_016911	GCA	2	6	1183198	1183203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724615
22507	NC_016911	GTA	2	6	1183219	1183224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724615
22508	NC_016911	TAA	2	6	1183229	1183234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724615
22509	NC_016911	GCA	2	6	1183315	1183320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724615
22510	NC_016911	TTA	2	6	1183334	1183339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724615
22511	NC_016911	CCT	2	6	1183342	1183347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378724615
22512	NC_016911	GCA	2	6	1183405	1183410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724615
22513	NC_016911	GCA	2	6	1183480	1183485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724615
22514	NC_016911	ATT	2	6	1183491	1183496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724615
22515	NC_016911	CAA	2	6	1183539	1183544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378724615
22516	NC_016911	AGT	2	6	1183605	1183610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724615
22517	NC_016911	TAA	2	6	1183631	1183636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724615
22518	NC_016911	CAC	2	6	1183670	1183675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378724615
22519	NC_016911	GTAA	2	8	1183677	1183684	50 %	25 %	25 %	0 %	378724615
22520	NC_016911	CAG	2	6	1183709	1183714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724615
22521	NC_016911	ATT	3	9	1183755	1183763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724615
22522	NC_016911	ATT	2	6	1183770	1183775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724615
22523	NC_016911	TGC	2	6	1183782	1183787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724615
22524	NC_016911	ATT	3	9	1183788	1183796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724615
22525	NC_016911	CTA	2	6	1183834	1183839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724615
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22527	NC_016911	TTG	2	6	1183890	1183895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378724615
22528	NC_016911	T	6	6	1183902	1183907	0 %	100 %	0 %	0 %	378724615
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22530	NC_016911	TTG	2	6	1184069	1184074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378724616
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22532	NC_016911	AGGG	2	8	1184128	1184135	25 %	0 %	75 %	0 %	378724616
22533	NC_016911	TA	3	6	1184444	1184449	50 %	50 %	0 %	0 %	378724617
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22536	NC_016911	AAT	2	6	1184726	1184731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724618
22537	NC_016911	TC	3	6	1184733	1184738	0 %	50 %	0 %	50 %	378724618
22538	NC_016911	GGT	2	6	1184756	1184761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378724618
22539	NC_016911	TCT	2	6	1184784	1184789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724618
22540	NC_016911	T	6	6	1184884	1184889	0 %	100 %	0 %	0 %	378724618
22541	NC_016911	TCA	2	6	1184900	1184905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724618
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22543	NC_016911	TCT	2	6	1184939	1184944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724618
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22545	NC_016911	CT	4	8	1184985	1184992	0 %	50 %	0 %	50 %	378724618
22546	NC_016911	ATAA	2	8	1185074	1185081	75 %	25 %	0 %	0 %	378724618
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22549	NC_016911	TGCC	2	8	1185246	1185253	0 %	25 %	25 %	50 %	378724618
22550	NC_016911	TCA	2	6	1185329	1185334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724618
22551	NC_016911	TCA	2	6	1185510	1185515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724618
22552	NC_016911	CAT	2	6	1185612	1185617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724618
22553	NC_016911	ATCA	2	8	1185643	1185650	50 %	25 %	0 %	25 %	378724618
22554	NC_016911	TTC	2	6	1185664	1185669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724618
22555	NC_016911	ATC	2	6	1185698	1185703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724618
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22558	NC_016911	GCT	2	6	1185885	1185890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724618
22559	NC_016911	TTG	2	6	1185942	1185947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378724618
22560	NC_016911	CTA	2	6	1185987	1185992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724618
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22564	NC_016911	ATTA	2	8	1186060	1186067	50 %	50 %	0 %	0 %	378724618
22565	NC_016911	TAA	2	6	1186102	1186107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724618
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22567	NC_016911	TAA	2	6	1186174	1186179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724618
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22587	NC_016911	GCAA	2	8	1186714	1186721	50 %	0 %	25 %	25 %	378724618
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22590	NC_016911	ATAA	2	8	1186770	1186777	75 %	25 %	0 %	0 %	378724618
22591	NC_016911	CTA	2	6	1186791	1186796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724618
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