MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 24295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_016911	TAAT	2	8	1106118	1106125	50 %	50 %	0 %	0 %	378724547
21003	NC_016911	TAG	2	6	1106303	1106308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724548
21004	NC_016911	GCT	2	6	1106360	1106365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724548
21005	NC_016911	GAA	2	6	1106460	1106465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724549
21006	NC_016911	TTA	2	6	1106466	1106471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724549
21007	NC_016911	CAA	2	6	1106501	1106506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378724549
21008	NC_016911	AT	3	6	1106574	1106579	50 %	50 %	0 %	0 %	378724549
21009	NC_016911	AAT	2	6	1106667	1106672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724550
21010	NC_016911	AAGCAA	2	12	1106803	1106814	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	378724550
21011	NC_016911	ATGG	2	8	1106959	1106966	25 %	25 %	50 %	0 %	378724551
21012	NC_016911	ACC	2	6	1107024	1107029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378724551
21013	NC_016911	A	7	7	1107042	1107048	100 %	0 %	0 %	0 %	378724551
21014	NC_016911	A	6	6	1107056	1107061	100 %	0 %	0 %	0 %	378724551
21015	NC_016911	AT	3	6	1107073	1107078	50 %	50 %	0 %	0 %	378724551
21016	NC_016911	A	6	6	1107089	1107094	100 %	0 %	0 %	0 %	378724551
21017	NC_016911	CTA	2	6	1107128	1107133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724551
21018	NC_016911	TACA	2	8	1107143	1107150	50 %	25 %	0 %	25 %	378724551
21019	NC_016911	A	6	6	1107180	1107185	100 %	0 %	0 %	0 %	378724551
21020	NC_016911	TA	5	10	1107192	1107201	50 %	50 %	0 %	0 %	378724551
21021	NC_016911	ATT	2	6	1107414	1107419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724552
21022	NC_016911	AATT	2	8	1107426	1107433	50 %	50 %	0 %	0 %	378724552
21023	NC_016911	AAG	2	6	1107471	1107476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724552
21024	NC_016911	AT	3	6	1107511	1107516	50 %	50 %	0 %	0 %	378724552
21025	NC_016911	ATA	2	6	1107528	1107533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724552
21026	NC_016911	ATA	2	6	1107537	1107542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724552
21027	NC_016911	A	7	7	1107560	1107566	100 %	0 %	0 %	0 %	378724552
21028	NC_016911	TA	3	6	1107588	1107593	50 %	50 %	0 %	0 %	378724552
21029	NC_016911	GTAAT	2	10	1107930	1107939	40 %	40 %	20 %	0 %	378724553
21030	NC_016911	ATT	2	6	1108009	1108014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724553
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21032	NC_016911	TTC	2	6	1108051	1108056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724553
21033	NC_016911	TAT	2	6	1108092	1108097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724553
21034	NC_016911	TGA	2	6	1108114	1108119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724553
21035	NC_016911	TCC	2	6	1108144	1108149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378724553
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21038	NC_016911	T	7	7	1108316	1108322	0 %	100 %	0 %	0 %	378724553
21039	NC_016911	TTA	2	6	1108367	1108372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724553
21040	NC_016911	GAT	2	6	1108434	1108439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724553
21041	NC_016911	ATAA	2	8	1108445	1108452	75 %	25 %	0 %	0 %	378724553
21042	NC_016911	TTAA	2	8	1108541	1108548	50 %	50 %	0 %	0 %	378724553
21043	NC_016911	AAT	2	6	1108619	1108624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724553
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21047	NC_016911	ATATTA	2	12	1108967	1108978	50 %	50 %	0 %	0 %	378724553
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21050	NC_016911	AAAT	2	8	1109020	1109027	75 %	25 %	0 %	0 %	378724553
21051	NC_016911	ATT	2	6	1109041	1109046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724553
21052	NC_016911	CTA	2	6	1109067	1109072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724553
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21054	NC_016911	GCA	2	6	1109135	1109140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724553
21055	NC_016911	TTA	2	6	1109147	1109152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724553
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21067	NC_016911	CCTTTA	2	12	1109585	1109596	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378724553
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21092	NC_016911	TGG	2	6	1110579	1110584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378724553
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21097	NC_016911	A	6	6	1110678	1110683	100 %	0 %	0 %	0 %	378724553
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21102	NC_016911	CAA	2	6	1110834	1110839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378724553
21103	NC_016911	GCA	2	6	1110857	1110862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724553
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21108	NC_016911	T	7	7	1111240	1111246	0 %	100 %	0 %	0 %	378724553
21109	NC_016911	CAAA	2	8	1111297	1111304	75 %	0 %	0 %	25 %	378724553
21110	NC_016911	CTA	2	6	1111335	1111340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724553
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21114	NC_016911	TTTA	2	8	1111831	1111838	25 %	75 %	0 %	0 %	378724554
21115	NC_016911	CAT	2	6	1111878	1111883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724554
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21476	NC_016911	AT	3	6	1128040	1128045	50 %	50 %	0 %	0 %	378724564
21477	NC_016911	CCCT	2	8	1128057	1128064	0 %	25 %	0 %	75 %	378724564
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21481	NC_016911	ATC	2	6	1128270	1128275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724564
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