MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 24295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_016911	ATA	2	6	912636	912641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724342
17503	NC_016911	TTA	2	6	912682	912687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724342
17504	NC_016911	AGC	2	6	912707	912712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724342
17505	NC_016911	TAT	2	6	912758	912763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724342
17506	NC_016911	TA	3	6	912804	912809	50 %	50 %	0 %	0 %	378724342
17507	NC_016911	AAGG	2	8	912867	912874	50 %	0 %	50 %	0 %	378724342
17508	NC_016911	TGAT	2	8	913158	913165	25 %	50 %	25 %	0 %	378724343
17509	NC_016911	ATGCC	2	10	913169	913178	20 %	20 %	20 %	40 %	378724343
17510	NC_016911	TC	3	6	913195	913200	0 %	50 %	0 %	50 %	378724343
17511	NC_016911	AGA	2	6	913232	913237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724343
17512	NC_016911	ATT	2	6	913238	913243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724343
17513	NC_016911	ATGG	2	8	913266	913273	25 %	25 %	50 %	0 %	378724343
17514	NC_016911	A	6	6	913306	913311	100 %	0 %	0 %	0 %	378724343
17515	NC_016911	TAA	2	6	913379	913384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724343
17516	NC_016911	GCATTG	2	12	914718	914729	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378724344
17517	NC_016911	CAA	2	6	914754	914759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378724344
17518	NC_016911	TAA	2	6	914775	914780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724344
17519	NC_016911	AGC	2	6	914797	914802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724344
17520	NC_016911	ACT	2	6	914822	914827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724344
17521	NC_016911	AAT	2	6	914839	914844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724344
17522	NC_016911	ACT	2	6	914927	914932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724344
17523	NC_016911	CAA	2	6	914958	914963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378724344
17524	NC_016911	TTG	2	6	915013	915018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378724344
17525	NC_016911	CAA	2	6	915087	915092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378724344
17526	NC_016911	AGC	2	6	915118	915123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724344
17527	NC_016911	CCG	2	6	915200	915205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378724344
17528	NC_016911	AGT	2	6	915253	915258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724344
17529	NC_016911	CAA	2	6	915324	915329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378724344
17530	NC_016911	TAA	2	6	915420	915425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724344
17531	NC_016911	TTAG	2	8	915434	915441	25 %	50 %	25 %	0 %	378724344
17532	NC_016911	CAT	2	6	915457	915462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724344
17533	NC_016911	TCT	2	6	915469	915474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724344
17534	NC_016911	ACC	2	6	915514	915519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378724344
17535	NC_016911	AAT	2	6	915574	915579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724344
17536	NC_016911	TAC	2	6	915601	915606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724344
17537	NC_016911	T	6	6	915646	915651	0 %	100 %	0 %	0 %	378724344
17538	NC_016911	GATA	2	8	915722	915729	50 %	25 %	25 %	0 %	378724344
17539	NC_016911	CAT	2	6	915742	915747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724344
17540	NC_016911	ACT	2	6	915755	915760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724344
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17542	NC_016911	CTT	2	6	915807	915812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724344
17543	NC_016911	TCC	2	6	915821	915826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378724344
17544	NC_016911	T	7	7	915912	915918	0 %	100 %	0 %	0 %	378724344
17545	NC_016911	T	6	6	915925	915930	0 %	100 %	0 %	0 %	378724344
17546	NC_016911	TCT	2	6	915935	915940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724344
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17550	NC_016911	GTA	3	9	916052	916060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724344
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17552	NC_016911	TCGA	2	8	916142	916149	25 %	25 %	25 %	25 %	378724344
17553	NC_016911	TAA	2	6	916305	916310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724344
17554	NC_016911	TTG	2	6	916314	916319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378724344
17555	NC_016911	TAAT	3	12	916348	916359	50 %	50 %	0 %	0 %	378724345
17556	NC_016911	CTTT	2	8	916376	916383	0 %	75 %	0 %	25 %	378724345
17557	NC_016911	AATTTC	2	12	916408	916419	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	378724345
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17560	NC_016911	AAT	3	9	916558	916566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724345
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17569	NC_016911	TCACC	2	10	920060	920069	20 %	20 %	0 %	60 %	378724348
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17571	NC_016911	CT	3	6	920129	920134	0 %	50 %	0 %	50 %	378724348
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17577	NC_016911	CCTA	2	8	920286	920293	25 %	25 %	0 %	50 %	378724348
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17587	NC_016911	ATA	2	6	920806	920811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724349
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17600	NC_016911	T	6	6	921549	921554	0 %	100 %	0 %	0 %	378724350
17601	NC_016911	CTTA	2	8	921571	921578	25 %	50 %	0 %	25 %	378724350
17602	NC_016911	AAAT	2	8	921623	921630	75 %	25 %	0 %	0 %	378724350
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