MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 24295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_016911	TTTA	2	8	553204	553211	25 %	75 %	0 %	0 %	378723953
11002	NC_016911	AGT	3	9	553216	553224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723953
11003	NC_016911	A	7	7	553225	553231	100 %	0 %	0 %	0 %	378723953
11004	NC_016911	AAC	2	6	553260	553265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378723953
11005	NC_016911	TAA	2	6	553302	553307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723953
11006	NC_016911	AGG	2	6	553308	553313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378723953
11007	NC_016911	TCT	2	6	553322	553327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723953
11008	NC_016911	GCA	2	6	553342	553347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723953
11009	NC_016911	TAAA	2	8	553419	553426	75 %	25 %	0 %	0 %	378723953
11010	NC_016911	GAA	2	6	553493	553498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723953
11011	NC_016911	GTA	2	6	553502	553507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723953
11012	NC_016911	TAAA	2	8	553512	553519	75 %	25 %	0 %	0 %	378723953
11013	NC_016911	TCG	2	6	553532	553537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723953
11014	NC_016911	A	6	6	553571	553576	100 %	0 %	0 %	0 %	378723953
11015	NC_016911	ATGCTT	2	12	553614	553625	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378723953
11016	NC_016911	TAA	2	6	553674	553679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723953
11017	NC_016911	CAC	2	6	553715	553720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378723953
11018	NC_016911	AATAT	2	10	553761	553770	60 %	40 %	0 %	0 %	378723953
11019	NC_016911	AAT	2	6	553799	553804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723953
11020	NC_016911	T	7	7	553811	553817	0 %	100 %	0 %	0 %	378723953
11021	NC_016911	CTTA	2	8	553846	553853	25 %	50 %	0 %	25 %	378723953
11022	NC_016911	TTC	2	6	553879	553884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723953
11023	NC_016911	G	6	6	553935	553940	0 %	0 %	100 %	0 %	378723953
11024	NC_016911	TA	3	6	553969	553974	50 %	50 %	0 %	0 %	378723953
11025	NC_016911	A	6	6	554092	554097	100 %	0 %	0 %	0 %	378723953
11026	NC_016911	ATC	2	6	554132	554137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723953
11027	NC_016911	ACA	2	6	554231	554236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378723953
11028	NC_016911	A	6	6	554257	554262	100 %	0 %	0 %	0 %	378723953
11029	NC_016911	A	6	6	554285	554290	100 %	0 %	0 %	0 %	378723953
11030	NC_016911	AGC	2	6	554341	554346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723953
11031	NC_016911	ACT	2	6	554566	554571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723954
11032	NC_016911	A	7	7	554572	554578	100 %	0 %	0 %	0 %	378723954
11033	NC_016911	GTA	2	6	554598	554603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723954
11034	NC_016911	TAA	3	9	554610	554618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723954
11035	NC_016911	ATT	2	6	554627	554632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723954
11036	NC_016911	TGG	2	6	554648	554653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378723954
11037	NC_016911	TAA	2	6	554659	554664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723954
11038	NC_016911	CTT	2	6	554700	554705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723954
11039	NC_016911	TAA	2	6	554790	554795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723954
11040	NC_016911	ATT	2	6	554804	554809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723954
11041	NC_016911	TTAT	2	8	554815	554822	25 %	75 %	0 %	0 %	378723954
11042	NC_016911	ATT	2	6	554823	554828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723954
11043	NC_016911	TGA	2	6	554829	554834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723954
11044	NC_016911	CGG	2	6	554881	554886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378723954
11045	NC_016911	T	6	6	554912	554917	0 %	100 %	0 %	0 %	378723954
11046	NC_016911	ATTTA	2	10	554974	554983	40 %	60 %	0 %	0 %	378723954
11047	NC_016911	TTA	2	6	554994	554999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723954
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11049	NC_016911	TTA	2	6	555028	555033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723954
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11051	NC_016911	GAA	2	6	555053	555058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723954
11052	NC_016911	A	6	6	555105	555110	100 %	0 %	0 %	0 %	378723954
11053	NC_016911	GGT	2	6	555128	555133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378723954
11054	NC_016911	TAT	2	6	555346	555351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723955
11055	NC_016911	ATTA	2	8	555362	555369	50 %	50 %	0 %	0 %	378723955
11056	NC_016911	GTA	2	6	555379	555384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723955
11057	NC_016911	ATT	3	9	555472	555480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723955
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11059	NC_016911	ACAAA	2	10	555762	555771	80 %	0 %	0 %	20 %	378723956
11060	NC_016911	A	6	6	555769	555774	100 %	0 %	0 %	0 %	378723956
11061	NC_016911	ATG	2	6	555835	555840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723956
11062	NC_016911	ATG	2	6	555850	555855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723956
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11064	NC_016911	GAA	2	6	555882	555887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723956
11065	NC_016911	TA	3	6	555889	555894	50 %	50 %	0 %	0 %	378723956
11066	NC_016911	GCT	2	6	555909	555914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723956
11067	NC_016911	TTA	2	6	556035	556040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723956
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11069	NC_016911	TAC	3	9	556097	556105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723956
11070	NC_016911	TAA	2	6	556111	556116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723956
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11075	NC_016911	TAGA	2	8	556297	556304	50 %	25 %	25 %	0 %	378723956
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11078	NC_016911	TAAT	2	8	556378	556385	50 %	50 %	0 %	0 %	378723956
11079	NC_016911	ATT	2	6	556396	556401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723956
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11086	NC_016911	GCA	2	6	556722	556727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723956
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11091	NC_016911	GTA	2	6	556825	556830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723956
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11093	NC_016911	CTG	2	6	556879	556884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723956
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11103	NC_016911	TGG	2	6	557420	557425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378723957
11104	NC_016911	ATA	2	6	557444	557449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723957
11105	NC_016911	TAC	2	6	557491	557496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723957
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11108	NC_016911	TTTA	2	8	557562	557569	25 %	75 %	0 %	0 %	378723957
11109	NC_016911	TAT	3	9	557589	557597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723957
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11111	NC_016911	A	6	6	557612	557617	100 %	0 %	0 %	0 %	378723957
11112	NC_016911	TTA	2	6	557663	557668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723957
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11116	NC_016911	GTT	2	6	557774	557779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723957
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