MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq201

Total Repeats: 8280

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_016835	CG	3	6	112987	112992	0 %	0 %	50 %	50 %	379704039
2003	NC_016835	CGC	2	6	113158	113163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704039
2004	NC_016835	CGT	2	6	113182	113187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704039
2005	NC_016835	GCC	2	6	113411	113416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704039
2006	NC_016835	CAC	2	6	113423	113428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704039
2007	NC_016835	CGG	2	6	113440	113445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704039
2008	NC_016835	ATT	2	6	113519	113524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704039
2009	NC_016835	CTGC	2	8	113578	113585	0 %	25 %	25 %	50 %	379704039
2010	NC_016835	GCG	2	6	113590	113595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704039
2011	NC_016835	GCA	2	6	113656	113661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704039
2012	NC_016835	GGT	2	6	113735	113740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704039
2013	NC_016835	CA	3	6	113761	113766	50 %	0 %	0 %	50 %	379704039
2014	NC_016835	AACG	2	8	113801	113808	50 %	0 %	25 %	25 %	379704039
2015	NC_016835	AGC	2	6	113814	113819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704039
2016	NC_016835	CGT	2	6	113827	113832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704039
2017	NC_016835	ACC	2	6	113856	113861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704039
2018	NC_016835	GCG	2	6	113940	113945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704040
2019	NC_016835	CG	3	6	114083	114088	0 %	0 %	50 %	50 %	379704040
2020	NC_016835	CGC	2	6	114150	114155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704040
2021	NC_016835	GCAG	2	8	114169	114176	25 %	0 %	50 %	25 %	379704040
2022	NC_016835	TGCG	2	8	114215	114222	0 %	25 %	50 %	25 %	379704040
2023	NC_016835	GCG	2	6	114374	114379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704040
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2025	NC_016835	AGCG	2	8	114477	114484	25 %	0 %	50 %	25 %	379704040
2026	NC_016835	TGG	3	9	114507	114515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704040
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2029	NC_016835	AC	3	6	114735	114740	50 %	0 %	0 %	50 %	379704040
2030	NC_016835	AAG	2	6	114747	114752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704040
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2034	NC_016835	CGC	2	6	115147	115152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704041
2035	NC_016835	T	6	6	115522	115527	0 %	100 %	0 %	0 %	379704041
2036	NC_016835	TGC	2	6	115536	115541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704041
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2038	NC_016835	CGTC	2	8	115655	115662	0 %	25 %	25 %	50 %	379704041
2039	NC_016835	AACGC	2	10	115701	115710	40 %	0 %	20 %	40 %	379704041
2040	NC_016835	GC	3	6	115792	115797	0 %	0 %	50 %	50 %	379704041
2041	NC_016835	ACG	2	6	115802	115807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704041
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2044	NC_016835	GTA	2	6	115961	115966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704041
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2050	NC_016835	GC	3	6	116236	116241	0 %	0 %	50 %	50 %	379704041
2051	NC_016835	GCC	2	6	116257	116262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704041
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2053	NC_016835	TAAAA	2	10	116338	116347	80 %	20 %	0 %	0 %	379704041
2054	NC_016835	ATG	2	6	116536	116541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704042
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2056	NC_016835	ATG	2	6	116614	116619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704042
2057	NC_016835	GCC	2	6	116642	116647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704042
2058	NC_016835	CG	3	6	116714	116719	0 %	0 %	50 %	50 %	379704042
2059	NC_016835	GCG	2	6	116839	116844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704042
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2061	NC_016835	GCC	2	6	116874	116879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704042
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2063	NC_016835	AC	3	6	116932	116937	50 %	0 %	0 %	50 %	379704042
2064	NC_016835	TGCGGT	2	12	117036	117047	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	379704042
2065	NC_016835	CGC	2	6	117053	117058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704042
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2072	NC_016835	TG	3	6	117223	117228	0 %	50 %	50 %	0 %	379704042
2073	NC_016835	AAT	2	6	117238	117243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704042
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2075	NC_016835	TGG	2	6	117374	117379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704042
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2091	NC_016835	GATCA	2	10	118375	118384	40 %	20 %	20 %	20 %	379704043
2092	NC_016835	CTGT	2	8	118537	118544	0 %	50 %	25 %	25 %	379704043
2093	NC_016835	TGA	2	6	118545	118550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704043
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2108	NC_016835	GCT	2	6	119355	119360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704043
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2114	NC_016835	CGGT	2	8	119981	119988	0 %	25 %	50 %	25 %	379704043
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2117	NC_016835	GC	3	6	120120	120125	0 %	0 %	50 %	50 %	379704043
2118	NC_016835	CAT	3	9	120228	120236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704043
2119	NC_016835	CTGTT	2	10	120474	120483	0 %	60 %	20 %	20 %	379704044
2120	NC_016835	T	6	6	120482	120487	0 %	100 %	0 %	0 %	379704044
2121	NC_016835	TCA	2	6	120500	120505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704044
2122	NC_016835	CGCCAT	2	12	120609	120620	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379704044
2123	NC_016835	TTC	2	6	120628	120633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704044
2124	NC_016835	TTC	2	6	120733	120738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704044
2125	NC_016835	AGC	2	6	120753	120758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704044
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2127	NC_016835	A	6	6	120786	120791	100 %	0 %	0 %	0 %	379704044
2128	NC_016835	CCT	2	6	120805	120810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379704044
2129	NC_016835	CAA	2	6	120825	120830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704044
2130	NC_016835	GC	3	6	120843	120848	0 %	0 %	50 %	50 %	379704044
2131	NC_016835	GCC	2	6	120858	120863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704044
2132	NC_016835	TCC	2	6	120913	120918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379704044
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2134	NC_016835	CATT	2	8	121063	121070	25 %	50 %	0 %	25 %	379704044
2135	NC_016835	TAC	2	6	121148	121153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704044
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2137	NC_016835	GCT	2	6	121283	121288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704044
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2139	NC_016835	GCT	2	6	121412	121417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704044
2140	NC_016835	TCG	2	6	121418	121423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704044
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2142	NC_016835	A	6	6	121485	121490	100 %	0 %	0 %	0 %	379704044
2143	NC_016835	TGA	2	6	121579	121584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704044
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2155	NC_016835	CAGC	2	8	122549	122556	25 %	0 %	25 %	50 %	379704046
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2157	NC_016835	AGA	2	6	122614	122619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704046
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2161	NC_016835	A	6	6	122736	122741	100 %	0 %	0 %	0 %	379704046
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2233	NC_016835	TGC	2	6	127190	127195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704050
2234	NC_016835	ATGA	2	8	127237	127244	50 %	25 %	25 %	0 %	379704050
2235	NC_016835	CTG	2	6	127258	127263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704050
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2237	NC_016835	ATC	2	6	127285	127290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704050
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2242	NC_016835	T	6	6	127569	127574	0 %	100 %	0 %	0 %	379704050
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2364	NC_016835	CTT	2	6	134941	134946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704057
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2483	NC_016835	GCT	2	6	146481	146486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704067
2484	NC_016835	ATC	2	6	146541	146546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704067
2485	NC_016835	CCA	2	6	146549	146554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704067
2486	NC_016835	T	6	6	146588	146593	0 %	100 %	0 %	0 %	379704067
2487	NC_016835	GCC	2	6	146594	146599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704067
2488	NC_016835	TCA	2	6	146609	146614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704067
2489	NC_016835	CACCGG	2	12	146712	146723	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379704067
2490	NC_016835	CTC	2	6	146778	146783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379704067
2491	NC_016835	CGG	2	6	146849	146854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704067
2492	NC_016835	GATCT	2	10	146862	146871	20 %	40 %	20 %	20 %	379704067
2493	NC_016835	AAT	2	6	146903	146908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704067
2494	NC_016835	TGC	2	6	146920	146925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704067
2495	NC_016835	CCA	2	6	146938	146943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704067
2496	NC_016835	GAC	2	6	146975	146980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704067
2497	NC_016835	CAGC	2	8	147257	147264	25 %	0 %	25 %	50 %	379704067
2498	NC_016835	TGT	2	6	147355	147360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704067
2499	NC_016835	GGGCA	2	10	147393	147402	20 %	0 %	60 %	20 %	379704067
2500	NC_016835	GTG	2	6	147647	147652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704068

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