MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Arizona chromosome

Total Repeats: 24271

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016909	GCGGTA	2	12	280755	280766	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378722299
5502	NC_016909	GTC	2	6	280802	280807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722299
5503	NC_016909	GAT	2	6	280829	280834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722299
5504	NC_016909	GCG	2	6	280914	280919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378722299
5505	NC_016909	GAT	2	6	280937	280942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722299
5506	NC_016909	GTCT	2	8	280957	280964	0 %	50 %	25 %	25 %	378722299
5507	NC_016909	CTG	2	6	280980	280985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722299
5508	NC_016909	AGA	3	9	280990	280998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722299
5509	NC_016909	TTG	2	6	281906	281911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378722300
5510	NC_016909	ATT	2	6	281927	281932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722300
5511	NC_016909	TAG	2	6	281953	281958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722300
5512	NC_016909	TAT	2	6	281959	281964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722300
5513	NC_016909	TG	3	6	281988	281993	0 %	50 %	50 %	0 %	378722300
5514	NC_016909	ATTGG	2	10	282005	282014	20 %	40 %	40 %	0 %	378722300
5515	NC_016909	TTG	2	6	282053	282058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378722300
5516	NC_016909	TA	3	6	282060	282065	50 %	50 %	0 %	0 %	378722300
5517	NC_016909	TTAT	2	8	282072	282079	25 %	75 %	0 %	0 %	378722300
5518	NC_016909	TGA	2	6	282107	282112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722300
5519	NC_016909	ATT	2	6	282126	282131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722301
5520	NC_016909	TCTT	2	8	282184	282191	0 %	75 %	0 %	25 %	378722301
5521	NC_016909	TTATT	2	10	282194	282203	20 %	80 %	0 %	0 %	378722301
5522	NC_016909	TAGC	2	8	282232	282239	25 %	25 %	25 %	25 %	378722301
5523	NC_016909	ATG	2	6	282249	282254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722301
5524	NC_016909	ATA	2	6	282328	282333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722301
5525	NC_016909	ATA	2	6	282337	282342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722301
5526	NC_016909	CTCG	2	8	282348	282355	0 %	25 %	25 %	50 %	378722301
5527	NC_016909	TTTA	2	8	282460	282467	25 %	75 %	0 %	0 %	378722302
5528	NC_016909	ATT	2	6	282468	282473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722302
5529	NC_016909	AGC	2	6	282508	282513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378722302
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5532	NC_016909	ATG	2	6	282581	282586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722302
5533	NC_016909	GATA	2	8	282670	282677	50 %	25 %	25 %	0 %	378722302
5534	NC_016909	TAA	2	6	282849	282854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722303
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5537	NC_016909	TTA	2	6	283071	283076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722304
5538	NC_016909	TTA	2	6	283105	283110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722304
5539	NC_016909	GTA	2	6	283116	283121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722304
5540	NC_016909	T	8	8	283183	283190	0 %	100 %	0 %	0 %	378722304
5541	NC_016909	TTC	2	6	283292	283297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722305
5542	NC_016909	TTC	2	6	283304	283309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722305
5543	NC_016909	TCT	2	6	283326	283331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722305
5544	NC_016909	CTT	2	6	283339	283344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722305
5545	NC_016909	T	6	6	283349	283354	0 %	100 %	0 %	0 %	378722305
5546	NC_016909	TAA	2	6	283403	283408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722305
5547	NC_016909	T	10	10	283414	283423	0 %	100 %	0 %	0 %	378722305
5548	NC_016909	TTC	2	6	283446	283451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722306
5549	NC_016909	GTT	2	6	283454	283459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378722306
5550	NC_016909	TTC	2	6	283467	283472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722306
5551	NC_016909	ATT	3	9	283489	283497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722306
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5554	NC_016909	GCA	2	6	283839	283844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378722307
5555	NC_016909	AGA	2	6	283964	283969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722307
5556	NC_016909	TGAT	2	8	284149	284156	25 %	50 %	25 %	0 %	378722307
5557	NC_016909	GTA	2	6	284181	284186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722307
5558	NC_016909	ATA	2	6	284212	284217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722307
5559	NC_016909	A	6	6	284270	284275	100 %	0 %	0 %	0 %	378722308
5560	NC_016909	TCA	2	6	284284	284289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722308
5561	NC_016909	ACTTA	2	10	284338	284347	40 %	40 %	0 %	20 %	378722308
5562	NC_016909	ATG	2	6	284418	284423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722308
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5564	NC_016909	TAAT	2	8	284436	284443	50 %	50 %	0 %	0 %	378722308
5565	NC_016909	GTT	2	6	284465	284470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378722308
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5572	NC_016909	AT	3	6	284655	284660	50 %	50 %	0 %	0 %	378722308
5573	NC_016909	TGA	2	6	284661	284666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722308
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5586	NC_016909	A	6	6	285065	285070	100 %	0 %	0 %	0 %	378722308
5587	NC_016909	AGA	2	6	285082	285087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722308
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5593	NC_016909	TAAAAT	2	12	285791	285802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722309
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5595	NC_016909	TAA	2	6	289631	289636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722310
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5603	NC_016909	A	6	6	289924	289929	100 %	0 %	0 %	0 %	378722310
5604	NC_016909	GA	3	6	289932	289937	50 %	0 %	50 %	0 %	378722310
5605	NC_016909	AT	3	6	289953	289958	50 %	50 %	0 %	0 %	378722310
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5612	NC_016909	AT	3	6	290399	290404	50 %	50 %	0 %	0 %	378722311
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5995	NC_016909	AT	3	6	308934	308939	50 %	50 %	0 %	0 %	378722332
5996	NC_016909	TGC	2	6	308950	308955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722332
5997	NC_016909	TAA	3	9	308980	308988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722332
5998	NC_016909	TAA	2	6	308992	308997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722332
5999	NC_016909	ATTAGA	2	12	309025	309036	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	378722332
6000	NC_016909	TTG	3	9	309054	309062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378722333

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