MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 24295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_016911	GCA	2	6	504162	504167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723901
10002	NC_016911	TTGC	2	8	504172	504179	0 %	50 %	25 %	25 %	378723901
10003	NC_016911	TTA	2	6	504186	504191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723901
10004	NC_016911	ATT	2	6	504219	504224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723901
10005	NC_016911	GTT	2	6	504243	504248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723901
10006	NC_016911	AAT	2	6	504405	504410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723901
10007	NC_016911	ATT	2	6	504414	504419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723901
10008	NC_016911	GAT	2	6	504477	504482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723901
10009	NC_016911	TAA	2	6	504512	504517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723901
10010	NC_016911	TAA	2	6	504524	504529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723901
10011	NC_016911	GCA	2	6	504609	504614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723901
10012	NC_016911	AT	3	6	504701	504706	50 %	50 %	0 %	0 %	378723901
10013	NC_016911	GTTGCT	2	12	504753	504764	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	378723901
10014	NC_016911	GCG	2	6	504775	504780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378723901
10015	NC_016911	AAGA	2	8	504816	504823	75 %	0 %	25 %	0 %	378723901
10016	NC_016911	A	6	6	504874	504879	100 %	0 %	0 %	0 %	378723901
10017	NC_016911	GAA	4	12	504921	504932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723901
10018	NC_016911	ATG	2	6	504951	504956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723901
10019	NC_016911	A	6	6	505019	505024	100 %	0 %	0 %	0 %	378723901
10020	NC_016911	AATG	2	8	505061	505068	50 %	25 %	25 %	0 %	378723901
10021	NC_016911	TTAT	2	8	505103	505110	25 %	75 %	0 %	0 %	378723901
10022	NC_016911	A	6	6	505113	505118	100 %	0 %	0 %	0 %	378723901
10023	NC_016911	TTAT	2	8	505133	505140	25 %	75 %	0 %	0 %	378723901
10024	NC_016911	TGC	2	6	505184	505189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723901
10025	NC_016911	AGA	2	6	505259	505264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723901
10026	NC_016911	ATA	3	9	505333	505341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723901
10027	NC_016911	TTA	2	6	505342	505347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723901
10028	NC_016911	CTT	2	6	505455	505460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723901
10029	NC_016911	TTC	2	6	505481	505486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723901
10030	NC_016911	AGA	2	6	505550	505555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723901
10031	NC_016911	GA	3	6	505591	505596	50 %	0 %	50 %	0 %	378723901
10032	NC_016911	TA	3	6	505636	505641	50 %	50 %	0 %	0 %	378723901
10033	NC_016911	ATTA	2	8	505673	505680	50 %	50 %	0 %	0 %	378723901
10034	NC_016911	GCT	2	6	505698	505703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723901
10035	NC_016911	GTT	2	6	505715	505720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723901
10036	NC_016911	GCA	2	6	505797	505802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723901
10037	NC_016911	TTGC	2	8	505834	505841	0 %	50 %	25 %	25 %	378723901
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10039	NC_016911	AGA	2	6	506476	506481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723903
10040	NC_016911	AGC	3	9	506490	506498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723903
10041	NC_016911	AATC	2	8	506513	506520	50 %	25 %	0 %	25 %	378723903
10042	NC_016911	A	6	6	506524	506529	100 %	0 %	0 %	0 %	378723903
10043	NC_016911	TGC	2	6	506562	506567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723903
10044	NC_016911	CCA	2	6	506612	506617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378723903
10045	NC_016911	A	7	7	506641	506647	100 %	0 %	0 %	0 %	378723903
10046	NC_016911	CAA	2	6	506666	506671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378723903
10047	NC_016911	AGG	2	6	506680	506685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378723903
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10049	NC_016911	AGGAAG	2	12	506755	506766	50 %	0 %	50 %	0 %	378723903
10050	NC_016911	ATT	2	6	506770	506775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723903
10051	NC_016911	TA	4	8	507035	507042	50 %	50 %	0 %	0 %	378723904
10052	NC_016911	TAAT	2	8	507053	507060	50 %	50 %	0 %	0 %	378723904
10053	NC_016911	TTTC	2	8	507110	507117	0 %	75 %	0 %	25 %	378723904
10054	NC_016911	TTTA	2	8	507165	507172	25 %	75 %	0 %	0 %	378723904
10055	NC_016911	T	6	6	507219	507224	0 %	100 %	0 %	0 %	378723904
10056	NC_016911	CTA	2	6	507236	507241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723904
10057	NC_016911	ATA	2	6	507265	507270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723904
10058	NC_016911	TAA	2	6	507279	507284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723904
10059	NC_016911	TTC	2	6	507285	507290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723904
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10061	NC_016911	AT	3	6	507349	507354	50 %	50 %	0 %	0 %	378723904
10062	NC_016911	ATT	2	6	507361	507366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723904
10063	NC_016911	TCT	2	6	507376	507381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723905
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10067	NC_016911	TTA	2	6	507883	507888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723906
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10073	NC_016911	A	6	6	508233	508238	100 %	0 %	0 %	0 %	378723906
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10093	NC_016911	TGT	2	6	508935	508940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723906
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10095	NC_016911	TA	3	6	509253	509258	50 %	50 %	0 %	0 %	378723907
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10105	NC_016911	TTTCT	2	10	509753	509762	0 %	80 %	0 %	20 %	378723908
10106	NC_016911	T	6	6	509774	509779	0 %	100 %	0 %	0 %	378723908
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10491	NC_016911	T	6	6	530635	530640	0 %	100 %	0 %	0 %	378723932
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