MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Colombia chromosome

Total Repeats: 24405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6003	NC_016908	TCT	2	6	310225	310230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378720982
6004	NC_016908	CATT	2	8	310241	310248	25 %	50 %	0 %	25 %	378720982
6005	NC_016908	ATTA	2	8	310574	310581	50 %	50 %	0 %	0 %	378720983
6006	NC_016908	ATT	2	6	310595	310600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720983
6007	NC_016908	ACTA	2	8	310601	310608	50 %	25 %	0 %	25 %	378720983
6008	NC_016908	GCA	2	6	310617	310622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720983
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6010	NC_016908	GAG	2	6	310665	310670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378720983
6011	NC_016908	GCT	2	6	310677	310682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720983
6012	NC_016908	ACA	2	6	310766	310771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378720983
6013	NC_016908	TAA	2	6	310772	310777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720983
6014	NC_016908	ATA	2	6	310786	310791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720983
6015	NC_016908	A	6	6	310791	310796	100 %	0 %	0 %	0 %	378720983
6016	NC_016908	TGG	2	6	310877	310882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378720983
6017	NC_016908	GCT	2	6	310905	310910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720983
6018	NC_016908	A	6	6	310957	310962	100 %	0 %	0 %	0 %	378720983
6019	NC_016908	TAT	2	6	310963	310968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720983
6020	NC_016908	TAA	2	6	310975	310980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720983
6021	NC_016908	ACA	2	6	311051	311056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378720983
6022	NC_016908	GCA	3	9	311133	311141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720983
6023	NC_016908	GCT	2	6	311157	311162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720983
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6025	NC_016908	TTA	2	6	311194	311199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720983
6026	NC_016908	GCT	2	6	311286	311291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720983
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6028	NC_016908	AAGT	2	8	311380	311387	50 %	25 %	25 %	0 %	378720983
6029	NC_016908	TAC	2	6	311412	311417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720983
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6033	NC_016908	GGGA	2	8	311608	311615	25 %	0 %	75 %	0 %	378720983
6034	NC_016908	AGC	2	6	311621	311626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720983
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6036	NC_016908	TGC	2	6	311663	311668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720983
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6041	NC_016908	GAAGAT	2	12	312037	312048	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	378720984
6042	NC_016908	GAA	3	9	312082	312090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378720984
6043	NC_016908	CTG	2	6	312110	312115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720984
6044	NC_016908	AGGT	2	8	312119	312126	25 %	25 %	50 %	0 %	378720984
6045	NC_016908	ATA	3	9	312173	312181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720984
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6047	NC_016908	GCTTG	2	10	312241	312250	0 %	40 %	40 %	20 %	378720984
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6053	NC_016908	ACC	2	6	312502	312507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378720985
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6055	NC_016908	TAA	2	6	312530	312535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720985
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6057	NC_016908	ATT	2	6	312567	312572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720986
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6059	NC_016908	TAT	2	6	312584	312589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720986
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6062	NC_016908	T	6	6	312718	312723	0 %	100 %	0 %	0 %	378720986
6063	NC_016908	A	6	6	312732	312737	100 %	0 %	0 %	0 %	378720986
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6094	NC_016908	AAGA	2	8	313951	313958	75 %	0 %	25 %	0 %	378720986
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6500	NC_016908	GCA	2	6	332014	332019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378721007

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