MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Colombia chromosome

Total Repeats: 24405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_016908	GTA	2	6	155753	155758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720824
3003	NC_016908	AGT	2	6	155767	155772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720824
3004	NC_016908	TCG	2	6	155773	155778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720824
3005	NC_016908	TAT	2	6	155789	155794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720824
3006	NC_016908	AG	3	6	155830	155835	50 %	0 %	50 %	0 %	378720824
3007	NC_016908	GCA	2	6	155861	155866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720824
3008	NC_016908	TTTATC	2	12	156099	156110	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	378720825
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3010	NC_016908	CTT	2	6	156191	156196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378720825
3011	NC_016908	TA	3	6	156240	156245	50 %	50 %	0 %	0 %	378720825
3012	NC_016908	TAC	2	6	156267	156272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720825
3013	NC_016908	AAT	2	6	156350	156355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720826
3014	NC_016908	TAA	2	6	156383	156388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720826
3015	NC_016908	GATTTT	2	12	156393	156404	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	378720826
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3017	NC_016908	GTTA	2	8	156420	156427	25 %	50 %	25 %	0 %	378720826
3018	NC_016908	ATT	2	6	156438	156443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720826
3019	NC_016908	TA	4	8	156473	156480	50 %	50 %	0 %	0 %	378720826
3020	NC_016908	AATTT	2	10	156481	156490	40 %	60 %	0 %	0 %	378720826
3021	NC_016908	CGG	2	6	156506	156511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720826
3022	NC_016908	AGGTG	2	10	156587	156596	20 %	20 %	60 %	0 %	378720826
3023	NC_016908	GTA	2	6	156643	156648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720826
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3025	NC_016908	TTAA	2	8	156681	156688	50 %	50 %	0 %	0 %	378720826
3026	NC_016908	TCTT	2	8	156801	156808	0 %	75 %	0 %	25 %	378720826
3027	NC_016908	TTTTGG	2	12	156848	156859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378720826
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3030	NC_016908	GTA	2	6	156987	156992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720826
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3032	NC_016908	A	8	8	157032	157039	100 %	0 %	0 %	0 %	378720826
3033	NC_016908	T	6	6	157176	157181	0 %	100 %	0 %	0 %	378720826
3034	NC_016908	ATA	2	6	157185	157190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720826
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3044	NC_016908	TTGC	3	12	157765	157776	0 %	50 %	25 %	25 %	378720827
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3053	NC_016908	AGT	2	6	158089	158094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720827
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3055	NC_016908	ATTG	2	8	158236	158243	25 %	50 %	25 %	0 %	378720827
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3062	NC_016908	CATG	2	8	158461	158468	25 %	25 %	25 %	25 %	378720827
3063	NC_016908	ATG	2	6	158525	158530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720827
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3118	NC_016908	AT	3	6	160996	161001	50 %	50 %	0 %	0 %	378720830
3119	NC_016908	GAC	2	6	161042	161047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720830
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3122	NC_016908	AGAA	2	8	161115	161122	75 %	0 %	25 %	0 %	378720830
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