MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Colombia chromosome

Total Repeats: 24405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_016908	TATC	2	8	828934	828941	25 %	50 %	0 %	25 %	378721556
16003	NC_016908	GCC	2	6	828980	828985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378721556
16004	NC_016908	CTT	2	6	829001	829006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378721556
16005	NC_016908	TTC	2	6	829007	829012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378721556
16006	NC_016908	ATA	2	6	829104	829109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378721556
16007	NC_016908	ACCT	2	8	829156	829163	25 %	25 %	0 %	50 %	378721556
16008	NC_016908	AAT	2	6	829172	829177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378721556
16009	NC_016908	TTTA	2	8	829232	829239	25 %	75 %	0 %	0 %	378721556
16010	NC_016908	TTC	2	6	829253	829258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378721556
16011	NC_016908	CAT	2	6	829336	829341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378721556
16012	NC_016908	T	6	6	829349	829354	0 %	100 %	0 %	0 %	378721556
16013	NC_016908	TCA	2	6	829371	829376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378721556
16014	NC_016908	TAT	2	6	829396	829401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378721556
16015	NC_016908	TA	4	8	829429	829436	50 %	50 %	0 %	0 %	378721556
16016	NC_016908	AAT	2	6	829504	829509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378721556
16017	NC_016908	TCA	2	6	829632	829637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378721556
16018	NC_016908	AAT	2	6	829666	829671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378721556
16019	NC_016908	GAT	2	6	829985	829990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378721556
16020	NC_016908	AAT	2	6	830050	830055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378721556
16021	NC_016908	ATT	2	6	830069	830074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378721556
16022	NC_016908	GGC	2	6	830102	830107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378721556
16023	NC_016908	TCA	2	6	830118	830123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378721556
16024	NC_016908	CAA	2	6	830134	830139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378721556
16025	NC_016908	A	6	6	830160	830165	100 %	0 %	0 %	0 %	378721556
16026	NC_016908	GCA	2	6	830184	830189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378721556
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16028	NC_016908	GCT	2	6	830385	830390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378721556
16029	NC_016908	TTC	2	6	830475	830480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378721556
16030	NC_016908	CTC	2	6	830483	830488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378721556
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16032	NC_016908	T	7	7	830585	830591	0 %	100 %	0 %	0 %	378721556
16033	NC_016908	A	6	6	830824	830829	100 %	0 %	0 %	0 %	378721557
16034	NC_016908	TGA	2	6	830994	830999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378721557
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16037	NC_016908	TAA	2	6	831042	831047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378721557
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16040	NC_016908	A	6	6	831123	831128	100 %	0 %	0 %	0 %	378721557
16041	NC_016908	CAA	2	6	831139	831144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378721557
16042	NC_016908	TGA	2	6	831192	831197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378721557
16043	NC_016908	ATA	2	6	831203	831208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378721557
16044	NC_016908	AAG	2	6	831275	831280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378721557
16045	NC_016908	AGA	2	6	831333	831338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378721557
16046	NC_016908	AGCTTC	2	12	831354	831365	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378721557
16047	NC_016908	CGG	2	6	831369	831374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378721557
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16049	NC_016908	AAAG	2	8	831429	831436	75 %	0 %	25 %	0 %	378721557
16050	NC_016908	A	6	6	831514	831519	100 %	0 %	0 %	0 %	378721557
16051	NC_016908	CAA	2	6	831533	831538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378721557
16052	NC_016908	AAG	3	9	831539	831547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378721557
16053	NC_016908	ATA	2	6	831563	831568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378721557
16054	NC_016908	AT	3	6	831594	831599	50 %	50 %	0 %	0 %	378721557
16055	NC_016908	AAGCTA	2	12	831611	831622	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378721557
16056	NC_016908	ACT	2	6	831900	831905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378721558
16057	NC_016908	AC	4	8	831925	831932	50 %	0 %	0 %	50 %	378721558
16058	NC_016908	ATC	2	6	831939	831944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378721558
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16060	NC_016908	GTTT	2	8	831977	831984	0 %	75 %	25 %	0 %	378721558
16061	NC_016908	CTA	2	6	832004	832009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378721558
16062	NC_016908	ATT	2	6	832026	832031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378721558
16063	NC_016908	TAGTA	2	10	832032	832041	40 %	40 %	20 %	0 %	378721558
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16069	NC_016908	T	6	6	832223	832228	0 %	100 %	0 %	0 %	378721558
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16094	NC_016908	TTTA	2	8	833416	833423	25 %	75 %	0 %	0 %	378721560
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16104	NC_016908	TAC	2	6	834186	834191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378721561
16105	NC_016908	ATAA	2	8	834228	834235	75 %	25 %	0 %	0 %	378721561
16106	NC_016908	CAA	2	6	834247	834252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378721561
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16111	NC_016908	AAGC	2	8	834520	834527	50 %	0 %	25 %	25 %	378721561
16112	NC_016908	AAT	2	6	834570	834575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378721561
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16117	NC_016908	TCT	2	6	834666	834671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378721561
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16119	NC_016908	TTA	2	6	834735	834740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378721561
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16490	NC_016908	TCG	2	6	852164	852169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378721580
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