MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 24295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_016911	TAT	2	6	659528	659533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724062
13002	NC_016911	TAA	2	6	659564	659569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724063
13003	NC_016911	TAT	2	6	659581	659586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724063
13004	NC_016911	AAT	2	6	659608	659613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724063
13005	NC_016911	AT	3	6	659625	659630	50 %	50 %	0 %	0 %	378724063
13006	NC_016911	A	9	9	659631	659639	100 %	0 %	0 %	0 %	378724063
13007	NC_016911	A	6	6	659674	659679	100 %	0 %	0 %	0 %	378724063
13008	NC_016911	TAC	2	6	659685	659690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724063
13009	NC_016911	ATTTTA	2	12	659710	659721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724063
13010	NC_016911	GCA	2	6	659789	659794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724063
13011	NC_016911	CAG	2	6	659831	659836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724063
13012	NC_016911	GCG	2	6	659861	659866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378724063
13013	NC_016911	AAT	2	6	659874	659879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724063
13014	NC_016911	ATA	2	6	659915	659920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724063
13015	NC_016911	TTA	2	6	659921	659926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724063
13016	NC_016911	TGA	3	9	660015	660023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724063
13017	NC_016911	TAAG	2	8	660041	660048	50 %	25 %	25 %	0 %	378724063
13018	NC_016911	T	6	6	660067	660072	0 %	100 %	0 %	0 %	378724063
13019	NC_016911	AAG	2	6	660137	660142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724063
13020	NC_016911	A	6	6	660159	660164	100 %	0 %	0 %	0 %	378724063
13021	NC_016911	AT	3	6	660248	660253	50 %	50 %	0 %	0 %	378724063
13022	NC_016911	AAT	2	6	660272	660277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724063
13023	NC_016911	A	6	6	660623	660628	100 %	0 %	0 %	0 %	378724064
13024	NC_016911	AT	3	6	660637	660642	50 %	50 %	0 %	0 %	378724064
13025	NC_016911	TTG	2	6	660648	660653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378724064
13026	NC_016911	ATA	2	6	660777	660782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724064
13027	NC_016911	ATC	2	6	660784	660789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724064
13028	NC_016911	TTA	2	6	660801	660806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724064
13029	NC_016911	AGA	2	6	660829	660834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724064
13030	NC_016911	TTTA	2	8	660845	660852	25 %	75 %	0 %	0 %	378724064
13031	NC_016911	ACT	2	6	661048	661053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724065
13032	NC_016911	TCC	2	6	661084	661089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378724065
13033	NC_016911	TAC	2	6	661185	661190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724065
13034	NC_016911	AAG	2	6	661199	661204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724065
13035	NC_016911	A	6	6	661206	661211	100 %	0 %	0 %	0 %	378724065
13036	NC_016911	TTC	2	6	661231	661236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724065
13037	NC_016911	TGA	2	6	661261	661266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724066
13038	NC_016911	TAT	3	9	661350	661358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724066
13039	NC_016911	CTT	2	6	662590	662595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724067
13040	NC_016911	CTT	2	6	662614	662619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724067
13041	NC_016911	AT	3	6	662683	662688	50 %	50 %	0 %	0 %	378724067
13042	NC_016911	TCTT	2	8	662703	662710	0 %	75 %	0 %	25 %	378724067
13043	NC_016911	T	6	6	662823	662828	0 %	100 %	0 %	0 %	378724067
13044	NC_016911	AAG	2	6	662852	662857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724067
13045	NC_016911	ATAA	2	8	662868	662875	75 %	25 %	0 %	0 %	378724067
13046	NC_016911	TTA	2	6	662880	662885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724067
13047	NC_016911	TAACA	2	10	662947	662956	60 %	20 %	0 %	20 %	378724067
13048	NC_016911	AAATAT	2	12	663015	663026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724067
13049	NC_016911	TA	3	6	663145	663150	50 %	50 %	0 %	0 %	378724067
13050	NC_016911	CTTC	2	8	663159	663166	0 %	50 %	0 %	50 %	378724067
13051	NC_016911	TAA	2	6	663170	663175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724067
13052	NC_016911	TAA	2	6	663206	663211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724067
13053	NC_016911	AT	3	6	663243	663248	50 %	50 %	0 %	0 %	378724067
13054	NC_016911	A	7	7	663281	663287	100 %	0 %	0 %	0 %	378724067
13055	NC_016911	AGTA	2	8	663341	663348	50 %	25 %	25 %	0 %	378724067
13056	NC_016911	A	6	6	663394	663399	100 %	0 %	0 %	0 %	378724067
13057	NC_016911	AAT	2	6	663498	663503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724067
13058	NC_016911	T	6	6	663506	663511	0 %	100 %	0 %	0 %	378724067
13059	NC_016911	TA	3	6	663577	663582	50 %	50 %	0 %	0 %	378724067
13060	NC_016911	TA	3	6	663601	663606	50 %	50 %	0 %	0 %	378724067
13061	NC_016911	TAC	2	6	663608	663613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724067
13062	NC_016911	ACA	2	6	663634	663639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378724067
13063	NC_016911	TAA	2	6	663695	663700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724067
13064	NC_016911	ATA	2	6	663712	663717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724067
13065	NC_016911	AGC	2	6	663744	663749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724067
13066	NC_016911	AAT	2	6	663754	663759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724067
13067	NC_016911	CTC	2	6	663772	663777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378724067
13068	NC_016911	AGT	2	6	663794	663799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724067
13069	NC_016911	AAT	2	6	663800	663805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724067
13070	NC_016911	ATA	2	6	663844	663849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724067
13071	NC_016911	ATC	2	6	663881	663886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724067
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13073	NC_016911	T	6	6	663966	663971	0 %	100 %	0 %	0 %	378724067
13074	NC_016911	AGG	2	6	664003	664008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378724067
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13077	NC_016911	GGAGC	2	10	664134	664143	20 %	0 %	60 %	20 %	378724067
13078	NC_016911	ACA	2	6	664152	664157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378724067
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13081	NC_016911	TGT	2	6	664220	664225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378724067
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13088	NC_016911	AATT	2	8	664827	664834	50 %	50 %	0 %	0 %	378724069
13089	NC_016911	CTT	2	6	664844	664849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724069
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13093	NC_016911	GAA	2	6	664904	664909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724069
13094	NC_016911	ATC	2	6	664920	664925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724069
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13103	NC_016911	ATTTT	2	10	665548	665557	20 %	80 %	0 %	0 %	378724069
13104	NC_016911	A	6	6	665562	665567	100 %	0 %	0 %	0 %	378724069
13105	NC_016911	CTA	2	6	665665	665670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724069
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13107	NC_016911	AAG	2	6	665743	665748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724069
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13110	NC_016911	T	6	6	665823	665828	0 %	100 %	0 %	0 %	378724069
13111	NC_016911	GCA	2	6	665893	665898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724069
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13116	NC_016911	TCT	2	6	666187	666192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724069
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13122	NC_016911	AAT	2	6	666393	666398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724069
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13237	NC_016911	AGA	2	6	672218	672223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724074
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