MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 24295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_016911	GAA	2	6	634675	634680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724043
12502	NC_016911	AGTA	2	8	634694	634701	50 %	25 %	25 %	0 %	378724043
12503	NC_016911	GTA	2	6	635047	635052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724044
12504	NC_016911	ATT	2	6	635053	635058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724044
12505	NC_016911	ATC	2	6	635102	635107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724044
12506	NC_016911	TTG	2	6	635157	635162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378724044
12507	NC_016911	ACT	2	6	635533	635538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724045
12508	NC_016911	CAA	2	6	635600	635605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378724045
12509	NC_016911	A	6	6	635604	635609	100 %	0 %	0 %	0 %	378724045
12510	NC_016911	GAA	2	6	635624	635629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724045
12511	NC_016911	CGA	2	6	635641	635646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724045
12512	NC_016911	T	7	7	635710	635716	0 %	100 %	0 %	0 %	378724045
12513	NC_016911	AAT	2	6	635738	635743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724045
12514	NC_016911	ATT	2	6	635757	635762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724045
12515	NC_016911	ATG	2	6	635792	635797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724045
12516	NC_016911	GGTA	2	8	635860	635867	25 %	25 %	50 %	0 %	378724045
12517	NC_016911	GCA	2	6	635932	635937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724045
12518	NC_016911	AGA	2	6	635956	635961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724045
12519	NC_016911	CTT	2	6	636018	636023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724045
12520	NC_016911	TAA	2	6	636052	636057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724045
12521	NC_016911	ATT	2	6	636077	636082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724045
12522	NC_016911	TGA	2	6	636097	636102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724045
12523	NC_016911	ATT	2	6	636122	636127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724045
12524	NC_016911	AT	3	6	636295	636300	50 %	50 %	0 %	0 %	378724045
12525	NC_016911	CGT	2	6	636317	636322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724045
12526	NC_016911	CCTT	2	8	636370	636377	0 %	50 %	0 %	50 %	378724045
12527	NC_016911	TGA	2	6	636382	636387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724045
12528	NC_016911	T	6	6	636416	636421	0 %	100 %	0 %	0 %	378724045
12529	NC_016911	AAC	2	6	636430	636435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378724045
12530	NC_016911	AGC	2	6	636448	636453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724045
12531	NC_016911	GAA	2	6	636470	636475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724045
12532	NC_016911	ATA	2	6	636511	636516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724045
12533	NC_016911	ATA	2	6	636675	636680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724046
12534	NC_016911	TCT	3	9	636713	636721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724046
12535	NC_016911	TAA	2	6	636727	636732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724046
12536	NC_016911	ATC	2	6	636760	636765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378724046
12537	NC_016911	ATTT	2	8	636808	636815	25 %	75 %	0 %	0 %	378724046
12538	NC_016911	AT	3	6	636869	636874	50 %	50 %	0 %	0 %	378724046
12539	NC_016911	CTT	2	6	636899	636904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724046
12540	NC_016911	A	6	6	636905	636910	100 %	0 %	0 %	0 %	378724046
12541	NC_016911	A	7	7	636931	636937	100 %	0 %	0 %	0 %	378724046
12542	NC_016911	GAT	2	6	636944	636949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724046
12543	NC_016911	A	6	6	637070	637075	100 %	0 %	0 %	0 %	378724046
12544	NC_016911	ATAC	2	8	637210	637217	50 %	25 %	0 %	25 %	378724046
12545	NC_016911	TA	3	6	637250	637255	50 %	50 %	0 %	0 %	378724046
12546	NC_016911	TA	3	6	637268	637273	50 %	50 %	0 %	0 %	378724046
12547	NC_016911	GAAAA	2	10	637286	637295	80 %	0 %	20 %	0 %	378724046
12548	NC_016911	TTA	2	6	637298	637303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724046
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12552	NC_016911	ATT	2	6	637505	637510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724046
12553	NC_016911	TAAA	2	8	637521	637528	75 %	25 %	0 %	0 %	378724046
12554	NC_016911	TGA	2	6	637621	637626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724046
12555	NC_016911	T	7	7	637639	637645	0 %	100 %	0 %	0 %	378724046
12556	NC_016911	TAA	3	9	637648	637656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724046
12557	NC_016911	TAT	2	6	637684	637689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724046
12558	NC_016911	ATT	2	6	637796	637801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724046
12559	NC_016911	TAAA	2	8	637809	637816	75 %	25 %	0 %	0 %	378724046
12560	NC_016911	CGC	2	6	637849	637854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378724046
12561	NC_016911	AT	3	6	637884	637889	50 %	50 %	0 %	0 %	378724046
12562	NC_016911	TAG	2	6	637890	637895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724046
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12565	NC_016911	A	6	6	637954	637959	100 %	0 %	0 %	0 %	378724046
12566	NC_016911	ACA	2	6	637975	637980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378724046
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12569	NC_016911	AAT	2	6	638168	638173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724046
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12572	NC_016911	TA	3	6	638250	638255	50 %	50 %	0 %	0 %	378724046
12573	NC_016911	AGA	2	6	638305	638310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378724046
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12587	NC_016911	ATT	2	6	638791	638796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724046
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12589	NC_016911	CAA	2	6	638852	638857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378724046
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12593	NC_016911	ATA	2	6	639195	639200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724046
12594	NC_016911	T	6	6	639208	639213	0 %	100 %	0 %	0 %	378724046
12595	NC_016911	A	6	6	639220	639225	100 %	0 %	0 %	0 %	378724046
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12597	NC_016911	ATTT	2	8	639308	639315	25 %	75 %	0 %	0 %	378724046
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12601	NC_016911	GTA	2	6	639440	639445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378724046
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12603	NC_016911	TA	3	6	641610	641615	50 %	50 %	0 %	0 %	378724047
12604	NC_016911	T	6	6	641628	641633	0 %	100 %	0 %	0 %	378724047
12605	NC_016911	TTC	2	6	641648	641653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724047
12606	NC_016911	T	6	6	641850	641855	0 %	100 %	0 %	0 %	378724047
12607	NC_016911	CTT	2	6	641881	641886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724047
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12609	NC_016911	TA	3	6	641920	641925	50 %	50 %	0 %	0 %	378724047
12610	NC_016911	AAT	2	6	641951	641956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724047
12611	NC_016911	GAAAA	2	10	642001	642010	80 %	0 %	20 %	0 %	378724047
12612	NC_016911	A	6	6	642007	642012	100 %	0 %	0 %	0 %	378724047
12613	NC_016911	AGC	2	6	642086	642091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378724047
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12618	NC_016911	T	6	6	642283	642288	0 %	100 %	0 %	0 %	378724047
12619	NC_016911	TTA	2	6	642310	642315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378724047
12620	NC_016911	TCT	2	6	642324	642329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378724047
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12986	NC_016911	CTG	2	6	659214	659219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378724062
12987	NC_016911	T	8	8	659225	659232	0 %	100 %	0 %	0 %	378724062
12988	NC_016911	AT	3	6	659252	659257	50 %	50 %	0 %	0 %	378724062
12989	NC_016911	T	6	6	659257	659262	0 %	100 %	0 %	0 %	378724062
12990	NC_016911	AT	3	6	659263	659268	50 %	50 %	0 %	0 %	378724062
12991	NC_016911	G	6	6	659287	659292	0 %	0 %	100 %	0 %	378724062
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12993	NC_016911	T	7	7	659325	659331	0 %	100 %	0 %	0 %	378724062
12994	NC_016911	TAAA	2	8	659406	659413	75 %	25 %	0 %	0 %	378724062
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12999	NC_016911	T	7	7	659491	659497	0 %	100 %	0 %	0 %	378724062
13000	NC_016911	TAA	2	6	659519	659524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378724062

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